[發明專利]牛輪狀病毒與牛冠狀病毒的檢測試劑和制備及應用方法無效
| 申請號: | 201110359424.3 | 申請日: | 2011-11-14 |
| 公開(公告)號: | CN102367491A | 公開(公告)日: | 2012-03-07 |
| 發明(設計)人: | 孟慶玲;喬軍;陳創夫;張再超;蔡擴軍;田振中;王俊偉;王為升;楊麗紅 | 申請(專利權)人: | 石河子大學 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 石河子恒智專利代理事務所 65102 | 代理人: | 朱永慧 |
| 地址: | 832000 新疆維吾*** | 國省代碼: | 新疆;65 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 輪狀病毒 冠狀病毒 檢測 試劑 制備 應用 方法 | ||
1.一種牛輪狀病毒與牛冠狀病毒的檢測試劑,其特征在于包含能擴增牛輪狀病毒VP7基因與牛冠狀病毒N基因的2對特異性引物,?其中一對是P1和P2引物擴增牛輪狀病毒VP7基因片段,擴增長度為519?bp;另一對P3和P4引物擴增牛冠狀病毒N基因片段,擴增長度為879?bp;引物序列為:
P1:?<210>1;
P2:?<210>2;
P3:?<210>3;
P4:?<210>4。
2.一種牛輪狀病毒與牛冠狀病毒的檢測試劑的制備方法,其特征在于主要包括以下步驟:
(1)、牛輪狀病毒VP7基因與牛冠狀病毒N基因保守序列的選擇:從DNA序列數據庫中下載已經公布的牛輪狀病毒VP7基因與牛冠狀病毒N基因序列,分別用基因序列分析軟件進行序列比對,選擇兩個基因保守的靶序列,其中牛輪狀病毒VP7基因擴增的靶序列(519?bp)為:<210>5;其中牛冠狀病毒N基因擴增的靶序列(879bp)為:<210>6;
(2)、特異性引物的設計及合成:
根據上述選擇的牛輪狀病毒VP7基因與牛冠狀病毒N基因的靶序列,用PCR引物設計軟件分別進行引物的設計,將設計的引物進行最佳配對篩選試驗,得到2對最佳引物:P1、P2及P3、P4,用全自動DNA合成儀進行引物的合成,P1和P2引物擴增牛輪狀病毒VP7基因片段,擴增長度為519?bp;P3和P4引物擴增牛冠狀病毒N基因片段,擴增長度為879?bp,所述引物序列為:
P1:?<210>1;
P2:?<210>2;
P3:?<210>3;
P4:?<210>4。
3.一種牛輪狀病毒與牛冠狀病毒的檢測試劑的應用方法,其特征在于主要包括以下步驟:
(1)、樣品的處理:
糞便樣品的處理,取腹瀉牛糞便,滅菌,離心,取離心液上清加入Eppendorf管中,置于冰上待用;
(2)、糞便樣品中RNA的提取;
(3)、聯合RT-PCR反應:
采用50μL?PCR反應體系,反應體系的組成為:10×PCR緩沖液5μL,25mmol/L?MgCl2?5μL,2.5mmol/L?dNTP?4μL,P1、P2?、P3、和P4(25pmol/μL)各1μL,RT?產物?2?~6?μL,Taq?DNA聚合酶(5U/μL)0.3μL,補加去離子水至50?μL,最佳循環參數均為96℃,150?s;94℃,40?s;72℃,80?s;52℃,50?s,最后72℃延伸10min;
(4)、?結果判定:
取聯合RT-PCR產物在瓊脂糖凝膠上,電泳,用溴化乙錠染色,然后在紫外光透射儀下觀察拍照,以標準DNA?marker?(D,L-2000,標準分子大小2000、1000、750、500、200、100)作參考,若電泳后,若瓊脂糖凝膠中同時出現2條核酸帶,其中一條片段大小約為519?bp,另一條片段大小約為879?bp,說明樣品中同時含有牛輪狀病毒與牛冠狀病毒;如果僅出現519?bp大小的核酸片段,則表明樣品中只含有牛輪狀病毒;如果僅出現879?bp大小的核酸片段,則表明樣品中只含有牛冠狀病毒;若不出現任何核酸片段,則表明樣品中不含有牛輪狀病毒與牛冠狀病毒。
4.如權利要求3所述的種牛輪狀病毒與牛冠狀病毒的檢測試劑的應用方法,其特征在于步驟(1)樣品的處理中具體步驟為:取腹瀉牛糞便,加入10mL離心管中,根據樣品的稀稠,加適量的滅菌的PBS,攪勻,然后12000r/min離心8min;取離心液上清1?mL加入滅菌的1.5mL的Eppendorf管中,置于冰上待用。
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