[發明專利]多態性檢測用探針、多態性檢測方法、藥效判定方法以及多態性檢測用試劑盒

有效

• 申請號: 201210132135.4
• 申請日: 2012-04-27
• 公開（公告）號: CN102766682A
• 公開（公告）日: 2012-11-07
• 發明（設計）人: 井口亞希
• 申請（專利權）人: 愛科來株式會社
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京東方億思知識產權代理有限責任公司 11258
• 代理人: 肖善強

1.一種多態性檢測用探針，其為從包括下述P1和P1’的組中選擇的一種熒光標記寡核苷酸，用于檢測ABCC2基因的多態性：

(P1)熒光標記寡核苷酸，其為含有序列編號1所示的序列中的第207位～第217位的堿基的堿基長為11～60的序列，該序列除了與序列編號1中的第217位的堿基對應的堿基為胞嘧啶之外相對于具有與序列編號1相同的堿基的堿基序列具有至少80％以上的同一性，并且與序列編號1所示的序列中的第217位的堿基對應的堿基用熒光染料標記；以及

(P1’)熒光標記寡核苷酸，其為含有序列編號1所示的序列中的第207位～第217位的堿基的堿基長為11～60的序列，該序列除了與序列編號1中的第217位的堿基對應的堿基為胞嘧啶之外與具有和序列編號1相同的堿基的堿基序列的互補鏈在嚴謹條件下雜交，并且與序列編號1所示的序列中的第217位的堿基對應的堿基用熒光染料標記。

2.根據權利要求1所述的多態性檢測用探針，其中，所述多態性檢測用探針是下述P1或下述P1’的所述熒光標記核苷酸，

(P1-1)熒光標記寡核苷酸，其為含有序列編號1所示的序列中的第207位～第217位的堿基的堿基長為11～60的序列，該序列除了與序列編號1的第217位的堿基對應的堿基為胞嘧啶之外相對于具有與序列編號1相同的堿基的堿基序列具有至少80％以上的同一性，并且與序列編號1所示的序列中的第217位的堿基對應的堿基用熒光染料標記，并且該熒光標記寡核苷酸識別序列編號1的第207位的堿基的多態性；或者

(P1’-1)熒光標記寡核苷酸，其為含有序列編號1所示的序列中的第207位～第217位的堿基的堿基長為11～60的序列，該序列除了與序列編號1中的第217位的堿基對應的堿基為胞嘧啶之外與具有和序列編號1相同的堿基的堿基序列的互補鏈在嚴謹條件下雜交，并且與序列編號1所示的序列中的第217位的堿基對應的堿基用熒光染料標記，并且該熒光標記寡核苷酸識別序列編號1的第207位的堿基的多態性。

3.根據權利要求1或2所述的多態性檢測用探針，其中，所述熒光標記寡核苷酸在從3’末端起數第1位～第3位具有用熒光染料標記的第217位的堿基。

4.根據權利要求1至3中任一項所述的多態性檢測用探針，其中，所述熒光標記寡核苷酸在3’末端具有用熒光染料標記的第217位的堿基。

5.根據權利要求1至4中任一項所述的多態性檢測用探針，其中，所述熒光標記寡核苷酸在未與靶標序列雜交時發出熒光，并且在與該靶標序列雜交時熒光強度減少或增加。

6.根據權利要求1至5中任一項所述的多態性檢測用探針，其中，所述熒光標記寡核苷酸在未與靶標序列雜交時發出熒光，并且在與該靶標序列雜交時熒光強度減少。

7.根據權利要求1至6中任一項所述的多態性檢測用探針，其中，所述熒光標記寡核苷酸的堿基長為12～55。

8.根據權利要求1至7中任一項所述的多態性檢測用探針，其中，所述熒光標記寡核苷酸的堿基長為15～45。

9.根據權利要求1至8中任一項所述的多態性檢測用探針，其中，所述熒光標記寡核苷酸的堿基長為18～35。

10.根據權利要求1至9中任一項所述的多態性檢測用探針，其中，所述多態性檢測用探針為用于分析熔解曲線的探針。

11.根據權利要求1至10中任一項所述的多態性檢測用探針，其中，所述多態性檢測用探針具有序列編號4、序列編號5、序列編號6、序列編號7、序列編號8、序列編號9、序列編號10、序列編號11、序列編號12、序列編號13、序列編號14、序列編號15或序列編號16所示的堿基序列。

12.一種多態性檢測方法，其通過使用權利要求1至11中任一項所述的多態性檢測用探針來檢測ABCC2基因的多態性。