[發明專利]大豆疫霉的檢測靶標序列A3apro及其特異性LAMP引物組合物和應用有效
| 申請號: | 201210153468.5 | 申請日: | 2012-05-16 |
| 公開(公告)號: | CN102676511A | 公開(公告)日: | 2012-09-19 |
| 發明(設計)人: | 王源超;戴婷婷;董莎萌;鄭小波 | 申請(專利權)人: | 南京農業大學 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 南京天華專利代理有限責任公司 32218 | 代理人: | 徐冬濤;傅婷婷 |
| 地址: | 210095 *** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 大豆 檢測 靶標 序列 a3apro 及其 特異性 lamp 引物 組合 應用 | ||
1.大豆疫霉的檢測靶標序列A3apro,其特征在于核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示。
2.權利要求1所述的大豆疫霉的檢測靶標序列A3apro在檢測或鑒定大豆疫霉中的應用。
3.針對權利要求1所述的大豆疫霉的檢測靶標序列A3apro設計的特異性的LAMP引物組合物,其特征在于包含:正向內引物FIP:SEQ?ID?NO.2,反向內引物BIP:SEQ?ID?NO.3,正向外引物F3:SEQ?ID?NO.4,反向外引物B3:SEQ?ID?NO.5。
4.權利要求3所述的針對權利要求1所述的大豆疫霉的檢測靶標序列A3apro設計的特異性的LAMP引物組合物在檢測或鑒定大豆疫霉中的應用。
5.一種用于檢測大豆疫霉的LAMP檢測試劑盒,其特征在于包含權利要求3所述的特異性的LAMP引物組合物。
6.根據權利要求5所述的用于檢測大豆疫霉的LAMP檢測試劑盒,其特征在于所述的試劑盒包含:由1.6μM正向內引物FIP、1.6μM反向內引物BIP、0.2μM正向外引物F3、0.2μM反向外引物B3、1.4mM?dNTPs、20mM?pH?8.8的Tris-HCl、10mM?KCl、10mM(NH4)2SO4、6mM?MgSO4、0.1%Triton?X-100、8U?Bst?DNA?polymerase?320單位、180mM羥基萘酚藍,加入超純水制備成檢測溶液。
7.一種檢測大豆疫霉的方法,其特征在于提取待檢微生物的DNA,以提取的DNA為模板,利用權利要求3所述的特異性的LAMP引物組合物進行LAMP;
擴增產物進行瓊脂糖凝膠電泳,在紫外光下檢測結果,如果存在特征性梯狀條帶,則證明存在大豆疫霉;
或者以LAMP反應體系的顏色變化做為結果判定標準,天藍色表示檢測為陽性,存在大豆疫霉;紫色表示檢測結果為陰性,不存在大豆疫霉。
8.根據權利要求7所述的檢測大豆疫霉的方法,其特征在于提取待檢微生物的DNA,取1μl?DNA溶液,加入23μl權利要求6所述的檢測溶液和2μl滅菌去離子水進行LAMP,LAMP反應程序為:60℃~65°C,55~90min,優選64℃,80min;
擴增產物進行瓊脂糖凝膠電泳,在紫外光下檢測結果,如果存在特征性梯狀條帶,則證明存在大豆疫霉;
或者以LAMP反應體系的顏色變化做為結果判定標準,天藍色表示檢測為陽性,存在大豆疫霉;紫色表示檢測結果為陰性,不存在大豆疫霉。
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