[發(fā)明專利]鉑類藥物療效相關(guān)基因SNP檢測(cè)特異性序列和液相芯片

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201110301742.4
• 申請(qǐng)日: 2009-06-09
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN102312009A
• 公開(kāi)（公告）日: 2012-01-11
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 許嘉森;楊惠夷;何嘉英
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 廣州益善生物技術(shù)有限公司
• 主分類號(hào): C12Q1/68
• 分類號(hào): C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 廣州華進(jìn)聯(lián)合專利商標(biāo)代理有限公司 44224
• 代理人: 萬(wàn)志香

1.一種鉑類藥物療效相關(guān)基因SNP檢測(cè)液相芯片，其特征是，包括有：

(1).針對(duì)ERCC2基因A2282C?SNP位點(diǎn)設(shè)計(jì)的野生型和突變型特異ASPE引物對(duì)，每種ASPE引物由3’端的針對(duì)目的基因SNP位點(diǎn)的特異性序列和5’端的tag序列組成，所述野生型及突變型特異性ASPE引物對(duì)為SEQ?ID?NO.5及SEQ?ID?NO.6；

(2).分別包被有特異的anti-tag序列的微球，所述anti-tag序列能相應(yīng)地與(1)中所選tag序列互補(bǔ)配對(duì)；所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.15～SEQ?ID?NO.16中的序列；

(3).針對(duì)ERCC2基因的A2282C?SNP位點(diǎn)的目標(biāo)序列的擴(kuò)增引物。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的鉑類藥物療效相關(guān)基因SNP檢測(cè)液相芯片，其特征是，(3)中所述引物為：針對(duì)A2282C的SEQ?ID?NO.25及SEQ?ID?NO.26。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的鉑類藥物療效相關(guān)基因SNP檢測(cè)液相芯片，其特征是，(2)中所述anti-tag序列與微球連接中間還設(shè)有間隔臂序列。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的鉑類藥物療效相關(guān)基因SNP檢測(cè)液相芯片，其特征是，所述間隔臂序列為5-10個(gè)T。

5.一種鉑類藥物療效相關(guān)基因SNP檢測(cè)液相芯片，其特征是，包括有：

(1).針對(duì)每種型別的SNP位點(diǎn)分別設(shè)計(jì)的野生型和突變型特異ASPE引物，每種ASPE引物由3’端的針對(duì)目的基因SNP位點(diǎn)的特異性序列和5’端的tag序列組成，所述野生型及突變型特異性ASPE引物對(duì)為：針對(duì)ERCC2基因的A2282C的SEQ?ID?NO.5及SEQ?ID?NO.6，以及選自針對(duì)ERCC1基因的C19007T的SEQ?ID?NO.1及SEQ?ID?NO.2、針對(duì)ERCC1基因的C8092A的SEQ?ID?NO.3及SEQ?ID?NO.4、針對(duì)XRCC1基因的G1301A的SEQ?ID?NO.7及SEQ?ID?NO.8、和針對(duì)GSTP1基因的A1578G的SEQ?ID?NO.9及SEQ?ID?NO.10中的一對(duì)以上；

(2).分別包被有特異的anti-tag序列的10種微球，所述anti-tag序列與微球連接中間還設(shè)有間隔臂序列，所述anti-tag序列能相應(yīng)地與(1)中所選tag序列互補(bǔ)配對(duì)；所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.11～SEQ?ID?NO.20中的序列；

(3).擴(kuò)增出具有需要檢測(cè)的、相應(yīng)SNP位點(diǎn)的目標(biāo)序列的引物對(duì)：針對(duì)ERCC2基因A2282C的SEQ?ID?NO.25及SEQ?ID?NO.26，以及選自針對(duì)ERCC1基因的C19007T的SEQ?IDNO.21及SEQ?ID?NO.22、針對(duì)ERCC1基因的C8092A的SEQ?ID?NO.23及SEQ?ID?NO.24、針對(duì)XRCC1基因的G1301A的SEQ?ID?NO.27及SEQ?ID?NO.28、和針對(duì)GSTP1基因的A1578G的SEQ?ID?NO.29及SEQ?ID?NO.30中的一對(duì)以上。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的鉑類藥物療效相關(guān)基因SNP檢測(cè)液相芯片，其特征是，(2)中所述anti-tag序列與微球連接中間還設(shè)有間隔臂序列。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的鉑類藥物療效相關(guān)基因SNP檢測(cè)液相芯片，其特征是，所述間隔臂序列為5-10個(gè)T。

8.一種用于鉑類藥物療效相關(guān)基因SNP檢測(cè)的特異性序列，其特征是，所述特異性序列包括有針對(duì)ERCC2基因的A2282C的SEQ?ID?NO.35及SEQ?ID?NO.36。

9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的鉑類藥物療效相關(guān)基因SNP檢測(cè)液相芯片，其特征是，所述特異性序列還包括有：針對(duì)ERCC1基因的C19007T的SEQ?ID?NO.31及SEQ?ID?NO.32、針對(duì)ERCC1基因的C8092A的SEQ?ID?NO.33及SEQ?ID?NO.34、針對(duì)XRCC1基因的G1301A的SEQ?ID?NO.37及SEQ?ID?NO.38、和/或針對(duì)GSTP1基因的A1578G的SEQ?ID?NO.39及SEQ?ID?NO.40。