[發(fā)明專利]SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201210348358.4 | 申請日: | 2012-09-18 |
| 公開(公告)號: | CN103667429A | 公開(公告)日: | 2014-03-26 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 胡曉湘;馮春剛;宋遲;顧曉榮;王彥強;李寧 | 申請(專利權(quán))人: | 中國農(nóng)業(yè)大學(xué) |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;A01K67/02 |
| 代理公司: | 北京路浩知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飛;張慶敏 |
| 地址: | 100193 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | snp 檢測 篩選 性狀 方法 | ||
1.SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法,其特征在于,包括如下步驟:
1)提取待測雞DNA樣品,用DNA特異性引物對進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到PCR擴(kuò)增產(chǎn)物;
2)對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中的雞第3號染色體70486623bp位點進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性檢測。
2.如權(quán)利要求1所述的SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法,其特征在于,步驟1)所述的DNA特異性引物對的脫氧核糖核苷酸序列為:
上游引物:5’-Biotin-CGACTCTCAACGCGGGAAC-3’
下游引物:5’-CTGGGGGCAGCCATCTTG-3’
3.如權(quán)利要求1所述的SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法,其特征在于,步驟1)所述的PCR擴(kuò)增,其25μl反應(yīng)體系終濃度為:
4.如權(quán)利要求1所述的SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法,其特征在于,步驟1)所述的PCR擴(kuò)增的反應(yīng)條件為:94℃變性5min;94℃變性30sec,63℃退火30sec,65℃延伸1min,其中每擴(kuò)增1個循環(huán)退火溫度降低1℃,共10循環(huán);94℃變性30sec,53℃退火30sec,65℃延伸1min,共30循環(huán);65℃延伸7min;20℃保存;取2μl用于瓊脂糖檢測,擴(kuò)增得到單一的目的條帶后用于進(jìn)一步檢測。
5.如權(quán)利要求1所述的SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法,其特征在于,步驟2)所述的單核苷酸多態(tài)性檢測采用焦磷酸鹽測序方法,為在PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中加入測序引物,放入PyroMarkID焦磷酸測序儀進(jìn)行SNP檢測。
6.如權(quán)利要求5所述的SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法,其特征在于,所述的測序引物的脫氧核糖核苷酸序列為:
5’-GCGTCGCACACGGGC-3’
7.如權(quán)利要求5所述的SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法,其特征在于,所述的焦磷酸鹽測序方法具體為:
在步驟2)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中加入Binding?Buffer?38μl、Sepharoe?Beads?2μl和滅菌水20μl,充分混勻10分鐘,轉(zhuǎn)移到反應(yīng)板中,加入Annealing?Buffer12μl,10μM測序引物1μl,放入PyroMarkID焦磷酸測序儀進(jìn)行SNP檢測,讀取結(jié)果。
8.用于權(quán)利要求1所述的SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法的試劑盒,包含脫氧核糖核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.2所示的引物。
9.權(quán)利要求1-7任一項所述的SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法在雞的育種中的應(yīng)用。
10.權(quán)利要求9所述的SNP檢測篩選雞的絲羽性狀的方法在雞的育種中的應(yīng)用,為在雞分子標(biāo)記輔助選擇中的應(yīng)用。
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