[發(fā)明專(zhuān)利]1號(hào)染色體替換野生小家鼠品系C57BL/6.松江3?Chr1的構(gòu)建有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201210382385.3 | 申請(qǐng)日： | 2012-10-10 |
| 公開(kāi)（公告）號(hào)： | CN103725759B | 公開(kāi)（公告）日： | 2017-11-10 |
| 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人： | 趙瑩;肖君華;邢正弘;陳國(guó)強(qiáng);周宇荀;李凱;趙麗亞;晁天柱;柏熊;高捷 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人： | 上海西普爾-必凱實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限公司;東華大學(xué) |
| 主分類(lèi)號(hào)： | C12Q1/68 | 分類(lèi)號(hào)： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 上海專(zhuān)利商標(biāo)事務(wù)所有限公司31100 | 代理人： | 陳靜 |
| 地址： | 201203 上*** | 國(guó)省代碼： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 染色體 替換 野生 小家鼠 品系 c57bl 6. 松江 chr1 構(gòu)建 | ||
1.一種1號(hào)染色體替換實(shí)驗(yàn)小鼠品系C57BL/6.松江3-Chr1的建立方法，其特征在于，所述方法包括：
(1)以松江3品系雄性小鼠作為父本、C57BL/6品系雌性小鼠作為母本進(jìn)行雜交，獲得F1代小鼠；
(2)將F1代雌性小鼠與C57BL/6品系雄性小鼠雜交，獲得回交一代小鼠；該雄性回交小鼠中，Y染色體和線粒體DNA已被替換為C57BL/6品系來(lái)源的；使用多核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)鑒定雄性回交小鼠的1號(hào)染色體，選擇1號(hào)染色體多核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)鑒定結(jié)果為松江3品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；使用短串聯(lián)重復(fù)序列位點(diǎn)鑒定選擇到的雄性回交小鼠，選擇1號(hào)染色體短串聯(lián)重復(fù)序列位點(diǎn)鑒定結(jié)果為松江3品系小鼠所特有的回交小鼠；
(3)將選擇到的1號(hào)染色體短串聯(lián)重復(fù)序列位點(diǎn)鑒定結(jié)果為松江3品系小鼠所特有的回交小鼠中雄性回交小鼠與C57BL/6品系雌性小鼠雜交，獲得下一代回交小鼠，該雄性回交小鼠中，X染色體已被替換為C57BL/6品系來(lái)源的；
(4)使用多核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)鑒定步驟(3)獲得的雄性回交小鼠的1號(hào)染色體，選擇1號(hào)染色體多核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)鑒定結(jié)果為松江3品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；使用短串聯(lián)重復(fù)序列位點(diǎn)鑒定選擇到的雄性回交小鼠，選擇1號(hào)染色體短串聯(lián)重復(fù)序列位點(diǎn)鑒定結(jié)果為松江3品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；
(5)重復(fù)步驟(3)～(4)5-50次；從而獲得染色體替代動(dòng)物品系，其以C57BL/6品系小鼠為背景，且其1號(hào)染色體被松江3品系小鼠的1號(hào)染色體替換；其中，所述的1號(hào)染色體的多核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)包括：
rs31426703，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：12720994；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為C，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為T(mén)；
rs32086848，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：17643006；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A；
rs31928308，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：28659508；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G；
rs32139742，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：40806614；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A；
rs31336640，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：47136503；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A；
rs6297658，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：57382018；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G；
rs6302815，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：69463837；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G；
rs30146639，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：76144374；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A；
rs32011713，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：79917356；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為C，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A；
rs6212353，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：84131501；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為C，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A；
rs32662004，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：98333575；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A；
rs32495825，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：124737843；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A；
rs31580048，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：133446374；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A；
rs30694738，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：142191205；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G；
rs30902647，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：150127783；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為T(mén)，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為C；
rs3678938，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：158391632；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A；
rs30776510，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：168028380；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為T(mén)，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G；
rs32297231，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：183890447；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為G，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為A；
rs32366433，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：188750111；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為C，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為T(mén)；
rs31145145，其在1號(hào)染色體上所處位置為chr1：192018789；在松江3品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為C，在C57BL/6品系小鼠染色體相應(yīng)位置的堿基為T(mén)；
所述的1號(hào)染色體的短串聯(lián)重復(fù)序列位點(diǎn)包括：
D1MIT64，其在1號(hào)染色體上所處位置為3.7cM；在松江3品系小鼠基因組和C57BL/6品系小鼠染色體中，相應(yīng)位置上基因序列長(zhǎng)度差異20bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠少10個(gè)2bp堿基重復(fù)；
D1MIT236，其在1號(hào)染色體上所處位置為25.7cM；在松江3品系小鼠基因組和C57BL/6品系小鼠染色體中，相應(yīng)位置上基因序列長(zhǎng)度差異10bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠少8個(gè)2bp堿基重復(fù)；
D1MIT303，其在1號(hào)染色體上所處位置為32cM；在松江3品系小鼠基因組和C57BL/6品系小鼠染色體中，相應(yīng)位置上基因序列長(zhǎng)度差異20bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠多10個(gè)2bp堿基重復(fù)；
D1MIT49，其在1號(hào)染色體上所處位置為44cM；在松江3品系小鼠基因組和C57BL/6品系小鼠染色體中，相應(yīng)位置上基因序列長(zhǎng)度差異18bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠少9個(gè)2bp堿基重復(fù)；
D1MIT387，其在1號(hào)染色體上所處位置為51.5cM；在松江3品系小鼠基因組和C57BL/6品系小鼠染色體中，相應(yīng)位置上基因序列長(zhǎng)度差異6bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠少3個(gè)2bp堿基重復(fù)；
D1MIT445，其在1號(hào)染色體上所處位置為58cM；在松江3品系小鼠基因組和C57BL/6品系小鼠染色體中，相應(yīng)位置上基因序列長(zhǎng)度差異18bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠多9個(gè)2bp堿基重復(fù)；
D1MIT506，其在1號(hào)染色體上所處位置為71cM；在松江3品系小鼠基因組和C57BL/6品系小鼠染色體中，相應(yīng)位置上基因序列長(zhǎng)度差異18bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠多9個(gè)2bp堿基重復(fù)；
D1MIT113，其在1號(hào)染色體上所處位置為79cM；在松江3品系小鼠基因組和C57BL/6品系小鼠染色體中，相應(yīng)位置上基因序列長(zhǎng)度差異22bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠多11個(gè)2bp堿基重復(fù)；
D1MIT150，其在1號(hào)染色體上所處位置為81cM；在松江3品系小鼠基因組和C57BL/6品系小鼠染色體中，相應(yīng)位置上基因序列長(zhǎng)度差異10bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠多5個(gè)2bp堿基重復(fù)；
D1MIT209，其在1號(hào)染色體上所處位置為96cM；在松江3品系小鼠基因組和C57BL/6品系小鼠染色體中，相應(yīng)位置上基因序列長(zhǎng)度差異6bp，松江3品系小鼠比C57BL/6品系小鼠多3個(gè)2bp堿基重復(fù)。
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