[發明專利]SLC25A13基因突變體及其應用

有效

• 申請號: 201210205478.9
• 申請日: 2012-06-20
• 公開（公告）號: CN103509802B
• 公開（公告）日: 2017-12-19
• 發明（設計）人: 王金明;王俊;汪建;楊煥明
• 申請（專利權）人: 深圳華大基因股份有限公司
• 主分類號: C12N15/12
• 分類號: C12N15/12;C07K14/47;C12Q1/68;C12M1/34
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙)11201
• 代理人: 李志東

技術領域

本發明涉及SLC25A13基因突變體及其應用。具體地，本發明涉及分離的編碼SLC25A13突變體的核酸、分離的多肽、篩選易感新生兒瓜胺酸血癥2型疾病的生物樣品的方法、篩選易感新生兒瓜胺酸血癥2型疾病的生物樣品的系統以及用于篩選易感新生兒瓜胺酸血癥2型疾病的生物樣品的試劑盒。

背景技術

新生兒瓜胺酸血癥2型（phaeohyphomycosis，OMIM號為605814），又叫新生兒檸檬素缺乏所致的肝內膽汁郁積（Neonatal Intrahepatic Cho lestasis Caused By Ctrin Deficiency，NICCD），其屬于氨基酸代謝缺陷癥中瓜胺酸代謝病的一種，患者在出生一至五個月間便會發生膽汁郁積性黃疸，肝臟功能不正常，出現多種高胺基酸血癥，半乳糖血癥及脂肪肝等癥狀。嚴重者會導致生長遲緩，異常出血不止或貧血，低血糖，肝臟腫大，甚至肝臟衰竭。此疾病的發生率依照基因突變頻率推估，臺灣地區發生率約為1/14000。NICCD是一種常染色體隱性遺傳病，SLC25A13基因是目前唯一已知和NICCD相關的基因。迄今為止，在SLC25A13基因上已發現多個突變位點與NICCD疾病相關，但也有多個NICCD患者并未發現突變。

因而，目前對NICCD疾病的研究仍有待深入。

發明內容

本發明旨在至少解決現有技術中存在的技術問題之一。為此，本發明的一個目的在于提出新生兒瓜胺酸血癥2型疾病（在本文中有時也稱為“NICCD疾病”）的致病基因上的新突變。

本發明是基于發明人的下列工作而完成的：發明人通過目標區域捕獲測序的方法確定了NICCD疾病的致病基因上的新突變。

根據本發明的第一方面，本發明提出了一種分離的編碼SLC25A13突變體的核酸。根據本發明的實施例，與SEQ ID NO：1相比，該核酸具有選自下列的至少一種突變：c.754G>A和c.1177+1G>A。根據本發明的實施例，發明人確定了多個SLC25A13基因的新突變體，這些新突變體與NICCD疾病的發病密切相關，從而通過檢測這些新突變體在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否易感NICCD疾病。

根據本發明的第二方面，本發明提出了一種分離的多肽。根據本發明的實施例，與SEQID NO：2相比，該分離的多肽具有選自下列的至少一種突變：p.Glu252Lys和p.Gly393Glyfs*2。根據本發明的一些具體示例，該多肽是由前述分離的編碼SLC25A13突變體的核酸編碼的。通過檢測生物樣品中是否表達該多肽，可以有效地檢測生物樣品是否易感NICCD疾病。

根據本發明的第三方面，本發明提出了一種篩選易感NICCD疾病的生物樣品的方法。根據本發明的實施例，該篩選易感NICCD疾病的生物樣品的方法包括以下步驟：從生物樣品提取核酸樣本；確定核酸樣本的核酸序列；該核酸樣本的核酸序列或其互補序列與SEQ ID NO：1相比，具有選自c.754G>A和c.1177+1G>A的至少一種突變是生物樣品易感NICCD疾病的指示。通過根據本發明實施例的篩選易感NICCD疾病的生物樣品的方法，可以有效地篩選易感NICCD疾病的生物樣品。

根據本發明的第四方面，本發明提出了一種篩選易感NICCD疾病的生物樣品的系統。根據本發明的實施例，該篩選易感NICCD疾病的生物樣品的系統包括：核酸提取裝置，該核酸提取裝置用于從生物樣品提取核酸樣本；核酸序列確定裝置，該核酸序列確定裝置與核酸提取裝置相連，用于對核酸樣本進行分析，以便確定核酸樣本的核酸序列；判斷裝置，該判斷裝置與核酸序列確定裝置相連，以便基于核酸樣本的核酸序列或其互補序列與SEQ ID NO：1相比，是否具有選自c.754G>A和c.1177+1G>A的至少一種突變，判斷生物樣品是否易感NICCD疾病。利用該系統，能夠有效地實施前述篩選易感NICCD疾病的生物樣品的方法，從而可以有效地篩選易感NICCD疾病的生物樣品。

根據本發明的第五方面，本發明提出了一種用于篩選易感NICCD疾病的生物樣品的試劑盒。根據本發明的實施例，該用于篩選易感NICCD疾病的生物樣品的試劑盒包括：適于檢測SLC25A13基因突變體的試劑，其中與SEQ ID NO：1相比，SLC25A13基因突變體具有選自c.754G>A和c.1177+1G>A的至少一種突變。利用根據本發明的實施例的試劑盒，能夠有效地篩選易感NICCD疾病的生物樣品。