[發明專利]SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法

有效

• 申請號: 201210348358.4
• 申請日: 2012-09-18
• 公開（公告）號: CN103667429A
• 公開（公告）日: 2014-03-26
• 發明（設計）人: 胡曉湘;馮春剛;宋遲;顧曉榮;王彥強;李寧
• 申請（專利權）人: 中國農業大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;A01K67/02
• 代理公司: 北京路浩知識產權代理有限公司 11002
• 代理人: 王朋飛;張慶敏

技術領域

本發明涉及SNP檢測篩選雞的方法，具體涉及SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法。

背景技術

單核苷酸多態性(Single?Nucleotide?Polymorphisms，SNP)，是指在基因組上單個核苷酸的變異，在遺傳物質傳遞過程中可以穩定遺傳給后代，因此可以作為分子標記進行育種和保種。

外貌是雞（Gallus?gallus?domesticus）重要的品種特征之一，在育種和保種中占據了重要地位，目前，對于控制雞外貌特征的分子標記研究仍然較少，僅有少量的外貌特征能夠通過分子標記進行輔助選擇育種。

羽毛是動物最復雜的外皮附屬物之一，具有不同的形狀、大小、花紋、色素沉積等各種方面的表型變異，而且變異可以發生在羽毛發育和分化的每個階段，因此可以作為研究進化和發育的一種理想的模型。羽毛發育的過程中可以形成部分或全部的羽枝結構，構成了不同的羽毛類型。家禽遺傳學家、動物學家和胚胎學家等多個領域的研究者都對決定羽毛形態的影響因素進行了很多研究，但是迄今為止，對于羽毛形態發生相關性狀的突變仍然知之甚少（Lucas,A.M.and?P.R.Stettenheim.Avian?anatomy:integument.1972:U.S.Government?Printing?Office;1st?edition）。絲羽，就是絲狀的羽毛結構，是絲羽烏骨雞等的特征性狀之一。達爾文最早發現絲羽表型相對于正常羽毛來講是隱性遺傳的性狀，后來被證實是單基因遺傳的孟德爾性狀（Dunn,L.C.and?M.A.Jull.On?the?Inheritance?of?some?characters?of?the?Silky?fowl.J?Genet,1927,19:27-63)。絲羽在身體部分的廓羽羽枝中缺少了羽小鉤的結構，因而羽小枝之間不能連接在一起，所以羽毛比較蓬松，不能緊密覆蓋在皮膚上。絲羽的羽小枝結構相對于片羽來講，變得更加細長。

目前，Shh（Sonic?hedgehog）和Bmp2（Bone?morphogenetic?protein2）信號通路之間的互作已被證實和羽枝的形成等有關（Harris,M.P.,S.Williamson,J.F.Fallon,et?al.Molecular?evidence?for?an?activator-inhibitor?mechanism?in?development?of?embryonic?feather?branching.Proc?Natl?Acad?Sci?U?S?A,2005,102(33):11734-11739），其中，但是關于羽小鉤的發育和分化，在分子水平的研究還很少，更缺少檢測雞的絲羽性狀分子標記方法。

發明內容

針對目前缺少檢測雞的絲羽性狀分子標記方法的現狀，本發明的目的是提供SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法。

CAU資源家系是由中國農業大學李寧教授課題組1998年建立的用于定位影響雞重要經濟性狀作用基因的實驗群體，親本為法國明星肉雞和泰和絲羽烏骨雞（Deng,X.M.,Li,J.Y.,Li,N.,and?Wu,C.X.(2001).Genetic?analysis?of?important?growth?trait?based?on?F-2?resource?population?in?chicken.Yi?Chuan?Xue?Bao?28,801-807）。在CAU資源家系中記錄了F₀、F₁和F₂代個體的絲羽性狀，通過連鎖分析定位了影響雞絲羽性狀的基因位點在雞3號染色體上，通過分析該區域的基因序列，分離得到了影響雞絲羽性狀的基因和序列變異。本發明的檢測雞絲羽性狀的分子標記方法，是利用雞3號染色體的十聚異戊二烯焦磷酸合成酶2亞基（Decaprenyl-diphosphate?synthase?subunit?2，PDSS2）基因和正弦復眼結合蛋白（Sine?oculis-binding?protein?homolog，SOBP）基因之間，位于第3號染色體70486623bp位點的一個核苷酸進行單核苷酸多態性檢測，根據檢測結果判定雞的絲羽基因為純合或雜合。

本發明提供SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法，包括如下步驟：

1）提取待測雞DNA樣品，用DNA特異性引物對進行PCR擴增，得到PCR擴增產物；

2）對PCR擴增產物中的雞第3號染色體70486623bp位點進行單核苷酸多態性（SNP）檢測。