[發明專利]一種檢測EGFR基因突變的方法及試劑盒無效
| 申請號: | 201110330795.9 | 申請日: | 2011-10-27 |
| 公開(公告)號: | CN102367479A | 公開(公告)日: | 2012-03-07 |
| 發明(設計)人: | 肖莉;陳琳玲;廖端芳;姬云;張佳;李凱 | 申請(專利權)人: | 蘇州科貝生物技術有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 蘇州創元專利商標事務所有限公司 32103 | 代理人: | 陶海鋒 |
| 地址: | 215123 江蘇省蘇*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 egfr 基因突變 方法 試劑盒 | ||
1.一種檢測EGFR基因突變的試劑盒,包括:常規PCR組件,其特征在于,還包括特異性引物;所述特異性引物包括兩條正向引物和一條反向引物,并且每一條正向引物的三末端第二個、第三個堿基為硫化修飾堿基;其中三條正向引物的序列分別具有SEQ?ID?No.1、SEQ?ID?No.2所示核苷酸序列,所述反向引物具有SEQ?ID?No.3所示核苷酸序列;所述特異性引物的核苷酸序列具體如下所示:
SEQ?ID?No.1:5’TTCCCGTCGCTATCAAAACC-3’;
SEQ?ID?No.2:5’-CGTCGCTATCAAGGAATCGAT-3’;
SEQ?ID?No.3:5’-AGTGCTGTCTCTAAGGGGC-3’;
所述常規PCR組件包括:高保真DNA聚合酶Pfu酶,含有硫酸鎂的Pfu緩沖液,dNTPs。
2.采用權利要求1所述檢測EGFR基因突變的試劑盒檢測待測樣本是否存在EGFR基因突變的方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)采用常規方法提取待測組織樣本基因組DNA;
(2)以步驟(1)所得樣本基因組DNA為模板,采用特異性引物進行多重PCR擴增,根據PCR擴增的結果判斷樣本中是否含有EGFR基因的突變,所述基因的突變包括:15nt缺失突變和18nt缺失突變;判斷規則為:如果出現擴增產物235bp,則表明樣本中含有上述15nt缺失突變;如果出現擴增產物228bp,則表明樣本中含有上述18nt缺失突變;如果沒有出現擴增產物,則表明樣本中不含上述2個缺失突變中的任意一種。
3.根據權利要求2所述檢測EGFR基因突變的試劑盒檢測待測樣本是否存在EGFR基因突變的方法,其特征在于,進行多重PCR擴增時,每25μL的多重PCR擴增體系包括:1μL樣本基因組DNA,2.5μL?10×含有硫酸鎂的Pfu緩沖液,1μL反向引物,兩條正向引物各0.5μL,0.2μLPfu酶,0.4μLdNTPs,剩下加水補足;多重PCR反應條件為:95℃預變性5分鐘,95℃變性20秒,68℃退火20秒,退火溫度每個循環遞減1℃,72℃延伸30秒,共10個循環;95℃變性20秒,55℃退火20秒,72℃延伸30秒,共35個循環,最后72℃延伸10分鐘。
4.如SEQ?ID?No.1所述的核苷酸序列。
5.如SEQ?ID?No.2所述的核苷酸序列。
6.如SEQ?ID?No.3所述的核苷酸序列。
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