[發明專利]抑制豬源p53基因表達的RNA干擾載體及其制備與應用有效
| 申請號: | 201210349463.X | 申請日: | 2012-09-18 |
| 公開(公告)號: | CN102839180A | 公開(公告)日: | 2012-12-26 |
| 發明(設計)人: | 沈海燕;張建峰;郭鵬舉;張春紅;周恒;朱余軍 | 申請(專利權)人: | 廣東省農業科學院獸醫研究所 |
| 主分類號: | C12N15/113 | 分類號: | C12N15/113;C12N15/85;C12N15/66 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 抑制 p53 基因 表達 rna 干擾 載體 及其 制備 應用 | ||
1.一種干擾豬源p53基因的shRNA的轉錄模板,其特征在于:為SEQ?ID?NO.2和SEQ?ID?NO.3退火雜交形成的雙鏈DNA。
2.一種抑制豬源p53基因表達的RNA干擾載體,其特征在于:包括骨架載體、豬U6?RNA聚合酶Ⅲ啟動子和權利要求1所述的干擾豬源p53基因的shRNA的轉錄模板。
3.根據權利要求2所述的抑制豬源p53基因表達的RNA干擾載體,其特征在于:
所述的骨架載體為pEGFP-C1載體;所述的pEGFP-C1載體的多克隆位點中的BamH?Ⅰ和HindⅢ酶切位點進行了突變;
所述的豬U6RNA聚合酶Ⅲ啟動子取代了pEGFP-C1載體的f1復制起點,在豬U6?RNA聚合酶Ⅲ啟動子后接入了權利要求1所述的干擾豬源p53基因的shRNA的轉錄模板。
4.根據權利要求3所述的抑制豬源p53基因表達的RNA干擾載體,其特征在于:所述的BamH?Ⅰ酶切位點由AAGCTT突變為AAGTTT,所述的HindⅢ酶切位點由GGATCC突變為GGAACC。
5.權利要求4所述的抑制豬源p53基因表達的RNA干擾載體的制備方法,其特征在于包括如下步驟:
(1)突變pEGFP-C1載體多克隆位點中的BamH?Ⅰ和HindⅢ酶切位點,得到BamH?Ⅰ和HindⅢ酶切位點突變的重組載體pEGFP-C1-BH;
(2)PCR擴增得到如SEQ?ID?NO.4所示的Mlu?Ⅰ酶切位點+TAT+Spe?Ⅰ酶切位點+SV40復制起點序列+Stu?Ⅰ酶切位點的DNA片段S;
(3)將步驟(2)得到的片段S和步驟(1)得到的重組載體pEGFP-C1-BH分別用Mlu?Ⅰ和Stu?Ⅰ酶切,將酶切后的片段連接得到重組載體pEGFP-C1-Spe?Ⅰ;
(4)PCR擴增得到如SEQ?ID?NO.5所示的Spe?Ⅰ酶切位點+豬U6?RNA聚合酶Ⅲ啟動子序列+BamH?Ⅰ酶切位點+ATA+Hind?Ⅲ酶切位點+Mlu?Ⅰ酶切位點的DNA片段U6;
(5)將步驟(4)得到的片段U6和步驟(3)得到的重組載體pEGFP-C1-SpeⅠ分別用Spe?Ⅰ和Mlu?Ⅰ酶切,將酶切后的片段連接得到重組載體pEGFP-C1-U6;
(6)將SEQ?ID?NO.2和SEQ?ID?NO.3退火雜交得到干擾豬源p53基因的shRNA的轉錄模板;
(7)將步驟(5)得到的重組載體pEGFP-C1-U6用BamH?Ⅰ和HindⅢ酶切,酶切后的片段與步驟(6)得到的干擾豬源p53基因的shRNA的轉錄模板連接得到抑制豬源p53基因表達的RNA干擾載體。
6.根據權利要求5所述的抑制豬源p53基因表達的RNA干擾載體的制備方法,其特征在于:步驟(1)中所述的突變的方法為:
①以pEGFP-C1載體上1386-1646bp片段為靶片段,設計B1和B2引物突變掉BamH?Ⅰ酶切位點,以pEGFP-C1載體為模板,PCR擴增得到靶片段B;
B1:5’-CCCCGGGAACCCGGATCTAGATAA-3’,
B2:5’-ACGCGTAGATACATTGATGAGTTTGGACAA-3’;
②將①中得到的靶片段B和pEGFP-C1載體分別用Sma?Ⅰ和Mlu?Ⅰ酶切,將酶切后的片段連接得到BamH?Ⅰ酶切位點突變的重組載體pEGFP-C1-B;
③以pEGFP-C1載體上606-1357bp片段為靶片段,設計H1和H2引物突變掉HindⅢ酶切位點,以pEGFP-C1載體為模板,PCR擴增得到靶片段H;
H1:5’-CTAGCTAGCTACCGGTCGCCA-3’,
H2:5’-GGAATTCGAAGTTTTTGAGCTCGA-3’;
④將③中得到的靶片段H和②中得到的重組載體pEGFP-C1-B分別用Nhe?Ⅰ和EcoR?Ⅰ酶切,將酶切后的片段連接得到BamH?Ⅰ和HindⅢ酶切位點突變的重組載體pEGFP-C1-BH。
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