[發明專利]一種子宮頸癌熒光原位雜交檢測試劑盒及其制備方法無效
| 申請號: | 201210329753.8 | 申請日: | 2012-09-07 |
| 公開(公告)號: | CN102925553A | 公開(公告)日: | 2013-02-13 |
| 發明(設計)人: | 李明;何瑰;陳華云 | 申請(專利權)人: | 中山大學達安基因股份有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/10;G01N21/64 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 510665 廣東省廣*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 子宮頸癌 熒光 原位雜交 檢測 試劑盒 及其 制備 方法 | ||
1.一種輔助子宮頸癌早期診斷及治療選擇的hWAPL基因熒光原位雜交檢測試劑盒,包括:1)雜交緩沖液、熒光標記探針混合物、未標記的競爭性DNA、DAPI復染劑,和2)分隔并集中包裝這些試劑瓶或管的包裝盒,其特征在于熒光標記探針混合物包含hWAPL基因探針和10號染色體著絲粒探針,每人份熒光標記探針混合物中GSP?hWAPL和CSP10因探針的使用量均為0.5μl。
2.根據權利要求1的試劑盒,其特征還在于未標記的競爭性DNA為Human?COT-1DNA。
3.根據權利要求1的試劑盒,其特征還在于雜交緩沖液的組分包括去離子甲酰胺,SSC,硫酸葡聚糖,其中去離子甲酰胺濃度為50%~70%,硫酸葡聚糖濃度為0.1g/ml。
4.根據權利要求1的試劑盒,其特征還在于DAPI復染劑配制方法為50~250ng?DAPI溶于1ml抗褪色液(10mg/ml對苯二胺/PBS,甘油混合液)。
5.一種制備權利要求1試劑盒所述hWAPL基因探針和10號染色體著絲粒探針的方法,如下:
(1)片段篩選:通過NCBI?Mapview數據庫檢索所有含有hWAPL基因的克隆,并對這些克隆進行篩選,選擇最優的克隆;通過NCBI?Mapview數據庫檢索10號染色體重復區域序列,并進行重復性分析,選擇引物設計區域
(2)培養鑒定:按照hWAPL篩選確定的克隆編號購買克隆Invitrogen?RPCI11.C,常規培養,使用針對hWAPL基因區域的STS引物進行PCR擴增,并通過2%瓊脂糖凝膠電泳對擴增產物片段進行分析,從而完成待選hWAPL克隆的鑒定;CSP10以人基因組DNA為模板,利用設計的引物對進行PCR反應,通過電泳進行鑒定;將目的產物進行克隆、培養,從而完成待選CSP10片段鑒定
(3)探針制備:對鑒定陽性的菌液,進行質粒DNA的提取;通過OD值的測定對質粒DNA進行定量;然后,通過切口平移方法對質粒DNA進行熒光標記;對標記產物進行純化
(4)探針驗證:使用人類正常分裂中期淋巴細胞滴片進行探針驗證。
6.根據權利要求5所述的制備方法,其特征還在于克隆篩選步驟中篩選含有hWAPL基因最優的克隆,編號為RP11-383M14(chr10:88159615..88339509)。
7.根據權利要求5所述的制備方法,其特征還在于包含hWAPL基因片段的克隆培養和鑒定步驟中使用的STS引物對序列分別為:上游引物5’-ATGAATAGGCAGGCTGAGGATTT-3’和下游引物5’-TGACTCAGCCAAACCTTCTTAGG-3’;PCR擴增條件為:94℃5分鐘,(94℃30秒,58℃30秒,72℃45秒)×35循環,72℃7分鐘。
8.根據權利要求5所述的制備方法,其特征還在于制備CSP10探針的引物對序列為:
上游引物5’-TGGATAATTGGCCCTCTTTGA-3’和下游引物5’-TTTCCATGTCTAAGATTGGCGT-3’;PCR擴增條件為:94℃5分鐘,(94℃30秒,56℃30秒,72℃45秒)×35循環,72℃7分鐘。
9.根據權利要求5所述的制備方法,其特征還在于探針制備過程中50μl切口平移體系中DNA聚合酶I使用量在10U~20U間,DNase?I使用量在0.001U~0.01U間。
10.根據權利要求5所述的制備方法,其特征還在于探針標記的熒光素為熒光素標記的dUTP,并優選Spectrum?dUTP。
11.根據權利要求5所述的制備方法,其特征還在于探針濃縮方法為乙醇沉淀濃縮,最后使用1~2μl滅菌純化水或Human?Cot-1DNA(1μg/μl)溶解沉淀。
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