[發明專利]過表達單一MicroRNA成熟體序列的新方法有效
| 申請號: | 201110359200.2 | 申請日: | 2011-11-14 |
| 公開(公告)號: | CN103103189A | 公開(公告)日: | 2013-05-15 |
| 發明(設計)人: | 沈南;曲波 | 申請(專利權)人: | 中國科學院上海生命科學研究院 |
| 主分類號: | C12N15/113 | 分類號: | C12N15/113;C12N15/85;C12N5/10 |
| 代理公司: | 上海專利商標事務所有限公司 31100 | 代理人: | 陳靜 |
| 地址: | 200031 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 表達 單一 microrna 成熟 序列 新方法 | ||
技術領域
本發明屬于生物技術領域;更具體地,本發明涉及過表達單一MicroRNA成熟體序列的新方法。
背景技術
microRNA是一類長約22個堿基的、廣泛存在于動植物體內的內源非編碼RNA[1]。近10年來,隨著對microRNA研究的不斷深入,科學家們已經發現microRNA雖然不編碼蛋白,但是,它們可以通過堿基互補配對的方式來識別與之相對應的靶mRNA,通過抑制翻譯或是促使靶mRNA降解的方式影響基因表達[2]。microRNA能夠參與諸如生長發育、免疫防御等許多生理過程,并且microRNA的調節異常可以參與到多個疾病的病理過程[3,4]。所以,microRNA作為一種新發現的基因表達調控分子有著重要的功能。
過表達所要研究的目的基因,并觀察其產生的表型,是探索基因功能的一個不可或缺的方法。對于microRNA,過表達的方式目前主要有:轉染人工合成的microRNA類似物或microRNA莖環前體;克隆基因組中的microRNA編碼序列到過表達載體中再轉染細胞。人工合成的類似物或是前體雖然可以特異性地提高細胞中的某個microRNA的表達,但是,它只能實現瞬時表達,隨著細胞的增殖,其過表達水平會被稀釋,難以應用到需要長時間穩定表達的研究,更難以實現體內研究。通過質粒過表達的方式,尤其是通過病毒載體進行的過表達,可以實現穩定過表達,并且轉染容易,能實現體內功能的研究。
但是,目前的microRNA過表達質粒的構建,依賴于克隆基因組中的microRNA編碼序列(通常將pre-microRNA的全部序列同其上下游各一、兩百個堿基一并克隆)。每個microRNA基因經過轉錄、加工,理論上最終都能夠產生兩種具有不同成熟序列的成熟體microRNA:5p-microRNA和3p-microRNA[5]。在生理條件下,對不同的microRNA,這兩種成熟序列會以其中的一種為主進行表達(稱為miR-X),而另外的一種卻被淘汰降解豐度很低(稱為miR-X*);有時則會兩種序列共同表達并存在(分別稱為miR-X-5p和miR-X-3p)[6]。由于現有的質粒過表達策略是模擬細胞內部的microRNA轉錄和成熟的過程,而這一過程對成熟體序列有天然的選擇性,所以,不能大量地過表達水平低的miR-X*,也不能隨心所欲地單一過表達其中的一條成熟體序列(針對miR-X-5p和miR-X-3p的情況)。
然而,隨著研究深入,microRNA的功能不僅局限于早期所鑒定的表達量豐富的成熟體序列,有越來越多的研究表明,原來被認為表達豐度低的成熟體序列,在特定的條件下表達會被上調,進而發揮調節功能[7,8]。同時,由于5p-microRNA和3p-microRNA的序列差異,其功能往往是不同的。
因此,在原有質粒過表達優勢的基礎上,通過新的策略,單一地過表達microRNA成熟體序列中的一種,勢必為今后更精細的研究microRNA的功能提供了一個強有力的工具。
發明內容
本發明的目的在于提供過表達單一MicroRNA成熟體序列的新方法。
在本發明的第一方面,提供一種表達單一microRNA成熟體的方法,所述方法包括:
(1)提供一種表達構建物,所述的表達構建物含有以下結構:
5’Seq正向-Y-Seq反向3’????(I);
其中,Seq反向為該單一microRNA成熟體相應的DNA序列;Seq正向為與Seq反向互補的序列;Y為位于Seq正向和Seq反向之間的間隔序列,并且所述間隔序列與Seq正向和Seq反向不互補;式I所示的結構可形成如下所示的二級結構:
其中,“|”表示在Seq正向和Seq反向中,相應的核苷酸是配對的,在Seq正向和Seq反向之間形成氫鍵;表示在Seq正向和Seq反向中,相應的核苷酸不配對;并且,“|”和的分布構成了Seq反向與Seq正向的互補;
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