[發明專利]超高處理量光學-納米孔DNA讀出平臺

無效

• 申請號: 201210298157.8
• 申請日: 2005-08-12
• 公開（公告）號: CN102925549A
• 公開（公告）日: 2013-02-13
• 發明（設計）人: A·梅勒;J·麥瑟;J·S·埃德
• 申請（專利權）人: 哈佛學院院長等
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 中國國際貿易促進委員會專利商標事務所 11038
• 代理人: 袁泉

1.一種組合物，包含：

可雜交探針聚合物，包括以對應于目標多核苷酸的核苷酸序列的順序連接在一起的多個可雜交探針單體，其中所述可雜交探針聚合物中的一個或多個可雜交探針單體與所述目標多核苷酸的一個或多個預訂的核苷酸堿基相對應；

多個可淬滅熒光探針，每個可淬滅熒光探針包含核苷酸序列、熒光團和淬滅劑，其中：

每個可淬滅熒光探針與可雜交探針聚合物中的一個可雜交探針單體雜交；并且

除了末端可淬滅熒光探針之一的熒光團外，每個熒光團被臨近可淬滅熒光探針的淬滅劑所淬滅。

2.權利要求1的組合物，其中所述目標多核苷酸選自DNA和RNA。

3.權利要求2的組合物，其中所述目標多核苷酸是DNA。

4.權利要求3的組合物，其中所述DNA是cDNA或gDNA。

5.權利要求1的組合物，其中所述可淬滅熒光探針中的核酸包括DNA，RNA和/或PNA。

6.權利要求1的組合物，其中所述可雜交探針單體包括DNA，RNA和/或PNA。

7.權利要求6的組合物，其中所述可雜交探針單體的核苷酸堿基的范圍是從約5個核苷酸堿基至約20個核苷酸堿基。

8.權利要求1的組合物，其中所述目標多核苷酸中的每個核苷酸用可雜交探針單體的二進制碼表示。

9.權利要求8的組合物，其中所述目標多核苷酸中的核苷酸選自腺嘌呤，胞嘧啶，尿嘧啶，鳥嘌呤，胸腺嘧啶及其修飾形式。

10.權利要求1的組合物，其中所述組合物包含多個不同的可淬滅熒光探針，每個探針包含不同的熒光團，其中每個探針與不同的可雜交探針單體雜交。

11.權利要求10的組合物，其中所述組合物包含2種不同的可淬滅熒光探針。

12.權利要求1的組合物，其中所述可淬滅熒光探針在分離中自淬滅。

13.權利要求12的組合物，其中所述可淬滅熒光探針是分子信標。

14.權利要求13的組合物，其中所述分子信標的5′端的核苷酸序列部分與所述分子信標的3′端的核苷酸序列部分相互補。

15.權利要求1的組合物，進一步包含納米孔系統。

16.權利要求15的組合物，其中所述納米孔系統包含多個納米孔和一個或多個檢測系統。

17.權利要求15的組合物，其中所述納米孔包含在合成的有機或無機薄膜中產生的一個或多個納米孔。

18.權利要求15的組合物，其中所述納米孔的孔徑是約2.5nm至約9nm。

19.權利要求16的組合物，其中所述納米孔系統包括納米孔陣列。

20.權利要求15的組合物，其中所述納米孔系統包括一個或多個通道和脂雙層。

21.權利要求16的組合物，其中所述納米孔系統中的納米孔選自α-溶血素，λ噬菌體的受體，短桿菌肽，纈氨霉素，OmpF，OmpC，PhoE，Tsx，F菌毛，線粒體孔蛋白(VDAC)。

22.全力企業21的組合物，其中所述納米孔是α-溶血素。

23.權利要求22的組合物，其中所述α-溶血素包含孔腔和通道。

24.權利要求23的組合物，其中所述孔腔的直徑是約2.5nm。

25.權利要求23的組合物，其中所述通道具有約1.5nm直徑。

26.權利要求25的組合物，其中所述通道具有約0.5nm至約2.0nm的孔徑。