[發(fā)明專利]同時(shí)檢測(cè)四種病毒的引物、引物對(duì)、方法及試劑盒有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201110448164.7 | 申請(qǐng)日: | 2011-12-22 |
| 公開(公告)號(hào): | CN103088150A | 公開(公告)日: | 2013-05-08 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 黃怡仁;陳郁璇 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 臺(tái)灣糖業(yè)股份有限公司 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/70 | 分類號(hào): | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C40B40/06;C12R1/94 |
| 代理公司: | 北京律盟知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 11287 | 代理人: | 章蕾 |
| 地址: | 中國(guó)臺(tái)灣地*** | 國(guó)省代碼: | 中國(guó)臺(tái)灣;71 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 同時(shí) 檢測(cè) 病毒 引物 方法 試劑盒 | ||
1.一種同時(shí)檢測(cè)植物樣本中4種病毒感染的方法,其中這些病毒為蕙蘭嵌紋病毒(Cymbidium?mosaic?virus;CyMV)、齒舌蘭輪斑病毒(Odon?tglossum?ringspot?virus;ORSV)、胡瓜嵌紋病毒(Cucumber?mosaic?virus;CMV)及番椒黃化病毒(Capsicum?chlorosis?tospovirus;CaCV),該方法包含下列步驟:
(a)提供植物樣本;
(b)提供對(duì)于CyMV、ORSV、CMV及CaCV的核酸具有專一性的引物及/或引物對(duì);
(c)利用這些引物及/或引物對(duì)在可同時(shí)擴(kuò)增這些病毒核酸的條件下對(duì)該植物樣本進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈鎖反應(yīng)(RT-PCR),以擴(kuò)增CyMV、ORSV、CMV及CaCV的特異性核酸;及
(d)檢測(cè)經(jīng)擴(kuò)增的樣本中是否含有這些病毒的核酸。
2.如權(quán)利要求1的方法,其中該CyMV的核酸來自CyMV的RNA依賴型RNA聚合酶基因、該ORSV的核酸來自O(shè)RSV的RNA依賴型RNA聚合酶基因、該CMV的核酸來自CMV的鞘蛋白基因,及該CaCV的核酸來自CaCV的核鞘蛋白基因。
3.如權(quán)利要求2的方法,其中:
該對(duì)于CyMV具有專一性的引物包括一寡核苷酸,其由下列序列組成:SEQ?ID?NO:7、SEQ?ID?NO:8的序列或與SEQ?ID?NO:7或SEQID?NO:8具90%以上同源性且與CyMV具有專一性的序列;及該對(duì)于CyMV具有專一性的引物對(duì)包括由SEQ?ID?NO:7的序列組成的寡核苷酸及由SEQ?ID?NO:8的序列組成的寡核苷酸;
該對(duì)于ORSV具有專一性的引物包括一寡核苷酸,其由下列序列組成:SEQID?NO:5、SEQ?ID?NO:6的序列或與SEQ?ID?NO:5或SEQ?ID?NO:6具90%以上同源性且與ORSV具有專一性的序列;及該對(duì)于ORSV具有專一性的引物對(duì)包括由SEQ?ID?NO:5的序列組成的寡核苷酸及由SEQ?ID?NO:6的序列組成的寡核苷酸;
該對(duì)于CMV具有專一性的引物包括一寡核苷酸,其由下列序列組成:SEQ?ID?NO:1、SEQ?ID?NO:2的序列或與SEQ?ID?NO:1或SEQ?ID?NO:2具90%以上同源性且與CMV具有專一性的序列;及該對(duì)于CMV具有專一性的引物對(duì)包括由SEQ?ID?NO:1的序列組成的寡核苷酸及由SEQ?ID?NO:2的序列組成的寡核苷酸;
該對(duì)于CaCV具有專一性的引物包括一寡核苷酸,其由下列序列組成:SEQ?ID?NO:3、SEQ?ID?NO:4的序列或與SEQ?ID?NO:3或SEQ?ID?NO:4具90%以上同源性且與CaCV具有專一性的序列;及該對(duì)于CaCV具有專一性的引物對(duì)包括由SEQ?ID?NO:3的序列組成的寡核苷酸及由SEQ?ID?NO:4的序列組成的寡核苷酸。
4.如權(quán)利要求1的方法,其進(jìn)一步包括使用內(nèi)標(biāo)引物及/或引物對(duì),該內(nèi)標(biāo)引物及/或引物對(duì)可擴(kuò)增蝴蝶蘭肌動(dòng)蛋白基因的片段,該引物及/或引物對(duì)選自由SEQ?IDNO:9、SEQ?ID?NO:10、SEQ?ID?NO:11、SEQ?ID?NO:12及在可擴(kuò)增蝴蝶蘭肌動(dòng)蛋白基因片段的條件下與SEQ?ID?NO:9、SEQ?ID?NO:10、SEQ?ID?NO:11或SEQ?ID?NO:12的互補(bǔ)序列雜交的核酸序列所組成的群。
5.如權(quán)利要求1的方法,其中該反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈鎖反應(yīng)為實(shí)時(shí)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈鎖反應(yīng)(real-time?RT-PCR)或多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈鎖反應(yīng)(multiplex?RT-PCR)。
6.如權(quán)利要求5的方法,其中該反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈鎖反應(yīng)為實(shí)時(shí)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈鎖反應(yīng),且該擴(kuò)增條件為:
-在50℃下反應(yīng)10分鐘;
-在95℃下反應(yīng)5分鐘;及
-在95℃下反應(yīng)15秒、在57℃下反應(yīng)15秒、在72℃下反應(yīng)15秒及在82℃下反應(yīng)15秒為1個(gè)循環(huán),共重復(fù)30個(gè)循環(huán)。
7.如權(quán)利要求5的方法,其中該反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈鎖反應(yīng)為多重反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈鎖反應(yīng),且該擴(kuò)增條件為:
-在42℃下反應(yīng)20分鐘;
-在94℃下反應(yīng)2分鐘;
-在95℃下反應(yīng)15秒、在57℃下反應(yīng)30秒及在72℃下反應(yīng)20秒為1個(gè)循環(huán),共重復(fù)30個(gè)循環(huán);及
-在72℃下反應(yīng)10分鐘。
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