[發明專利]一種玉米青枯病原鐮刀菌對玉米苗期致病性的檢測方法無效
申請號: | 201210009632.5 | 申請日: | 2012-01-13 |
公開(公告)號: | CN102586428A | 公開(公告)日: | 2012-07-18 |
發明(設計)人: | 侯軍;林曉民;張建祥;張春奇;韓文忠 | 申請(專利權)人: | 河南科技大學 |
主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 洛陽公信知識產權事務所(普通合伙) 41120 | 代理人: | 苗強 |
地址: | 471000 河*** | 國省代碼: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索關鍵詞: | 一種 玉米 病原 鐮刀 苗期 致病性 檢測 方法 | ||
1.一種玉米青枯病原鐮刀菌對玉米苗期致病性的檢測方法,其特征在于,所述的檢測方法為:
步驟一、水-瓊脂混合培養基的制備
1)在1000mL水中加入17g瓊脂,加熱使瓊脂溶解,后加入1.5g的硝酸鈣、1.5g的硝酸鉀、1g的磷酸二氫銨和0.5g的硫酸鎂,攪拌均勻,形成混合液,分裝于300mL三角瓶中,每瓶100mL,丙烯膜封口,并留有排氣孔,然后將每一個含有混合液的三角瓶送入高壓滅菌鍋內,在壓強為0.14MPa,溫度為121℃,滅菌30分鐘,制得營養瓊脂培養基,備用;
2)在無菌條件下,將步驟1)中每一個滅菌后的營養瓊脂培養基中加入100mL的去離子水,然后將營養瓊脂培養基攪碎至粒徑為0.5--0.8cm的顆粒時止,混合均勻,形成水-瓊脂混合培養基,備用;
步驟二、玉米苗培養
按重量分數比取1份粒徑為0.8mm的玉米和2份濃度為0.1%的汞,將玉米在汞中浸泡10分鐘,取出,用去離子水洗滌3次,然后將洗滌后的玉米放到底層鋪有無菌濾紙的培養容器中,后在培養容器內加入無菌去離子水,去離子水的加入量淹沒濾紙時止,后將培養容器送入25℃的培養箱內,培養3-4天待玉米發芽后,將玉米芽移植到水-瓊脂混合培養基中,25℃-30℃條件下,見光培養,備用;
步驟三、鐮刀菌接種菌液制備與接種
1)在100mL的去離子水中加入20g的馬鈴薯片,煮20-30分鐘,過濾,得到濾液,后在濾液中加入2g的葡萄糖,混合均勻,然后用去離子水定容至100mL止,制得馬鈴薯液體培養基,備用;
2)在無菌條件下,在馬鈴薯液體培養基中接入一個玉米青枯病原鐮刀菌種,送入搖床上,在25℃條件下,發酵培養培養4-6天,形成玉米青枯病原鐮刀菌培養菌液,然后在玉米青枯病原鐮刀菌培養菌液中加入磁力攪拌器,轉速為150轉/分鐘,攪拌160-200分鐘,使整個菌液呈糊狀并能用玻璃吸管定量吸入狀態,后繼續培養24小時,形成鐮刀菌接種菌液,備用;
3)玉米幼苗生長至丙烯膜處,在丙烯膜上開一個玉米生長口,待玉米生長至4-5片葉子時止,在無菌條件下,向培養玉米的三角瓶內加入5-6mL步驟2)中得到的鐮刀菌接種菌液,25-30℃條件下,見光培養10天,得到感染玉米青枯病原鐮刀菌的玉米,備用;
步驟四、對感染玉米青枯病原鐮刀菌的玉米進行檢測
1)取直徑為2cm的感染玉米青枯病原鐮刀菌玉米的根部及莖部,洗凈,然后在研缽內加入取1g感染玉米青枯病原鐮刀菌玉米的根部及莖部、0.5mL的TE溶液、0.5mL的SDS溶液和2g的石英砂,研磨均勻,得到物料,備用;
2)將步驟1)中得到的物料全部轉入5mL離心管內,在65℃條件下放置10分鐘,后加入600μL濃度為7.5mol/L的乙酸銨溶液,置于0℃條件下,放置8分鐘,取出,將含有物料的5mL離心管送入離心機內,以轉速為12000轉/分鐘,離心5分鐘,得到上清液Ⅰ,在1.5mL離心管a內加入500μL的上清液Ⅰ、50μL濃度為3mol/L的NaAc和300μL的異丙醇,混合均勻,形成混合液Ⅰ,將含有混合液Ⅰ的1.5mL離心管a置于0℃條件下,放置8分鐘,取出,后將含有混合液Ⅰ的1.5mL離心管a送入離心機內,以轉速為13000轉/分鐘,離心10分鐘,得到1.5mL離心管a底部的沉淀,備用;
3)在含有沉淀的1.5mL離心管a內加入200μL的TE溶液,將沉淀溶解,后加入5μL的RNase酶,混合均勻,后置于65℃條件下,放置10分鐘,再加入200μL的氯仿-異戊醇混合液,混合均勻,形成混合液Ⅱ,將含有形成混合液Ⅱ的1.5mL離心管a送入離心機內,以轉速為12000轉/分鐘,離心5分鐘,得到上清液,在1.5mL離心管b中加入500μL的上清液Ⅱ、50μL濃度為3mol/L的NaAc和300μL的異丙醇,混合均勻,形成混合液Ⅲ,將含有混合液Ⅲ的1.5mL離心管b送入離心機內,以轉速為12000轉/分鐘,離心10分鐘,得到沉淀,備用;
4)用濃度為70%的乙醇對步驟3)中1.5mL離心管b內的沉淀洗滌1次,待乙醇揮發完畢后,在1.5mL離心管b內加入25μL的TE溶液,混合均勻,形成DNA模板,備用;
5)真菌ITS通用引物
上游引物:5ˊ-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3ˊ
下游引物:5ˊ-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3ˊ
6)在0.5ml離心管Ⅰ內加入2μL步驟一中得到的DNA模板、4.0μL的10倍緩沖液、1μL的dNTP、1μL的上游引物、1μL的下游引物、1μL的Taq聚合酶和40.0μL的去離子水,混合均勻,得到混合液Ⅳ,備用;
7)將含有混合液Ⅳ的0.5ml離心管Ⅰ放入基因擴增儀中,進行PCR擴增,PCR擴增程序為:94℃預變性5分鐘,94℃變性45秒,55℃退火45秒,72℃延伸100秒,變性、退火和延伸為一次循環,共35次循環,后72℃再次延伸10分鐘,取出,得到擴增產物,備用;
8)利用瓊脂糖凝膠電泳檢測擴增產物,在凝膠成像系統中確認擴增產物中含有551bp的目的條帶,備用;
9)用DNA凝膠回收試劑盒對擴增產物進行回收、純化
取1.5ml離心管c并稱其重量,在紫外燈下將擴增產物從步驟1)中的凝膠上切下,將切下的擴增產物放在已稱重的1.5ml離心管c中,稱取1.5ml離心管c的總重并計算出從凝膠上切下來的擴增產物的重量,然后將1.5ml離心管c中的擴增產物搗碎,按擴增產物的克數加入相同毫升數的DNA純化結合液,混合均勻,將1.5ml離心管c放置在50oC水浴中加熱至擴增產物完全融解,得到混合液Ⅴ,將混合液Ⅴ加到DNA純化柱上,DNA純化柱位于收集管中,收集管在21℃條件下放置1分鐘,將收集管放入離心機中,轉速為12000轉/分鐘,離心1分鐘后,取出含有沉淀物的DNA純化柱,倒掉收集管內的液體,向DNA純化柱上加入700微升的洗滌液,將DNA純化柱置于收集管內,后將收集管在21℃條件下放置1分鐘,后將收集管放入離心機中,轉速為12000轉/分鐘,離心1分鐘后,取出含有沉淀物的DNA純化柱,倒掉收集管內的液體,向DNA純化柱上加入500微升的洗滌液,將DNA純化柱置于收集管內,放入離心機中,轉速為12000轉/分鐘,離心1分鐘后,取出含有沉淀物的DNA純化柱,倒掉收集管內的液體,將DNA純化柱置于收集管內,然后將收集管放入離心機內,轉速13000轉/分鐘,離心1分鐘,取出DNA純化柱放置于1.5ml離心管d中,后在DNA純化柱上加入40微升洗脫液,將1.5ml離心管d在21℃條件下放置1分鐘,然后將收集管放入離心機內轉速13000轉/分鐘,離心1分鐘,取出DNA純化柱得到1.5ml離心管中d中的液體,備用;
10)將步驟9)中回收、純化后的液體進行測序,并在Genbank進行比對,確定為玉米青枯病原鐮刀菌,即玉米上感染玉米青枯病原鐮刀菌;
所述的DNA純化結合液的組成成份:每升DNA純化結合液中含有25mmol的葡萄糖、10mmol的三羥甲基氨基甲烷-鹽酸、5mmol的乙二胺四乙酸,余量為水;
所述的洗滌液的組成成份:按重量百分比洗滌液中含有8%的十二烷基磺酸鈉,余量為水;
所述的洗脫液的組成成份:每升洗脫液中含50mmol的三羥甲基氨基甲烷、10mmol的乙二胺四乙酸,余量為水;
所述的SDS裂解液的組成成份:每升SDS裂解液中含有50mM的三羥甲基氨基甲烷和10g的十二烷基硫酸鈉,余量為水;
所述的氯仿和異戊醇混合液的組成成分:按體積比氯仿和異戊醇混合液中含有24份的氯仿和1份的戊醇;
所述的TE溶液的組成成份:每升TE溶液中含有10mmol的三羥甲基氨基甲烷-鹽酸、1mmol的乙二胺四乙酸,余量為水。
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