[發(fā)明專利]一種預測前列腺癌易感性的試劑和方法

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201210398711.X
• 申請日: 2012-10-19
• 公開（公告）號: CN103060434A
• 公開（公告）日: 2013-04-24
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 楊澤;趙承孝;劉銘;王建業(yè);史曉紅;魏東;朱小泉;楊帆;張耀光;梁思穎;王飛;唐雷;孫亮
• 申請（專利權(quán)）人: 衛(wèi)生部北京醫(yī)院
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京正理專利代理有限公司 11257
• 代理人: 李欣

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及一種預測前列腺癌易感性的試劑和方法，更具體的說是通過測定與前列腺癌相關(guān)基因RFX6的內(nèi)含子上rs1321366位點多態(tài)性預測受試者對于前列腺癌的易感性，該方法可用于疾病的輔助診斷和新藥開發(fā)，屬于生物技術(shù)領(lǐng)域。

背景技術(shù)

前列腺癌（prostate?cancer,PCa）是發(fā)生在男性生殖系統(tǒng)中最常見的惡性腫瘤。美國在對1975-2006癌癥發(fā)病率進行統(tǒng)計后，估算2010年P(guān)Ca新發(fā)病例為217,730例，位居男性好發(fā)腫瘤中第一位，PCa的死亡人數(shù)估計為32,050，在男性腫瘤死亡率中位居第二（Jemal?A,Siegel?R,Xu?J,Ward?E.Cancer?statistics,2010.CA?Cancer?J?Clin,2011,60(5):277-300.）。年齡是PCa的一個重要風險因素，年齡45歲以下的基本很少發(fā)病，隨年齡的增長而增加。美國癌癥協(xié)會統(tǒng)計，40歲以下的男性PCa發(fā)病率為1/8499，40-59歲男性中為1/38，60-69歲男性中為1/15，70歲以上男性中則為1/8。隨著我們國家人口老齡化，PCa的發(fā)病率在我國正逐年上升，上海標化發(fā)病率從1973～1975年的1.8/10萬上升至1997～1999年的5.5/10萬（劉振偉,項永兵,張薇.上海市區(qū)1973～1999年P(guān)Ca發(fā)病趨勢分析.中國衛(wèi)生統(tǒng)計,2003,20(6):335-337.），貴州省南部地區(qū)部分縣市PCa的發(fā)病率已從1994～1998年的1.72/10萬上升到2004～2008年的4.28/10萬，成為威脅我國男性健康的公共問題（黃桂軍,蘭澤軍,權(quán)新.貴州省南部地區(qū)部分縣市1994～2008年P(guān)Ca發(fā)病趨勢研究.現(xiàn)代預防醫(yī)學,2011,37(116):3012-3017.）。

目前進行PCa遺傳病因研究，多采用大規(guī)模全基因組關(guān)聯(lián)研究和小樣本多人群中的驗證，并且GWAS鑒定的多個PCa易感SNPs已在多個不同人群中被復制確定，證明了SNPs作為基因組標志的關(guān)聯(lián)分析方法在PCa遺傳研究中的有效性。SNPs是指染色體基因組水平上單個核苷酸變異引起的DNA序列多態(tài)性，在人群中的頻率需>1%，SNPs是雙等位基因標記，這種單堿基變化中有70.1%為同型堿基之間的轉(zhuǎn)換：如G/A或T/C，29.1%為發(fā)生在嘌呤和嘧啶之間的顛換。SNPs包含了已知多態(tài)性的80-90%，是最常見的遺傳變異。

由于生存的選擇壓力導致SNP在單一基因和整個基因組中的分布呈不均勻性。SNPs在基因非編碼區(qū)的數(shù)量是編碼區(qū)的4倍，總數(shù)可達3百萬個。SNPs以其密度高（平均每1kb就有1個）、代表性強（位于基因內(nèi)部的SNPs可能直接影響蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)或表達水平）、遺傳穩(wěn)定性好（同微衛(wèi)星多態(tài)性比較而言）、易于自動化分析（因SNPs在人群中為雙等位基因標記，可簡單以“＋/－或1/0”直接分型）等特點成為很好的遺傳標志。

Rfx6（調(diào)節(jié)因子X6）——屬于轉(zhuǎn)錄因子RFX（regulatory?factor?X-box?binding）家族。位于chr15（54166958-54222377），19個外顯子，編碼蛋白長度1281，一個亞型，有B、C和D三個結(jié)構(gòu)域，主要在胰腺表達，與其他同家族RFX比表達水平較低，在胰腺的發(fā)展和功能的調(diào)節(jié)中是關(guān)鍵的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)物。RFX6與RFX2和RFX3直接作用，而后二者在胰腺表達并發(fā)揮作用。

在胰腺中，Rfx6位于促內(nèi)分泌因子Neurog3下游，其他多種胰島轉(zhuǎn)錄因子的上游，在胰島細胞分化中發(fā)揮作用。這兩種基因的突變表現(xiàn)出相似而不同的表型。人類RFX6突變，會引起難治性腹瀉和糖尿病，腸閉鎖和膽道畸形，新生兒糖尿病。對Rfx6的充分理解有助于闡明胰島及β細胞的形成、糖尿病的發(fā)病過程。

DNA-binding蛋白RFX6在新生血色沉著病的病理中發(fā)揮重要作用，血色沉著病HFE基因與前列腺癌的相關(guān)性突出了血色沉著病的病理學與前列腺癌的交互作用。

GPRC6A和RFX6基因附近位點，縮窄到基因RFX6區(qū)域的SNPs與前列腺癌顯著相關(guān)，比最初的GWAS中與前列腺癌的相關(guān)位點GPRC6A/RFX6，RFX6基因變異可能是更優(yōu)先的敏感位點。