[發(fā)明專利]一種以人乳頭瘤病毒HPV的DNA解旋酶E1為靶點的抗HPV病毒藥物的虛擬篩選方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201210195233.2 | 申請日： | 2012-06-14 |
| 公開（公告）號： | CN102750459A | 公開（公告）日： | 2012-10-24 |
| 發(fā)明（設計）人： | 蘆秀麗;高兵;張勇;陳樹超;劉汀;賈丹 | 申請（專利權）人： | 遼寧大學 |
| 主分類號： | G06F19/16 | 分類號： | G06F19/16;A61K45/00;A61P35/00;A61P31/20 |
| 代理公司： | 沈陽杰克知識產權代理有限公司 21207 | 代理人： | 金春華 |
| 地址： | 110136 遼寧*** | 國省代碼： | 遼寧;21 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 乳頭 病毒 hpv dna 解旋酶 e1 藥物 虛擬 篩選 方法 | ||
【權利要求書】：
1.一種以人乳頭瘤病毒HPV的DNA解旋酶E1為靶點的抗HPV病毒藥物的虛擬篩選方法，其特征在于：包括以下步驟：
1）確定E1蛋白結構的PDB晶體結構數(shù)據；
2）采用分子對接軟件，依據E1的活性氨酸殘基位點確定分子對接的活性中心，設定活性口袋；
3）對小分子配體進行篩選，篩選項目為毒性篩選、類藥性篩選；
4）建立對接用小分子配體數(shù)據庫；
5）根據設定的活性口袋，利用分子對接軟件，將對接用小分子配體數(shù)據庫中的小分子配體與活性口袋一一做對接；
6）根據對接結果的排序，小分子配體與活性中心的相互作用方式，進行綜合評價，初步確定具有抗HPV病毒效果的先導藥物。
2.按照權利要求1所述虛擬篩選方法，其特征在于：步驟3）置于步驟1）至步驟6）任何一個步驟之前。
3.按照權利要求1或2所述的虛擬篩選方法篩選出的抗HPV病毒藥物在制備預防和治療宮頸癌和尖銳濕疣藥物中的應用。
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G06 計算；推算；計數(shù)
G06F 電數(shù)字數(shù)據處理
G06F19-00 專門適用于特定應用的數(shù)字計算或數(shù)據處理的設備或方法
G06F19-10 .生物信息學，即計算分子生物學中的遺傳或蛋白質相關的數(shù)據處理方法或系統(tǒng)
G06F19-12 ..用于系統(tǒng)生物學的建模或仿真，例如：概率模型或動態(tài)模型，遺傳基因管理網絡，蛋白質交互作用網絡或新陳代謝作用網絡
G06F19-14 ..用于發(fā)展或進化的，例如：進化的保存區(qū)域決定或進化樹結構
G06F19-16 ..用于分子結構的，例如：結構排序，結構或功能關系，蛋白質折疊，結構域拓撲，用結構數(shù)據的藥靶，涉及二維或三維結構的
G06F19-18 ..用于功能性基因組學或蛋白質組學的，例如：基因型–表型關聯(lián)，不均衡連接，種群遺傳學，結合位置鑒定，變異發(fā)生，基因型或染色體組的注釋，蛋白質相互作用或蛋白質核酸的相互作用
G06F 電數(shù)字數(shù)據處理
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