[發(fā)明專利]檢測乙醇脫氫酶1B基因多態(tài)性的試劑盒及其擴增方法和檢測方法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201110446187.4 | 申請日: | 2011-12-28 |
| 公開(公告)號: | CN103184267A | 公開(公告)日: | 2013-07-03 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 韓俊領(lǐng);杜宏偉;周毓玲;崔麗娟 | 申請(專利權(quán))人: | 協(xié)和干細胞基因工程有限公司;天津濱海協(xié)和基因科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 天津才智專利商標代理有限公司 12108 | 代理人: | 王曉紅 |
| 地址: | 300384 天津*** | 國省代碼: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 檢測 乙醇 脫氫酶 基因 多態(tài)性 試劑盒 及其 擴增 方法 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及一種利用單管雙向等位基因特異性擴增技術(shù)結(jié)合分子開關(guān)技術(shù)檢測乙醇脫氫酶1B基因多態(tài)性的試劑盒和檢測方法,特別涉及一種檢測ADH1B基因rs1229984位點的單核苷酸多態(tài)性(SNP)的試劑盒以及PCR擴增方法,屬于生物醫(yī)學領(lǐng)域。
背景技術(shù)
乙醇脫氫酶(alcohol?dehydrogenase,ADH)介導的氧化途徑是酒精代謝的主要途徑,其多態(tài)性可以影響個體對酒精的代謝能力。ADH1B在第3外顯子處發(fā)生G143A點突變形成ADH1B*2,使得其編碼的亞單位β1的第47位的精氨酸被組氨酸替代,形成β2。ADH1B*2/*2等位基因編碼的酶活性是ADH1B*1/*1等位基因編碼的酶活性的40倍,加速了乙醇向乙醛的轉(zhuǎn)化,在短時間內(nèi)乙醛即大量累積。ADH1B基因多態(tài)性在不同種族存在差異,在亞洲人和白種人中,ADH1B*2等位基因頻率分別為60%~80%和0%~10%。
乙醇脫氫酶1B的多態(tài)性對個體的飲酒行為和多種疾病易感性有著重要的影響。具有*2/*2基因型個體由于飲酒后血中乙醛含量迅速升高,其擬交感神經(jīng)毒副作用刺激神經(jīng)組織釋放出兒茶酚胺作用于心血管系統(tǒng)和神經(jīng)系統(tǒng),誘發(fā)臉紅、惡心、頭痛等反應,這類反應引發(fā)的主觀不適感降低了個體對飲酒的興趣,促其主動放棄繼續(xù)飲酒而阻抑過度飲酒的發(fā)生,因而此基因型被認為是飲酒的天然“抑制因子”。Muramatsu等對上海人和Thomasson等對中國臺灣人的研究發(fā)現(xiàn)非飲酒者ADH1B*2等位基因頻率高于飲酒者。
飲酒不僅能引起許多社會問題,而且對機體也產(chǎn)生一定的損害,長期酗酒可誘發(fā)一系列心腦血管疾病,機體某些組織器官的損傷,對身體產(chǎn)生嚴重的損害甚至引起腫瘤的發(fā)生。飲酒的健康危害主要由酒精及其中間代謝物乙醛引起,國外動物學研究證實,酒精的中間代謝產(chǎn)物乙醛是一種肯定性的致癌劑。ADH1B*2等位基因攜帶飲酒者有顯著的肝臟酶(如堿性磷酸酶,r一谷氨酰轉(zhuǎn)移酶,丙氨酸轉(zhuǎn)氨酶)水平的升高,而這些酶與酒精性肝臟疾病的發(fā)生有關(guān);酒精中毒是導致心臟非缺氧性損傷的主要因素,乙醛的加速生成可造成心肌細胞損傷引起一系列心腦血管疾病;持續(xù)性飲酒者唾液中乙醛水平升高,還可導致上消化道腫瘤的發(fā)生。
發(fā)明內(nèi)容
人乙醇脫氫酶1B基因遺傳多態(tài)性直接或間接影響患者飲酒行為和多種疾病的發(fā)生。本發(fā)明提供一種利用單管雙向等位基因特異性擴增技術(shù)結(jié)合分子開關(guān)技術(shù)檢測乙醇脫氫酶1B基因多態(tài)性的試劑盒及其擴增方法和檢測方法。
本發(fā)明采用的技術(shù)方案:一種檢測乙醇脫氫酶1B基因多態(tài)性的試劑盒,所述試劑盒在一個PCR反應中對ADH1B基因上rs1229984SNP位點進行分型。
所述試劑盒包括檢測ADH1B基因rs1229984SNP位點的外側(cè)雙向引物和2條雙向序列特異性引物。
所述檢測ADH1B基因rs1229984SNP的引物堿基序列如下所示:
外側(cè)正向引物:AGGGTACAATACATGAGTGCCTGAATGCA
外側(cè)反向引物:GTAGGGATTAGTAGCAAAACCCTCAAA
突變型引物:AACCACGTGGTCATCTGTGC
野生型引物:TAGGTGGCTGTAGGAATCTGTCA。
所述的檢測乙醇脫氫酶1B基因多態(tài)性的試劑盒所采用的檢測方法,對受檢樣本DNA用擴增緩沖液進行擴增,擴增后經(jīng)凝膠電泳在紫外光下見到根據(jù)片段大小區(qū)分開的產(chǎn)物條帶,擴增片段由大到小依次是:內(nèi)對照459bp,野生型產(chǎn)物337bp和突變產(chǎn)物164bp,根據(jù)條帶的有無判斷SNP位點的基因型。
所述的檢測乙醇脫氫酶1B基因多態(tài)性的試劑盒的擴增方法,包括以下步驟:
預變性由1次循環(huán)構(gòu)成,其條件為:
溫度為94℃,時間為5分鐘;
PCR擴增由30次循環(huán)構(gòu)成,其條件為:
變性:溫度為94℃,時間為30秒;
退火:溫度為56℃,時間為30秒;
延伸:溫度為72℃,時間為90秒;
擴增結(jié)束后于4℃保存至電泳檢測。
本發(fā)明與現(xiàn)有技術(shù)相比具有下列優(yōu)點和效果:
(1)本發(fā)明采用單管雙向等位基因特異性擴增技術(shù),在一次PCR反應中即可判斷SNP位點的基因型,提高檢測效率降低檢測成本。
(2)本發(fā)明采用SNP敏感性分子開關(guān)技術(shù),使3’端不能與模板互補的引物所引發(fā)的擴增非成熟性終止,無法形成產(chǎn)物,避免假陽性結(jié)果的產(chǎn)生。
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