[發明專利]一種牛CSRP3基因單堿基突變的檢測方法無效
申請號: | 201210361163.3 | 申請日: | 2012-09-22 |
公開(公告)號: | CN103305599A | 公開(公告)日: | 2013-09-18 |
發明(設計)人: | 劉小林;賀花;張慧林;楊菁;李志雄;牛富彪 | 申請(專利權)人: | 西北農林科技大學 |
主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
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地址: | 712100 陜*** | 國省代碼: | 陜西;61 |
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摘要: | |||
搜索關鍵詞: | 種牛 csrp3 基因 堿基 突變 檢測 方法 | ||
1.一種牛CSRP3基因單堿基突變的檢測方法,其特征在于,以包含CSRP3基因的待測秦川肉牛和中國荷斯坦奶牛全基因組DNA序列為模板,設計CSRP3基因特異性引物,在PCR反應程序下進行擴增,擴增后的特異性PCR產物經檢測出現目的帶時,直接用限制性內切酶HhaI消化PCR產物,然后再進行瓊脂糖凝膠電泳,電泳結果發現3種不同條帶,分別對應著3種不同基因型,挑取不同帶型送測序驗證,利用生物信息學方法,將測序結果與NCBI公布的序列進行比較,發現該CSRP3基因第2外顯子區域即第14832位發生了A>T突變;
??所述的牛CSRP3基因特異性引物為:
上游引物CSRP3-GSP-F:??5'-?CACAGGTCAGGAATCAAAG?-3'??19bp;
下游引物CSRP3-GSP-R:??5'-?GCAAAGGTCAAACAATAGG?-3'??19bp;
所述的PCR?反應體系為:
總反應體系為15?μL,其中包括2×Reaction?Mix?7.5?μL,ddH2O?6.1?μL,上游引物CSRP3-GSP-F?0.3?μL,下游引物CSRP3-GSP-R?0.3?μL,Golden?DNA?polymerase?0.3?μL,含CSRP3基因序列的DNA模板0.5?μL;
所述的PCR反應程序為:
95℃預變性5?min,94℃變性30?s,60℃退火40?s,72℃延伸40?s,共36個循環,72℃充分延伸10?min,最后16℃保存待用。
2.根據權利要求1所述的檢測牛CSRP3基因單堿基突變的PCR-RFLP方法,其特征在于,所述的瓊脂糖凝膠濃度為3%。
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