[發(fā)明專利]燕麥噬酸菌西瓜亞種的蛋白質(zhì)指紋圖譜模型及其應用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201210157862.6
• 申請日: 2012-05-21
• 公開（公告）號: CN103424463A
• 公開（公告）日: 2013-12-04
• 發(fā)明（設計）人: 馮建軍;章桂明;李健強;鄭耘;李一農(nóng);婁定風
• 申請（專利權(quán)）人: 深圳出入境檢驗檢疫局動植物檢驗檢疫技術(shù)中心
• 主分類號: G01N27/64
• 分類號: G01N27/64
• 代理公司: 深圳鼎合誠知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 44281
• 代理人: 羅瑤

1.一種燕麥噬酸菌西瓜亞種的蛋白質(zhì)指紋圖譜模型，其特征在于：根據(jù)燕麥噬酸菌西瓜亞種的多個蛋白質(zhì)的質(zhì)荷比及其蛋白質(zhì)波峰強度系數(shù)繪制而成，所述多個蛋白質(zhì)的質(zhì)荷比包括3171.4、3735.0、4963.5、5139.0、5866.4、6554.1、7466.1、7948.0、8384.5、9304.2、9504.3、9920.0、10272.8、10840.7、12530.5、12896.5。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的蛋白質(zhì)指紋圖譜模型，其特征在于：所述蛋白質(zhì)的質(zhì)荷比值及其波峰強度系數(shù)由基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜儀的軟件統(tǒng)計分析得到。

3.一種包括權(quán)利要求1或2所述的蛋白質(zhì)指紋圖譜模型的蛋白質(zhì)檢測分析數(shù)據(jù)庫。

4.權(quán)利要求1或2所述的蛋白質(zhì)指紋圖譜模型在燕麥噬酸菌西瓜亞種的檢測或鑒定中的應用。

5.一種燕麥噬酸菌西瓜亞種的基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜檢測方法，包括樣品蛋白質(zhì)芯片制備、基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜儀檢測，以及樣品蛋白質(zhì)圖譜比對。其特征在于：所述樣品蛋白質(zhì)圖譜比對是將基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜儀檢測分析獲得的樣品蛋白質(zhì)圖譜，與權(quán)利要求1或2所述的蛋白質(zhì)指紋圖譜模型比較；或者在權(quán)利要求3所述的蛋白質(zhì)檢測分析數(shù)據(jù)庫中比對。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的檢測方法，其特征在于：所述樣品蛋白質(zhì)芯片制備包括釋放樣品蛋白質(zhì)的前處理和點樣，所述點樣的步驟包括，先在質(zhì)譜靶芯片上滴加樣品上清液，晾干后再滴加基質(zhì)溶液。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的檢測方法，其特征在于：所述基質(zhì)溶液的溶劑為乙腈：甲醇：無菌去離子水按體積比1：0.8-1.2：0.8-1.2混合而成。

8.根據(jù)權(quán)利要求6所述的檢測方法，其特征在于：所述基質(zhì)溶液的溶質(zhì)為α-氰基-4-羥基肉桂酸。

9.根據(jù)權(quán)利要求6所述的檢測方法，其特征在于：所述釋放樣品蛋白質(zhì)的前處理采用的溶劑包括第一溶劑、第二溶劑和第三溶劑中的至少一種；

第一溶劑為0.1%的三氟乙酸，第二溶劑為70%的甲酸，第三溶劑為100%乙腈。

10.根據(jù)權(quán)利要求5-9任一項所述的檢測方法，其特征在于：所述樣品蛋白質(zhì)圖譜比對采用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜儀自帶的軟件進行，且比對獲得的log(score)值為大于2.2小于3.0。