[發明專利]SNRNP200基因突變體及其應用

有效

• 申請號: 201210082413.X
• 申請日: 2012-03-26
• 公開（公告）號: CN103361373A
• 公開（公告）日: 2013-10-23
• 發明（設計）人: 劉鐵城;金鑫;章雪敏;張寶全;吳婧;肖若;王俊;汪建;楊煥明
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍總醫院;深圳華大基因科技有限公司
• 主分類號: C12N15/55
• 分類號: C12N15/55;C12N9/14;C12Q1/68;C12M1/34;C12Q1/02
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 李志東

技術領域

本發明涉及SNRNP200基因突變體及其應用。具體地，本發明涉及分離的編碼SNRNP200突變體的核酸，分離的多肽，篩選易感原發性視網膜色素變性疾病的生物樣品的方法，篩選易感原發性視網膜色素變性疾病的生物樣品的系統，用于篩選易感原發性視網膜色素變性疾病的生物樣品的試劑盒以及篩選治療或預防原發性視網膜色素變性疾病的藥物的方法。

背景技術

原發性視網膜色素變性(retinitis?pigmentosa，在本文中有時也簡稱為“RP”)是最常見的遺傳性致盲疾病，在全世界的發病率約為1/3500至1/5000，在我國的發病率約為1/3467，目前已經成為威脅全球青年和中年人群視覺功能和質量的主要眼部疾病。RP是由于視網膜感光細胞(包括視錐細胞和視桿細胞以及視網膜色素上皮細胞)的變性，外層視網膜進行性退化而導致的眼底病。RP的遺傳方式表現為多種形式，其中常染色體顯性遺傳(autosoma?dominant?retinitis?pigmentosa，簡稱為ADRP)約占發病率的15-20％、常染色體隱性遺傳(autosoma?recessive?retinitis?pigmentosa，簡稱為ARRP)占20-25％、X連鎖遺傳(X-linked?retinitis?pigmentosa，簡稱為XLRP)占10-15％、其余40-55％不能確定其遺傳方式。到目前為止，通過連鎖分析或候選基因篩選已經確定了19個ADRP基因位點，26個ARRP基因位點，6個XLRP基因位點，其中43個基因已經得到克隆(RetNet：http://www.sph.uth.tmc.edu/retnet/sum-dis.htm)。雖然在每種遺傳方式中均發現了一些致病基因，但仍存在著相當一部分未知致病基因位點，預計在人類中可能仍然存在70多個位點與RP相關。

因而，目前對原發性視網膜色素變性疾病的研究仍有待深入。

發明內容

本發明旨在至少解決現有技術中存在的技術問題之一。為此，本發明的一個目的在于提出一種能夠有效篩選易感原發性視網膜色素變性疾病的生物樣品的方法。

本發明是基于發明人的下列工作而完成的：發明人通過高通量外顯子組測序聯合候選基因突變驗證的方法確定了原發性視網膜色素變性疾病(RP，尤其是ADRP)新的致病基因突變(SNRNP200c.2653C＞G?p.Q885E)。

根據本發明的第一方面，本發明提出了一種分離的編碼SNRNP200突變體的核酸。根據本發明的實施例，該核酸與SEQ?ID?NO：1相比，具有c.C2653G突變。根據本發明的實施例，發明人確定了SNRNP200的新突變體，該新突變體與原發性視網膜色素變性疾病(RP，尤其是ADRP)的發病密切相關，從而通過檢測該新突變體在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否易感原發性視網膜色素變性疾病。

根據本發明的第二方面，本發明提出了一種分離的多肽。根據本發明的實施例，該多肽與SEQ?ID?NO：2相比，具有p.Q885E突變。通過檢測生物樣品中是否表達該多肽，可以有效地檢測生物樣品是否易感原發性視網膜色素變性疾病。

根據本發明的第三方面，本發明提出了一種篩選易感原發性視網膜色素變性疾病的生物樣品的方法。根據本發明的實施例，該方法包括以下步驟：從所述生物樣品提取核酸樣本；確定所述核酸樣本的核酸序列；所述核酸樣本的核酸序列與SEQ?ID?NO：1相比，具有c.C2653G突變是所述生物樣品易感原發性視網膜色素變性疾病的指示。通過根據本發明實施例的篩選易感原發性視網膜色素變性疾病的生物樣品的方法，可以有效地篩選易感原發性視網膜色素變性疾病的生物樣品。

根據本發明的第四方面，本發明提出了一種篩選易感原發性視網膜色素變性疾病的生物樣品的系統。根據本發明的實施例，該系統包括：核酸提取裝置，所述核酸提取裝置用于從所述生物樣品提取核酸樣本；核酸序列確定裝置，所述核酸序列確定裝置與所述核酸提取裝置相連，用于對所述核酸樣本進行分析，以便確定所述核酸樣本的核酸序列；判斷裝置，所述判斷裝置與所述核酸序列確定裝置相連，以便基于所述核酸樣本的核酸序列與SEQ?ID?NO：1相比，是否具有c.C2653G突變，判斷所述生物樣品是否易感原發性視網膜色素變性疾病。利用該系統，能夠有效地實施前述篩選易感原發性視網膜色素變性疾病的生物樣品的方法，從而可以有效地篩選易感原發性視網膜色素變性疾病的生物樣品。