[發明專利]羅氏沼蝦雙順反子病毒的LAMP檢測試劑盒及檢測方法有效
| 申請號: | 201110239776.5 | 申請日: | 2011-08-19 |
| 公開(公告)號: | CN102277453A | 公開(公告)日: | 2011-12-14 |
| 發明(設計)人: | 潘曉藝;沈錦玉;郝貴杰;姚嘉赟;徐洋;尹文林;曹錚 | 申請(專利權)人: | 浙江省淡水水產研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 杭州浙科專利事務所 33213 | 代理人: | 吳秉中 |
| 地址: | 313001 浙*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 羅氏沼蝦雙 順反子 病毒 lamp 檢測 試劑盒 方法 | ||
1.羅氏沼蝦雙順反子病毒的LAMP檢測試劑盒,其特征在于包括RNA提取試劑和RT-LAMP反應試劑,
所述的RNA提取試劑含有Trizol、氯仿、異丙醇、無RNase的70%乙醇和DEPC水;
所述的RT-LAMP反應試劑含有:
1)RT-LAMP預反應液:20~25mM?pH為8.2~9.0的Tris-HC1、6~10mM硫酸鎂、10~12mM氯化鉀、8~12mM硫酸銨、0.l~0.2%?Triton?X-100或Tween?20、1~1.6?mM?dNTP、0.6~1.0?M甜菜堿、1.5~2.2?μM引物MRDV-FIP、1.5~2.2μM引物MRDV-BIP、0.15~0.3μM引物MRDV-F3、0.15~0.3μM引物MRDV-B3,?
引物MRDV-FIP核苷酸序列如SEQ?No.1所示,
引物MRDV-BIP核苷酸序列如SEQ?No.2所示,
引物MRDV-F3核苷酸序列如SEQ?No.3所示,
引物MRDV-B3核苷酸序列如SEQ?No.4所示;
2)逆轉錄酶:每微升含10個活性單位的AMV逆轉錄酶;
3)聚合酶:每微升含8個活性單位的Bst?DNA聚合酶;
4)RT-LAMP反應穩定液:由礦物油或液體石蠟油組成;
5)RT-LAMP反應顯色液:含有10?%?SYBR?Green?I的熒光染料。
2.如權利要求1所述的羅氏沼蝦雙順反子病毒的LAMP檢測試劑盒,其特征在于所述的RT-LAMP預反應液含有21~24mM?pH為8.2~9.0的Tris-HC1、7~9mM硫酸鎂、11~12mM氯化鉀、9~11mM硫酸銨、0.l~0.2%?Triton?X-100或Tween?20、1.2~1.4?mM?dNTP、0.7~0.9?M甜菜堿、1.6~2.0μM引物MRDV-FIP、1.6~2.0?μM引物MRDV-BIP、0.2~0.25?μM引物MRDV-F3、0.2~0.25?μM引物MRDV-B3。
3.如權利要求1所述的羅氏沼蝦雙順反子病毒的LAMP檢測試劑盒,其特征在于所述的RT-LAMP預反應液中還含有0.6~1.2?μM引物MRDV-LB和0.6~1.2?μM引物MRDV-LF,
引物MRDV?-LF核苷酸序列如SEQ?No.5所示,
引物MRDV?-LB核苷酸序列如SEQ?No.6所示。
4.如權利要求1或2或3所述的羅氏沼蝦雙順反子病毒的LAMP檢測試劑盒,其特征在于檢測試劑盒還具有陽性對照試樣和陰性對照試樣,所述陽性對照試樣為羅氏沼蝦雙順反子病毒基因組RNA,所述的陰性對照試樣為無核酸去離子水。
5.如權利要求3所述的羅氏沼蝦雙順反子病毒的LAMP檢測試劑盒,其特征在于所述的RT-LAMP預反應液中還含有0.8~1.0μM引物MRDV-LB和0.8~1.2μM引物MRDV-LF。
6.羅氏沼蝦雙順反子病毒的LAMP檢測方法,其特征在于包括以下步驟:
1)羅氏沼蝦RNA抽提:利用RNA提取試劑抽提羅氏沼蝦RNA;
2)羅氏沼蝦雙順反子病毒的RT-LAMP擴增:
a)根據待檢測樣品的數目,設置所需RT-LAMP反應管數N,N=樣品數+2,其中l管為陽性對照,l管為陰性對照;
b)吸取RT-LAMP預反應液的體積為N×22.5μL,加入1.5mL離心管中,然后加入NμL?Bst?DNA聚合酶和N/2?μL?AMV逆轉錄酶,混合均勻,1500~2000轉/分鐘離心10秒,取上清的混合液;
c)向上述設定的N個反應管中分別加入24uL步驟b)所得的混合液,并向N個反應管內按順序依次分別加入陰性對照、待檢模板RNA和陽性對照RNA各lμL;
d)在每個反應管中再分別加入30?u?L?RT-LAMP反應穩定液,蓋緊管蓋并做好標記,2000轉/分鐘離心5秒;
e).在61℃~67℃下恒溫反應40~70分鐘;
3)顯色檢測:
取出RT-LAMP反應管,冷卻至室溫,2000轉/分鐘離心5秒,按照陰性對照、待檢樣品和陽性對照的順序依次分別加入lμL?RT-LAMP反應顯色液,輕輕混勻,直接用肉眼觀察顏色變化。
7.如權利要求6所述的羅氏沼蝦雙順反子病毒的LAMP檢測方法,其特征在于所述的步驟1)羅氏沼蝦RNA提取包括以下步驟:取羅氏沼蝦幼體頭胸部或是成蝦鰓組織0.1~0.2g,于冰上用研磨棒研磨,加300μL?Trizol后,繼續研磨充分后加Trizol至1mL,旋渦震蕩1分鐘,室溫5分鐘,加入200μL氯仿,旋渦震蕩30秒,室溫靜置3分鐘,12000g離心10分鐘;取上層水相于新的EP管中,加入500μL異丙醇,室溫放置10分鐘后,12000g離心10min;移去上清,沉淀用70%乙醇洗滌2次,室溫干燥5~10min后以DEPC處理的去離子水重懸,得到待測羅氏沼蝦RNA。
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