[發明專利]乙型肝炎病毒耐藥基因突變的檢測探針、檢測試劑盒及其檢測方法無效
| 申請號: | 201110254277.3 | 申請日: | 2011-08-30 |
| 公開(公告)號: | CN102286645A | 公開(公告)日: | 2011-12-21 |
| 發明(設計)人: | 潘加奎 | 申請(專利權)人: | 解碼(上海)生物醫藥科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 上海碩力知識產權代理事務所 31251 | 代理人: | 郭桂峰 |
| 地址: | 201203 上海市浦東新區張江*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 乙型肝炎 病毒 耐藥 基因突變 檢測 探針 試劑盒 及其 方法 | ||
1.一種乙型肝炎病毒耐藥基因突變的檢測探針,所述的耐藥基因突變位點為rtV173L、rtL179P、rtL180M、rtA181V/T、rtT184A/G/I/S、rtA194T/M、rtA200V、rtS202G/I、rtM204V/I/S、rtV207M/I/L、rtS213T、rtV214A、rtQ215S、rtN236T、rtP237H、rtN238T/D、rtK241E、rtM250V中的任意一種或幾種,其特征在于,所述的檢測探針為5’-TAGGTCTATTTACAGGCAGTTTTCG-3’。
2.一種乙型肝炎病毒耐藥基因突變的檢測試劑盒,所述的耐藥基因突變位點為rtV173L、rtL179P、rtL180M、rtA181V/T、rtT184A/G/I/S、rtA194T/M、rtA200V、rtS202G/I、rtM204V/I/S、rtV207M/I/L、rtS213T、rtV214A、rtQ215S、rtN236T、rtP237H、rtN238T/D、rtK241E、rtM250V中的任意一種或幾種,其特征在于,所述的試劑盒包含有用于擴增所述耐藥基因突變位點的PCR試劑和權利要求1所述的檢測探針,
所述的PCR試劑中包含有一對引物,其序列如下:
正向引物:5’-TTCGCAGTCCCCAACCTCCAATCAC-3’
反向引物:5’-TAGGTCTATTTACAGGCAGTTTTCG-3’。
3.一種乙型肝炎病毒耐藥基因突變的檢測方法,其特征在于,該檢測方法使用如權利要求2所述的檢測試劑盒,其包括以下步驟:
(1)取空腹受檢者血清進行DNA抽提;
(2)使用權利要求2中所述的PCR試劑對步驟(1)所提取的DNA進行PCR擴增;
(3)將步驟(2)獲得的PCR擴增產物酶解;
(4)將權利要求1所述的檢測探針與步驟(3)所獲得的酶解產物混合進行測序PCR反應;
(5)用測序儀對步驟(4)獲得的測序PCR產物進行測序,找出所述各耐藥基因突變位點所在位置的對應序列,并與所述各耐藥基因突變位點的標準序列比較,判斷是否發生突變。
4.如權利要求3所述的檢測方法,其特征在于,步驟(2)所述的PCR擴增的反應體系為:PCR?Buffer?2.5μl、2.5mM的dNTP?Mix?2.5μl、5~10U的Taq酶0.2μl、0.1ug/ul?DNA模板1μl、10uM引物各1μl、ddH2O?16.8μl;
所述的引物為權利要求2中所述的正向引物和反向引物;
反應條件為:94℃4分鐘變性和酶激活,94℃15秒變性,50℃15秒退火,72℃2分鐘延長,循環25次,最后4℃延長5分鐘以上。
5.如權利要求3或4所述的檢測方法,其特征在于,步驟(4)所述的測序PCR的反應條件為:
96℃1分鐘變性和酶激活,96℃10秒變性,50℃5秒退火,60℃4分鐘延長,循環25次,最后4℃延長5分鐘以上。
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