[發明專利]一種針對整合酶核心區去整合反應的整合酶抑制劑體外篩選方法有效
| 申請號: | 201210109278.3 | 申請日: | 2012-04-13 |
| 公開(公告)號: | CN102618654A | 公開(公告)日: | 2012-08-01 |
| 發明(設計)人: | 何紅秋;賈渝躍;樂濤;牛小東 | 申請(專利權)人: | 重慶市科學技術研究院 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/25;G01N21/64 |
| 代理公司: | 重慶市前沿專利事務所 50211 | 代理人: | 郭云 |
| 地址: | 401123 重慶市渝*** | 國省代碼: | 重慶;85 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 針對 整合 核心區 反應 抑制劑 體外 篩選 方法 | ||
1.一種針對整合酶核心區去整合反應的HIV-1整合酶抑制劑體外篩選方法,包括以下步驟:
(1)整合酶核心區蛋白的制備:
表達純化野生型整合酶核心區蛋白,定量后稀釋為3600nmol/L,分裝保存待用。
(2)去整合DNA底物的制備:
將合成的寡核苷酸鏈1、2、3、4分別按照等摩爾濃度比例混合,震蕩混勻后用鋁箔紙完全封閉避光,置于95℃下孵育5分鐘變性,緩慢冷卻至室溫退火,稀釋為750nmol/L,分裝避光保存待用;所述寡核苷酸序列如下:
寡核苷酸鏈1:5’-CCTCGAAGTCGACCTGCAGCCCAAGCTTGCGTTGCTGAACGAGG-3’
寡核苷酸鏈2:5’-ATGTGGAAAATCTCTAGCAGGCTGCAGGTCGAC-3’
寡核苷酸鏈3:5’-ACTGCTAGAGGATTTTCCACAT-3’
寡核苷酸鏈4:5’-CAGCAACGCAAGCTTG-3’;
(3)待測化合物樣品的制備:
室溫下將待測化合物樣品用二甲亞砜配制成不同濃度的溶液,充分振蕩溶解后備用;
(4)待測化合物樣品的篩選:
反應體系為50μl/微孔,加入去離子水40μl。微孔板設陰性對照3孔,每孔分別加入2μl二甲亞砜,其他孔中每孔分別加入2μl不同濃度的待測化合物樣品,設陽性對照3孔,加入的5μl蛋白質樣品為高溫變性后的整合酶核心區蛋白,之后所有孔均分別加入5μl整合酶核心區蛋白,振蕩器充分混勻后,在25℃下孵育10~30分鐘,加入去整合DNA底物3μl,振蕩器充分混勻后,在37℃下孵育30分鐘,用熒光分析儀檢測報告基團信號,
按照以下公式計算待測樣品的抑制率:
計算待測樣品的抑制率。
2.根據權利要求1所述一種針對整合酶核心區去整合反應的HIV-1整合酶抑制劑體外篩選方法,其特征在于:所述DNA底物為使用了由熒光基團和淬滅基團標記的DNA底物,DNA底物由寡核苷酸鏈寡核苷酸鏈1、2、3、4混合、變性、退火后制備而成,寡核苷酸鏈序列為:
1:5’-CCTCGAAGTCGACCTGCAGCCCAAGCTTGCGTTGCTGAACGAGG-3’中5’端標記5-羧基熒光素,3’端標記4-(4’-二甲基對氨基偶氮苯)苯甲酸;
2:5’-ATGTGGAAAATCTCTAGCAGGCTGCAGGTCGAC-3’;
3:5’-ACTGCTAGAGGATTTTCCACAT-3’;
4:5’-CAGCAACGCAAGCTTG-3’。
3.根據權利要求1所述一種針對整合酶核心區去整合反應的HIV-1整合酶抑制劑體外篩選方法,其特征在于:所述整合酶核心區蛋白的制備,采用基于磁珠吸附DNA技術結合ELISA的液相微孔板方法中所用的制備方法。
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