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[發(fā)明專利]檢測PJVK基因c.886C>T突變的試劑盒無效

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201210172361.5 申請日: 2012-05-29
公開(公告)號: CN102864216A 公開(公告)日: 2013-01-09
發(fā)明(設計)人: 王秋菊 申請(專利權)人: 王秋菊;中國人民解放軍總醫(yī)院
主分類號: C12Q1/68 分類號: C12Q1/68
代理公司: 北京律誠同業(yè)知識產權代理有限公司 11006 代理人: 黃韌敏
地址: 100853*** 國省代碼: 北京;11
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摘要:
搜索關鍵詞: 檢測 pjvk 基因 886 突變 試劑盒
【說明書】:

技術領域

發(fā)明涉及基因檢測領域,具體涉及用于檢測PJVK基因突變基因的試劑盒;本發(fā)明還涉及PJVK突變基因及其在診斷和/或治療感音神經性聾及聽神經病/聽神經病譜系障礙中的應用。

背景技術

聽神經病/聽神經病譜系障礙(Auditory?Neuropathy?Spectrum?Disorders,ANSD)是一種耳蝸外毛細胞功能正常,但聲音信號不能同步地從內耳傳輸?shù)酱竽X的聽覺障礙性疾病,系聽覺信息傳輸處理過程的異常。聽力學檢查表現(xiàn)為以低頻聽力減退為主的聽力損失,聽性腦干反應不能引出,耳蝸微音電位和耳聲發(fā)射多正常。該類疾病于上個世紀90年代被定義和命名,是一種新認識的聽力障礙性疾病,在高危嬰幼兒中的發(fā)病率約為0.23%,在各種原因所致的ABR異常的聾病患兒中發(fā)病率則高達11%,是導致嬰幼兒和青少年言語交流障礙的重要聽力障礙性疾病之一。然而,其病因、病變部位和發(fā)病機制尚不十分明確,導致藥物治療、佩戴助聽器及人工耳蝸植入術效果的預測和評估上存在難度。近幾年來,一系列感音神經性聾及聽神經病/聽神經病譜系障礙相關基因的發(fā)現(xiàn),從分子水平揭示了感音神經性聾及聽神經病/聽神經病譜系障礙的病理機制。根據(jù)不同基因導致的不同病變部位對感音神經性聾及聽神經病/聽神經病譜系障礙進行分型,可為感音神經性聾及聽神經病/聽神經病譜系障礙的臨床治療提供理論依據(jù)。

Starr教授等根據(jù)聽神經病譜系障礙發(fā)病部位的不同將其分為TYPE?I型(病變部位在聽神經)和TYPE?II型(病變部位在內毛細胞、末梢樹突及突觸)國內外研究顯示攜帶OTOF基因突變的聽神經病譜系障礙患者臨床多以TypeII型表現(xiàn)為主,適合于人工耳蝸植入并可取得較好效果。而攜帶PJVK基因突變的聽神經病譜系障礙患者臨床多以TYPE?I型為主,其病變部位在聽神經,位置深在,人工耳蝸植入術效果欠佳。

PJVK基因是與非綜合征型隱性遺傳性感音神經性聾及聽神經病/聽神經病譜系障礙相關的基因。由Delmaghani等于2006年首次發(fā)現(xiàn)并命名,也稱為DFNB59基因,位于染色體2q31.1~2q31.3區(qū)域,DNA序列全長9800bp,含有7個外顯子,其中第一個外顯子為非編碼外顯子。該基因的編碼區(qū)序列,含終止密碼子如SEQ?ID?NO.1所示,編碼由352個氨基酸組成的蛋白pejvakin(如SEQ?ID?NO.2所示),其中第249~258位氨基酸形成核定位信號基序(nuclear?localization?signal,NLS),第305~331位氨基酸形成一種可以與DNA相互作用的鋅指結構(zinc-binding?domains)。Pejvakin蛋白主要表達于耳蝸Corti器、螺旋神經節(jié)細胞以及前三級聽覺傳入通路(耳蝸核、上橄欖復合體、下丘)的神經元細胞中,所致感音神經性聾及聽神經病/聽神經病譜系障礙的病變部位主要位于聽覺傳導通路,影響動作電位的傳導及細胞內物質交換。自2006年首次發(fā)現(xiàn)并報道PJVK基因至今,學者們分別在伊朗、摩洛哥、土耳其及荷蘭等患者中發(fā)現(xiàn)了該基因的10余種突變,但少見我國感音神經性聾及聽神經病/聽神經病譜系障礙患者該基因的突變報道。申請人所在課題組針對150名感音神經性聾及聽神經病/聽神經病譜系障礙患者率先開展了該基因的篩查,并發(fā)現(xiàn)我國人群特有的c.886C>T突變,進而研發(fā)了檢測該基因c.886C>T突變的試劑盒。該成果有助于快速、高效地在更大范圍的感音神經性聾及聽神經病/聽神經病譜系障礙人群中進行突變位點的檢測,進而對其定位分型,為感音神經性聾及聽神經病/聽神經病譜系障礙患者開展臨床干預提供重要的指導意義。

發(fā)明內容

本發(fā)明的一個目的在于提供用于檢測PJVK突變c.886C>T基因的試劑盒,其技術方案為:

一種用于檢測與感音神經性聾及聽神經病/聽神經病譜系障礙相關的位于PJVK基因的c.886C>T突變的試劑盒,所述試劑盒包括:

從待測樣品中提取DNA的試劑;

用于擴增樣本DNA的PCR反應試劑;

對PCR擴增產物進行測序的試劑;

其中,所述擴增樣本DNA的PCR反應試劑包括PCR引物,所述PCR引物擴增的目標片段包含PJVK基因886位堿基。

具體地,上述PCR引物為選自下述引物中的一對:

PJVK-7F-1(SEQ?ID?NO.3):5’-GCCAGACCCTGTCTCAAAAA-3’,

PJVK-7R-1(SEQ?ID?NO.4):5’-GGGAATATGATACCCAGACAGG-3’;

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