[發明專利]水稻胡麻葉斑病原菌的分子鑒定方法無效
| 申請號: | 201110383736.8 | 申請日: | 2011-11-28 |
| 公開(公告)號: | CN102399888A | 公開(公告)日: | 2012-04-04 |
| 發明(設計)人: | 郭士偉;陳洪亮;彭陳 | 申請(專利權)人: | 江蘇省農業科學院 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
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| 地址: | 210014*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 水稻 胡麻 葉斑 病原菌 分子 鑒定 方法 | ||
1.一種利用18S?rDNA和ITS長度和序列特征鑒別胡麻葉斑病原菌的方法,包括如下步驟:
(1)從待鑒定的真菌樣品中提取基因組DNA。
(2)以步驟(1)提取到的DNA樣品為模板,用針對胡麻葉斑病原菌18S?rDNA和ITS的專用引物進行聚合酶鏈式反應擴增得到待鑒定真菌的18S?rDNA和ITS片段產物。擴增18S?rDNA的正向引物P1為:5′-GTA?GTC?ATA?TGC?TTG?TCTC-3′,反向引物P2為:5′-TCC?GCA?GGT?TCA?CCT?ACGGA-3′。擴增ITS的正向引物P3為:5′-TCC?GTA?GGT?GAA?CCT?GCGC-3′,反向引物P4:5′-TCC?TCC?GCTTAT?TGA?TATGC-3′。在50μL的反應體系中完成擴增反應,以雙蒸水代替模板DNA作空白對照。
(3)如果步驟(2)能獲得擴增產物,將擴增反應得到的產物進行瓊脂糖凝膠電泳。純化含有擴增產物的電泳條帶。
(4)將步驟(3)純化后的18S?rDNA和ITS產物直接進行測序,得到待鑒定的真菌樣品的18S?rDNA和ITS的核苷酸序列。
(5)將步驟(4)獲得的核苷酸序列與SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.2中的核苷酸序列進行對比,如果吻合,則待鑒定真菌判斷為胡麻葉斑病原菌。
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