[發(fā)明專利]抗結(jié)核抑制劑篩選的靶標基因Rv0233及應用

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201110373823.5
• 申請日: 2011-11-21
• 公開（公告）號: CN103123672A
• 公開（公告）日: 2013-05-29
• 發(fā)明（設計）人: 何正國;崔濤;曾菊梅
• 申請（專利權）人: 華中農(nóng)業(yè)大學
• 主分類號: G06F19/16
• 分類號: G06F19/16;C12Q1/18;C12R1/32
• 代理公司: 武漢宇晨專利事務所 42001
• 代理人: 張紅兵

1.結(jié)核分枝桿菌基因Rv0233在篩選抗結(jié)核抑制劑靶標中的應用，其特征在于，所述的結(jié)核分枝桿菌基因Rv0233基因的核苷酸序列如序列表SEQ?ID?NO：1所示。

2.結(jié)核分枝桿菌基因Rv0233在篩選抗結(jié)核抑制劑靶標中的應用，其特征在于，該基因編碼的蛋白質(zhì)的序列如序列表SEQ.ID?NO：2所示。

3.如權利要求1或2所述的一種結(jié)核分枝桿菌Rv0233基因作為藥物靶標的應用，其特征在于包含以下步驟：

(1)從PBD蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫獲得結(jié)核分枝桿菌Rv0233蛋白質(zhì)結(jié)構，Rv0233結(jié)合肉豆蔻酸的活性空腔被選作對接化合物的活性位點；

(2)建立針對結(jié)核分枝桿菌Rv0233的計算機藥物篩選系統(tǒng)；

(3)運用步驟(2)的計算機藥物篩選系統(tǒng)針對結(jié)核分枝桿菌Rv0233蛋白質(zhì)活性位點，從ZINC數(shù)據(jù)庫中篩選出18個與結(jié)核分枝桿菌Rv0233活性位點有高親和力的化合物；

(4)利用小分子化合物進行抑菌試驗，測定有抑菌活性的小分子的最小抑菌濃度；

其中：

步驟(1)中的結(jié)核分枝桿菌Rv0233蛋白質(zhì)的序列如序列表SEQ?ID?NO：2所示；

步驟(3)的18個與結(jié)核分枝桿菌Rv0233活性位點有高親和力的化合物如下所述，且具有以下特征：

化合物36#

英文名稱：N～1～-(4-ethylphenyl)-N～2～-(3-hydroxypropyl)ethanediamide

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC02025188；

化合物37#

英文名稱：N′-[2-(4-chlorophenoxy)acetyl]-2-furohydrazide

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC00323962；

化合物38#

英文名稱：N-(2-chloroethyl)-5-ethoxy-1H-benzimidazol-2-amine

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC02026089；

化合物39#

英文名稱：4-[(hexylsulfonyl)methyl]benzaldehyde

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC02028789；

化合物40#

英文名稱：N-[3-(1H-imidazol-4-yl)propyl]-N′-methylthiourea

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC05833911；

化合物41#

英文名稱：2-(4-methyl-1-piperazinyl)acetohydrazide

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC19802145；

化合物42#

英文名稱：N-benzyl-N-{6-[(2-chloroethyl)amino]hexyl}amine

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC02029196；

化合物43#

英文名稱：6-(3，4-dihydro-2(1H)-isoquinolinyl)hexylamine

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC02029199；

化合物44#

英文名稱：6-(1-piperidinyl)hexylamine

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC02029173；

化合物45#

英文名稱：2-{[6-(benzylamino)hexyl]amino}ethanol

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC02029182；

化合物46#

英文名稱：2-(4-imidazo[1，2-a]pyridin-2-ylbenzylidene)hydrazinecarboximidamide

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC00337551；

化合物47#

英文名稱：6-(4-{2-[amino(imino)methyl]carbohydrazonoyl}phenyl)-7-methylimidazo[2，1-b][1，3]thiazol-7-ium

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC00337555；

化合物48#

英文名稱：1-methyl-3-[3-(1-methyl-1H-imidazol-3-ium-3-yl)propyl]-1H-imidazol-3-ium

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC19873028；

化合物49#

英文名稱：3-(dimethylamino)propyl?imidothiocarbamate

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC19802119；

化合物50#

英文名稱：

S，S-bis[2-(acetylamino)ethyl]dithiocarbonate

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC02027654；

化合物51#

英文名稱：2-({[1-(4-methylphenyl)-1H-pyrazol-4-yl]methyl}amino)ethanol

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC02025622；

化合物52#

英文名稱：2-({[1-(4-chlorophenyl)-1H-pyrazol-4-yl]methyl}amino)ethanol

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC02025602；

化合物53#

英文名稱：N-[4-(6-chloroimidazo[1，2-a]pyridin-2-yl)phenyl]acetamide

結(jié)構式：

化合物在ZINC數(shù)據(jù)庫中的編號：ZINC00333142；

其中

步驟(4)測定有抑菌活性的小分子化合物即抑制劑51#對結(jié)核分枝桿菌的最小抑菌濃度為8μg/ml。