[發(fā)明專利]檢測IL28B(rs8099917)和ITPA(rs1127354)的突變的方法

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201210353290.9
• 申請日: 2012-09-14
• 公開（公告）號: CN102994629A
• 公開（公告）日: 2013-03-27
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 黑瀨薰;細(xì)見敏也
• 申請（專利權(quán)）人: 愛科來株式會社
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京東方億思知識產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 11258
• 代理人: 肖善強(qiáng)

1.一種多態(tài)性檢測用探針，其是用于檢測IL28B基因的多態(tài)性的探針，其特征在于包含下述P1或P1’的熒光標(biāo)記寡核苷酸，

(P1)寡核苷酸，其具有包含序列編號1所示的堿基序列中的第301～307位的堿基的堿基長為7～28的堿基序列或與之同源的序列，且與第307位的堿基對應(yīng)的堿基為胞嘧啶并用熒光染料標(biāo)記；

(P1’)寡核苷酸，其具有在嚴(yán)格條件下與包含序列編號1所示的堿基序列中的第301～307位的堿基的堿基長為7～28的堿基序列的互補(bǔ)鏈雜交的序列，且與第307位的堿基對應(yīng)的堿基為胞嘧啶并用熒光染料標(biāo)記。

2.一種多態(tài)性檢測用探針，其是用于檢測TIPA基因的多態(tài)性的探針，其特征在于包含選自下述P2～P3’中的至少一種的熒光標(biāo)記寡核苷酸，

(P2)寡核苷酸，其具有與包含序列編號2所示的堿基序列中的第239～251位的堿基的堿基長為13～28的堿基序列互補(bǔ)的序列或與之同源的序列，且與第239位的堿基互補(bǔ)的堿基為胞嘧啶并用熒光染料標(biāo)記；

(P2’)寡核苷酸，其具有在嚴(yán)格條件下與包含序列編號2所示的堿基序列中的第239～251位的堿基的堿基長為13～28的堿基序列雜交的序列，且與第239位的堿基互補(bǔ)的堿基為胞嘧啶并用熒光染料標(biāo)記；

(P3)寡核苷酸，其具有包含序列編號2所示的堿基序列中的第251～256位的堿基的堿基長為6～42的堿基序列或與之同源的序列，且與第256位的堿基對應(yīng)的堿基為胞嘧啶并用熒光染料標(biāo)記；

(P3’)寡核苷酸，其具有在嚴(yán)格條件下與包含序列編號2所示的堿基序列中的第251～256位的堿基的堿基長為6～42的堿基序列的互補(bǔ)鏈雜交的序列，且與第256位的堿基對應(yīng)的堿基為胞嘧啶并用熒光染料標(biāo)記。

3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的探針，其中，

P1和P1’的寡核苷酸在從3’末端起數(shù)第1位～第3位的位置具有經(jīng)熒光染料標(biāo)記的與第307位堿基對應(yīng)的堿基，

P2和P2’的寡核苷酸在從3’末端起數(shù)第1位～第3位中的任何的位置具有經(jīng)熒光染料標(biāo)記的與第239位堿基互補(bǔ)的堿基，

P3和P3’的寡核苷酸在從3’末端起數(shù)第1位～第3位中的任何的位置具有經(jīng)熒光染料標(biāo)記的與第256位堿基對應(yīng)的堿基。

4.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的探針，其中，

P1和P1’的寡核苷酸在3’末端具有經(jīng)熒光染料標(biāo)記的與第307位堿基對應(yīng)的堿基，

P2和P2’的寡核苷酸在3’末端具有經(jīng)熒光染料標(biāo)記的與第239位堿基互補(bǔ)的堿基，

P3和P3’的寡核苷酸在3’末端具有經(jīng)熒光染料標(biāo)記的與第256位堿基對應(yīng)的堿基。

5.根據(jù)權(quán)利要求1～4中任意一項所述的探針，所述熒光標(biāo)記寡核苷酸在未與靶標(biāo)序列雜交的時候發(fā)出熒光，并且與靶標(biāo)序列雜交的時候熒光強(qiáng)度減少或增加。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的探針，所述熒光標(biāo)記寡核苷酸在未與靶標(biāo)序列雜交的時候發(fā)出熒光，并且在與靶標(biāo)序列雜交的時候熒光強(qiáng)度減少。

7.根據(jù)權(quán)利要求1～6中任意一項所述的探針，其中，

P1和P1’的寡核苷酸的堿基長為7～23，

P2和P2’的寡核苷酸的堿基長為13～23，

P3和P3’的寡核苷酸的堿基長為6～27。

8.根據(jù)權(quán)利要求1～6中任意一項所述的探針，其中，

P1和P1’的寡核苷酸的堿基長為7～18，

P2和P2’的寡核苷酸的堿基長為13～18，

P3和P3’的寡核苷酸的堿基長為6～22。

9.根據(jù)權(quán)利要求1～8中任意一項所述的探針，所述探針是用于熔解曲線分析的探針。

10.一種IL28B基因或ITPA基因中的多態(tài)性的檢測方法，其特征在于使用權(quán)利要求1～9中任意一項所述的探針。