[發明專利]一種適用于PCR擴增的真菌DNA提取方法無效
| 申請號: | 201110345992.8 | 申請日: | 2011-10-29 |
| 公開(公告)號: | CN102559656A | 公開(公告)日: | 2012-07-11 |
| 發明(設計)人: | 賈愛榮;劉昌衡;孫永軍;張永剛;孟秀梅;張綿松;胡煒;劉新;袁文鵬;夏雪奎 | 申請(專利權)人: | 山東好當家海洋發展股份有限公司;山東省科學院生物研究所 |
| 主分類號: | C12N15/10 | 分類號: | C12N15/10 |
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| 地址: | 264305 山*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 適用于 pcr 擴增 真菌 dna 提取 方法 | ||
技術領域
本發明涉及一種分離、提取、純化DNA的方法,尤其涉及一種適用于PCR擴增的真菌DNA提取方法。
背景技術
隨著分子生物學學科的發展,在真菌的分子生物學研究中,快速高效地提取質量優良的DNA有著重要意義。真菌具有特殊的細胞壁結構,與其他微生物相比,其細胞壁厚,多糖含量高,所以真菌DNA的提取較為困難。目前,常用的真菌DNA提取方法是CTAB法、SDS法及試劑盒法。前兩種方法的主要技術路線是:利用液體或固體培養基培養真菌,收集菌絲,用液氮研磨破碎細胞壁,再利用各提取液提取DNA,經過純化得DNA。通過這些方法一次可提取大量DNA而且質量較好,但以上這些方法有一定的缺點:一是液氮容易凍傷皮膚,一些地方液氮和干冰不容易獲得而受到限制;二是費時,效率不高;三是所用設備和藥品相對較多。試劑盒法提取DNA效率高、質量好、操作簡單,但是成本較高,不適合大規模使用,而且多數只適合小量制備。
另外,現有的真菌DNA提取方法步驟大體相似,主要差別關鍵在于采用何種方法來打破細胞壁。常用的破壁方法主要有冷凍干燥研磨法、玻璃珠機械破壁法、微波法、酶解法和氯化芐法等。通常冷凍干燥研磨法多用液氮來處理,一般是直接在液氮中研磨;玻璃珠機械破壁法則加入硅膠、石英砂、玻璃珠等來幫助破壁;酶解法和氯化芐法是利用酶、氯化芐、尿素來溶解細胞壁。上述的破壁方法或存在著提取速度慢、或存在著步驟繁瑣、或存在著技術要求高的不足。因而,急需探索一種簡便快速、且費用和技術要求均較低的方法,以大量提取真菌DNA用于滿足后續的PCR擴增等常規分子生物學研究的需求。
發明內容
為了克服現有技術中的不足,本發明提供一種快速、簡便、經濟、易行的適合PCR擴增的真菌DNA提取方法。
本發明解決其技術問題所采用的技術方案是:一種適合PCR擴增的真菌DNA提取方法,包括以下步驟:
a、培養真菌,離心,收集菌絲體;
b、將所得到的菌絲體置于研磨設備中,加入TRIS飽和酚提取液,研磨至糊狀;
c、將所得到的糊狀物轉入離心管中,加氯仿-異戊醇抽提液混勻抽提蛋白,離心,取上清液;
d、將所得到的上清液加無水乙醇沉淀,離心,收集沉淀物;
e、將所得到的沉淀物采用乙醇洗滌,干燥,溶解,即得。
一種適合PCR擴增的真菌DNA提取方法,其具體步驟如下:
a、采用液體培養法培養真菌約36~72小時,控制轉速為12000~15000r/min,離心5~10min,收集菌絲體;
b、將步驟a所得到濕重為0.2~0.5g的菌絲體置于研缽,加入1ml的TRIS飽和酚提取液,研磨至糊狀;其中,所述的TRIS飽和酚提取液的pH值為8.0;
c、將步驟b所得到的糊狀物轉入微量離心管中,加0.5ml的氯仿-異戊醇抽提液振蕩混勻,抽提蛋白,其中氯仿-異戊醇抽提液的體積比:25∶1;控制轉速為12000~15000r/min,離心5~10min,取上清液;
d、將步驟c所得到的上清液轉入新離心管中,加入2倍體積的預冷無水乙醇,混勻,-20℃放置1~2小時,控制轉速為12000~15000r/min,離心5~10min,收集沉淀物;
e、將步驟d所得到的沉淀物采用濃度為70~75%的乙醇漂洗2次后,控制轉速為7500~12000r/min,離心處理3~5min,然后在超凈工作臺中鼓風干燥,加50μl的無菌去離子水溶解,即得。
上述的步驟c中將所得到的糊狀物轉入微量離心管是采用尖端剪除0.5cm的吸頭轉入。
本發明的提取真菌DNA的方法,具有以下優點:
(1)避免了使用液氮,解決了易凍傷皮膚的問題。并便于不易獲得液氮的地方使用;
(2)減少了試劑的使用,無需加入其他幫助破壁的裂解液,無需昂貴的儀器和試劑,經濟高效;
(3)快速簡便,整個提取過程中在1.5-2個小時內即可完成。
(4)該方法提取的DNA質量較好,適合作為PCR擴增的模板。
因此,與其他常用的真菌DNA提取方法相比,本發明的提取真菌DNA的方法具有簡便、高效、快速和廉價的特點,能在短時間內完成對大量樣品的提取。用此方法提取的DNA濃度和純度理想,能滿足后續的PCR擴增等常規分子生物學研究的要求,特別適合于基礎條件一般的實驗室使用。
附圖說明
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