[發(fā)明專利]奧爾森派琴蟲可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑及檢測(cè)方法有效
申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201110362400.3 | 申請(qǐng)日: | 2011-11-16 |
公開(公告)號(hào): | CN102363812A | 公開(公告)日: | 2012-02-29 |
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 謝芝勛;龐耀珊;謝麗基;謝志勤;鄧顯文;劉加波;范晴 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 廣西壯族自治區(qū)獸醫(yī)研究所 |
主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68 |
代理公司: | 廣西南寧匯博專利代理有限公司 45114 | 代理人: | 鄧曉安 |
地址: | 530001 廣西*** | 國(guó)省代碼: | 廣西;45 |
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摘要: | |||
搜索關(guān)鍵詞: | 奧爾森派琴蟲 可視化 環(huán)介導(dǎo) 等溫 擴(kuò)增 檢測(cè) 試劑 方法 | ||
1.奧爾森派琴蟲可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑,其特征在于:針對(duì)奧爾森派琴蟲的5.8S核糖體RNA與內(nèi)轉(zhuǎn)錄2間隔區(qū)序列,設(shè)計(jì)6條特異性LAMP擴(kuò)增引物,其中包括兩條外引物F3和B3、兩條內(nèi)引物FIP和BIP、兩條環(huán)引物L(fēng)F和LB,所述的F3為5'-GCAGAATTCCGTGAACCAGT-3',所述的B3為5'-GGAGGGGCTACAATACGAGA-3',所述的FIP為5'-CGGGAAGAAGAGCGACACTGAT-AAGTCTCAACGCATACTGCA-3',所述的BIP為5'-TGCTTTGTATCCCGCTTGGACT-ATACGCCTGCCTTCACAAG-3',所述的LF為5'-ACAAAGAGGAAAGATCCCCTTTG-3',所述的LB為5'-TCGGAGATAGTTCGTTATGTGCG-3'。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的奧爾森派琴蟲可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑,其特征在于:所述的擴(kuò)增引物加入反應(yīng)試劑后共同組成LAMP檢測(cè)液體系,所述的反應(yīng)試劑包括反應(yīng)緩沖液Bst?DNA?polymerase?bufferr、鏈置換DNA聚合酶、鎂離子、甜菜堿、脫氧核糖核苷三磷酸dNTPs、顏色指示劑。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的奧爾森派琴蟲可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑,其特征在于:所述的顏色指示劑為鈣黃綠素和氯化錳,或是SYBR?Green。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的奧爾森派琴蟲可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑,其特征在于:所述的LAMP檢測(cè)液體系中的各組分濃度分別為:F3?0.1μmol/L~2μmol/L,B3?0.1μmol/L?~2μmol/L,F(xiàn)IP?0.8μmol/L~16μmol/L,BIP?0.8μmol/L~16μmol/L,LF?0.4μmol/L~8μmol/L,LB?0.4μmol/L~8μmol/L,反應(yīng)緩沖液Bst?DNA?polymerase?buffer?1×、鏈置換DNA聚合酶?1U~40U、鎂離子0.6?mmol/L~7?mmol/L、甜菜堿0.1?mmol/L~2?mmol/L、脫氧核糖核苷三磷酸dNTPs?0.2?mmol/L~2?mmol/L、鈣黃綠素6μmol/L~70μmol/L和氯化錳0.05?mmol/L~1?mmol/L,或1×~10×SYBR?Green代替鈣黃綠素6μmol/L~70μmol/L和氯化錳0.05?mmol/L~1?mmol/L。
5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的奧爾森派琴蟲可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑,其特征在于:所述的LAMP檢測(cè)液體系中的各組分濃度分別為:F3?0.6μmol/L,B3?0.6μmol/L,F(xiàn)IP?4.8μmol/L,BIP?4.8μmol/L,LF?2.4μmol/L,LB?2.4μmol/L,反應(yīng)緩沖液Bst?DNA?polymerase?buffer?1×、鏈置換DNA聚合酶8U、鎂離子4mmol/L、甜菜堿0.2mmol/L、脫氧核糖核苷三磷酸dNTPs?0.8mmol/L、鈣黃綠素25μmol/L和氯化錳0.25mmol/L,或4×SYBR?Green代替鈣黃綠素25μmol/L和氯化錳0.25mmol/L。
6.一種用權(quán)利要求1~5任一所述的奧爾森派琴蟲可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)試劑的檢測(cè)方法,其特征在于:所述檢測(cè)方法的檢測(cè)步驟包括:
(1)提取待檢樣品的基因組DNA;
(2)配制LAMP檢測(cè)液體系;
(3)在LAMP檢測(cè)液體系中加入步驟(1)提取的待檢樣品基因組DNA;
(4)將步驟(3)配制的反應(yīng)體系混合均勻;
(5)將步驟(4)的反應(yīng)體系置于恒溫設(shè)備;
(6)按反應(yīng)程序進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),反應(yīng)程序依次為:?55℃~70℃??30min~120?min,?80℃~100℃??5min,10℃?5min;?
(7)反應(yīng)結(jié)束后,根據(jù)顏色反應(yīng)判斷檢測(cè)結(jié)果,判斷標(biāo)準(zhǔn)為:肉眼直接觀察或在紫外光下觀察,呈現(xiàn)黃綠色熒光的樣品判斷為奧爾森派琴蟲感染陽(yáng)性樣品,反之為陰性樣品。
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