[發(fā)明專利]一種RNA的預(yù)備模板PCR檢測方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201210371539.9 | 申請日: | 2012-09-27 |
| 公開(公告)號: | CN102864233A | 公開(公告)日: | 2013-01-09 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 陳燃;伍迪;金曉錚 | 申請(專利權(quán))人: | 浙江今復(fù)康生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;G01N21/64 |
| 代理公司: | 杭州天正專利事務(wù)所有限公司 33201 | 代理人: | 黃美娟;冷紅梅 |
| 地址: | 310052 浙江省杭州市濱*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 rna 預(yù)備 模板 pcr 檢測 方法 | ||
1.一種RNA的預(yù)備模板PCR檢測方法,所述方法包括:
(1)設(shè)計與目標RNA上任意一段序列互補的長度為25~40mer的單鏈寡核苷酸DNA,記為探針A;探針A的GC含量為40~60%,解鏈溫度為70~85℃;將探針A錨定在PCR管內(nèi),得到錨定PCR管;
(2)設(shè)計部分序列與目標RNA上另一段任意序列互補的單鏈寡核苷酸DNA,其結(jié)構(gòu)為:?兩端是特異的長度為20~30mer的PCR引物序列、中間為與目標RNA互補的長度為25~40mer的序列,記為探針B;探針B?的GC含量為40~60%,解鏈溫度為70~85℃,與探針A和目標RNA的結(jié)合區(qū)域互不重疊;
(3)取待測樣本,加入探針B和含表面活性劑的細胞裂解液,反復(fù)吸打,轉(zhuǎn)移至離心管中,冰上放置20min,4℃離心,取上清液,得到裂解上清液;
(4)取裂解上清液20uL至錨定PCR管中,60~70℃保溫5~15min,吸干管內(nèi)液體,以洗滌液洗滌3~9次,吸干,加入20uL?由PCR緩沖液和PCR引物配制的PCR反應(yīng)液,進行PCR擴增,擴增產(chǎn)物進行熒光定量分析;
(5)以空白裂解液作為陰性對照,按照步驟(1)和(2)方法進行處理和分析,以樣本Ct值小于空白裂解液Ct值判斷為陽性。
2.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于所述裂解液組成如下:1%?SDS,500mmol/L?NaCl,2mmol/L?MgCl2,10mmol/L?2-巰基乙醇,0.1mg/ml?魚精DNA,0.1%?Tween20,1%?脫脂奶粉,溶劑為10mmol/L、pH7.5的Tris-HCl。
3.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于所述PCR緩沖液組成如下:50mmol/L?KCl,1.5mmol/L?MgCl2,0.2mmol/L?dNTP,5%?DMSO,0.05%?Tween20,0.4×SYBR?Green?I,0.5U/20ul?Taq酶,溶劑為10mmol/L、pH9.0的Tris-HCl。
4.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于所述洗滌液為TBST緩沖液。
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