[發明專利]利用單管巢式實時聚合酶鏈反應(PCR)的改良結核菌診斷方法有效
| 申請號: | 201210400806.0 | 申請日: | 2012-10-19 |
| 公開(公告)號: | CN103509790A | 公開(公告)日: | 2014-01-15 |
| 發明(設計)人: | 李惠泳 | 申請(專利權)人: | 延世大學校原州產學協力團 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 北京信慧永光知識產權代理有限責任公司 11290 | 代理人: | 張淑珍;王維玉 |
| 地址: | 韓國*** | 國省代碼: | 韓國;KR |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 利用 單管巢式 實時 聚合 反應 pcr 改良 結核菌 診斷 方法 | ||
1.一種引物組,其特征在于,所述引物組由序號1-4,序號6-9及序號12-15的引物構成。
2.一種結核菌檢測試劑盒,其特征在于,所述結核菌檢測試劑盒包括權利要求1中所述的引物組。
3.根據權利要求2所述的結核菌檢測試劑盒,其特征在于,還包括探針。
4.根據權利要求3所述的結核菌檢測試劑盒,其特征在于,所述探針選自由序號5、序號10-11及序號16構成的群。
5.根據權利要求3所述的結核菌檢測試劑盒,其特征在于,所述探針的5'端和3'端標有熒光劑。
6.根據權利要求5所述的結核菌檢測試劑盒,其特征在于,所述5'端標有的熒光劑是選于由6-羧基熒光素、六氯乙烷-6-羧基熒光素、四氯-6-羧基熒光素及花青素5構成的群,所述3'端標有的熒光劑是6-羧甲基-若丹明或BHQ(black?hole?quencher)-1,2,3(BHQ-1,2,3)。
7.根據權利要求2所述的結核菌檢測試劑盒,其特征在于,所述結核菌選于由Mycobacterium?tuberculosis、M.bovis、M.africanum、M.canetii及M.microti構成的群。
8.一種結核菌檢測方法,其特征在于,包括從樣品中抽取DNA,針對所述DNA進行實時定量PCR,將序號1-2、序號6-7及序號12-13的第一引物和序號3-4、序號8-9及序號14-15的第二引物與所述DNA放入同一管內,進行增幅的階段。
9.根據權利要求8所述的結核菌檢測方法,其特征在于,所述管還包括探針。
10.根據權利要求9所述的結核菌檢測方法,其特征在于,所述探針選自由序號5、序號10-11及序號16構成的群。
11.根據權利要求9所述的結核菌檢測方法,其特征在于,所述探針的5'端和3'端標有熒光劑。
12.根據權利要求8所述的結核菌檢測方法,其特征在于,所述結核菌選于由Mycobacterium?tuberculosis、M.bovis、M.africanum、M.canetii及M.microti構成的群。
13.根據權利要求8所述的結核菌檢測方法,其特征在于,所述第一引物及所述第二引物的濃度為10pg。
14.根據權利要求8所述的結核菌檢測方法,其特征在于,所述樣品為咳痰、小便或腫瘤組織。
15.一種定量方法,其特征在于,所述遺傳基因定量方法包括以下階段:
a.在存在于單管的序號1-4、序號6-9及序號12-15的引物組成物中,混合自試料抽取出的菌的DNA,準備遺傳基因分析試料的階段;
b.在所述a階段的遺傳基因分析試料中,進行實時巢式PCR,獲取PCR產物的階段;
c.對所述b階段的PCR產物進行定量,獲取定量曲線的階段;及
d.利用所述定量曲線,對存在自試料抽取的菌的DNA的rpoB及IS6110遺傳基因特異遺傳基因定量的階段。
16.根據權利要求15所述的方法,其特征在于,所述方法還包括選自管內序號5、序號10-11及序號16構成群的探針。
17.一種改善結核菌敏感性及特異性方法,其特征在于,所述改善結核菌敏感性及特異性方法是在利用巢式實時PCR檢測結核菌的方法中,將序號1-2、序號6-7及序號12-13的第一引物和序號3-4、序號8-9及序號14-15的第二引物放入同一管內,進行增幅,對選自Mycobacterium?tuberculosis、M.bovis、M.africanum、M.canetii及M.microti構成群的結核菌的敏感性和特異性進行改善的方法。
18.一種試劑盒的結核菌檢測用途,其特征在于,所述試劑盒的結核菌檢測用途包括由序號1-4、序號6-9及序號12-15的引物構成的引物組。
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