[發明專利]一種新藥創制方法

無效

• 申請號: 201210029955.0
• 申請日: 2012-02-10
• 公開（公告）號: CN102609586A
• 公開（公告）日: 2012-07-25
• 發明（設計）人: 王世范
• 申請（專利權）人: 王世范
• 主分類號: G06F17/50
• 分類號: G06F17/50
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.一種新藥創制方法，其特征在于，包括以下七步：（1）構建中醫單方或復方化合物數據庫：中醫單方或復方的選擇可以是歷代經方、古方、偏方、秘方、驗方、效方或民間方，方劑里各藥味的化學成分是通過已有的各類期刊文獻和各種網絡資源來獲得，化學成分2D或3D結構式的繪制是利用已有的各種免費或商用軟件來繪制，使用數據庫軟件將這些化合物的2D或3D結構式導入到數據庫中構建中醫單方或復方化合物數據庫；（2）構建中醫單方或復方分子雜交數據庫：利用中醫單方或復方化合物數據庫中的化合物分子為模板，利用遺傳算法中的“交叉重組”思想，使用各種免費或商用軟件，通過對中醫單方或復方化合物數據庫中的化合物分子雜交，產生大量的新化合物分子，用以模擬中醫方劑在炮制過程中可能產生的新化合物，然后將分子雜交操作產生的新化合物和中醫單方或復方化合物數據庫中的化合物合并，來構建中醫單方或復方分子雜交數據庫；（3）構建中醫單方或復方分子切割和重組數據庫：使用各種免費或商用軟件，按照逆合成分析方法和理論，以中醫單方或復方分子雜交數據庫里面的所有化合物為模板，將分子雜交數據庫里面的所有化合物分別切割成許許多多的合成子，再將這些合成子按照有機合成方法和原理重新進行相互組裝，即可獲得數量龐大的新化合物，用以模擬中藥在體內發生物理、化學或生物轉化而產生的新化合物，將這些化合物和中醫單方或復方分子雜交數據庫中的化合物合并，刪除掉重復的化合物，構建中醫單方或復方分子切割和重組數據庫，該數據庫里面的化合物群具有類聚性、多樣性、新穎性和導向性等特點；（4）構建海量化合物數據庫：重復上述（1）、（2）、（3）三步，按照一個方劑組成一個化合物數據庫，然后將每一個化合物數據庫里面的化合物分別導出為SDF格式文件，或SMI格式文件，或MDB格式文件等任何可被數據庫軟件讀寫的格式文件，全部寫入到一個數據庫中，構建海量化合物數據庫，為了方便檢索和查找，該數據庫按照年代時間順序分為戰國、秦漢、三晉、南北、隋唐、五代、宋朝、遼金、元朝、明朝、清朝、民國和當代共十三個大類，每一個大類中又按照方劑的來源分成小類，每一個小類中又按照方劑名稱的筆畫順序或拼音順序或方劑編碼順序排列；（5）計算機虛擬篩選：使用各種免費或商用軟件，對（1）、（2）、（3）、（4）中構建的化合物數據庫依次進行ADMET篩選、類藥5規則篩選、分子對接（Dock）篩選，分子對接靶標依據該方劑或中藥在臨床中治療疾病的類型并結合疾病的中西醫病理來選擇，確保有的放矢；（6）體外活性篩選：計算機虛擬篩選獲得的先導化合物，如果商業可以獲得，采用購買方式獲得，如果商業不可獲得，采用人工合成或半合成方式獲得，體外篩選靶標是結合虛擬篩選的靶標以及該方劑或中藥在臨床中治療疾病的類型和病理有目標地進行選擇，篩選靶標可以是細胞、酶、蛋白質或核酸等生物大分子；（7）體內活性評價：體外篩選獲得的高活性化合物將經歷毒性和體內活性評價，體內活性評價以市售的藥物作為陽性對照，獲得毒性低、活性高的候選藥物作為新藥進入新藥臨床前研究。

2.根據權利要求1所述的一種新藥創制方法，其特征在于，步驟（1）構建中醫單方或復方化合物數據庫時，使用的醫方可以是單方，亦可是復方；單方或復方的來源可以是經方、古方、秘方、偏方、驗方、效方、或民間方，亦可是根據上述方劑通過藥味的加減而產生的加減方。

3.根據權利要求1所述的一種新藥創制方法，其特征在于，步驟（2）構建中醫單方或復方分子雜交數據庫，是以中醫單方或復方里面的化合物分子為模板，使用可獲得的免費或商用軟件，利用遺傳算法中的“交叉重組”的思想，采用分子雜交技術，通過對中醫單方或復方化合物數據庫中的化合物分子之間的化學鍵進行比較和互換來實現的。

4.根據權利要求1所述的一種新藥創制方法，其特征在于，步驟（3）構建中醫單方或復方分子切割和重組數據庫，是以步驟（1）、（2）中的數據庫里面的化合物為基礎，使用可獲得的免費或商用軟件，采用逆合成分析法，按照逆合成方法和原理，把步驟（1）或步驟（2）中數據庫里面的化合物切割成許許多多的合成子，然后再將這些合成子按照有機合成方法和原理重新進行相互組裝來實現的。

5.根據權利要求1所述的一種新藥創制方法，其特征在于，步驟（3）構建中醫單方或復方分子切割和重組數據庫，該數據庫里面的化合物群具有類聚性、多樣性、新穎性和導向性等特點。