[發明專利]一種假諾卡氏菌及利用其制備Deoxynyboquinone的方法

有效

• 申請號: 201110231994.4
• 申請日: 2011-08-12
• 公開（公告）號: CN102296039A
• 公開（公告）日: 2011-12-28
• 發明（設計）人: 張偲;張長生;田新朋;李蘇梅;張文軍;張海波;張光濤;尹浩;鞠建華
• 申請（專利權）人: 中國科學院南海海洋研究所
• 主分類號: C12N1/20
• 分類號: C12N1/20;C12P17/18;C12R1/01
• 代理公司: 廣州科粵專利商標代理有限公司 44001
• 代理人: 劉明星;余炳和

技術領域：

本發明屬于工業微生物領域，具體涉及一種能夠產生抗生素Deoxynyboquinone的假諾卡氏菌Pseudonocardia?sp.SCSIO?01299新種，以及利用該菌制備抗生素Deoxynyboquinone的方法。

背景技術：

Deoxynyboquinone(DNQ)是一個已經人工合成的化合物，其結構如式(I)所示，該化合物具有顯著細胞毒活性，在以產生活性氧自由基(ROS)為抗性機理的抗腫瘤藥物中，該化合物表現出優異的特征-在缺氧條件下仍顯示出較強活性，成藥潛力巨大。與之結構相近的化合物SCH?538415活性較之弱10倍(Bair，J.S，；Palchaudhuri，R.；Hergenrother，P.J.，Chemistry?and?biology?of?deoxynyboquinone，a?potent?inducer?of?cancer?cell?death.J?Am?Chem?Soc2010，132，(15)，5469-78.)。

式(I)

發明內容：

本發明的第一個目的是提供一種假諾卡氏菌Pseudonocardia?sp.SCSIO?01299，該菌于2011年7月18日保藏于中國典型培養物保藏中心(CCTCC)，地址：中國武漢市武漢大學，其保藏編號為CCTCC?NO：M?2011255。

本發明的假諾卡氏菌Pseudonocardia?sp.SCSIO?01299是從我國南海北部(E?120°0.975′，N19°0.664′)水深3258米的海底沉積物中分離獲得的。常規PCR擴增假諾卡氏菌SCSIO?01299的16S?rDNA并測序，其序列如SEQ?ID?NO.1所示，而后提交到GenBank中，得到序列號JN204514。對16S?rDNA核苷酸序列進行BLAST分析，結果顯示，該菌株與Pseudonocardia?autotrophica?IMSNU?20050^T的相似度為98％，說明該菌株SCSIO?01299為假諾卡氏菌屬。如圖1所示，通過鄰接法清晰地揭示了該菌株與一組假諾卡氏菌屬物種的系統進化關系，表明該菌屬于假諾卡氏菌屬的一種。

形態學特征和生理生化分析：

該菌屬于革蘭氏陽性，好氧放線菌，基絲微黃分枝，氣絲白色分支并分化成卷曲的孢子鏈；孢子桿狀(圖2)，長1.3-2.5μm，表面光滑。Czapek’s?agar有可溶性色素產生。能水解淀粉、纖維素、吐溫20，40，60；明膠液化、牛奶凝固和胴化陰性，H₂S產生，吐溫80水解，氧化酶和硝酸鹽還原反應陰性。接觸酶反應陽性，黑色素產生和脲酶反應陰性。可以利用D-阿拉伯糖，D-纖維二糖，草酸鹽，D-半乳糖，D-葡萄糖，肌醇，D-麥芽糖，D-甘露醇，D-甘露糖，D-棉子糖，L-鼠李糖，D-核糖，D-蔗糖，衛矛醇，D-乳糖，D-山梨糖和木糖醇，果糖和D-木糖為唯一碳源和能源生長，而不能利用D-海藻糖。pH、鹽濃度和溫度的耐受范圍分別為pH?6.0-8.0，0-15％和4-40℃。細胞壁含有meso-DAP。磷脂組分為PG，DPG，PE，PI，PIM和未知磷脂PL。優勢醌為MK-8(H4)。主要脂肪酸為i-C16:0，i-C16:1H，ai-C17:0和i-C17:1w9c。G+C摩爾含量為73.2(±0.5)％。根據以上形態學、生理學、化學等分析，其與已知最接近的菌株Pseudonocardia?autotrophica?IMSNU?20050^T有較大的差異，且基因組雜交顯示其與最相似菌株的雜交值為36％；遠低于種內差異標準的70％(Stackebrandt，E.&Ebers，J.Taxonomic?parameters?revisited：tarnished?gold?standards.Microbiol?Today.(2006).33，152-155.)；因此，綜合分析多項分類數據，鑒定此菌株為假諾卡氏菌屬(Pseudonocardia)的一個新種，并將此菌命名為：假諾卡氏菌Pseudonocardia?sp.SCSIO?01299，該菌于2011年7月18日保藏于中國典型培養物保藏中心(CCTCC)，地址：中國武漢市武漢大學，其保藏編號為CCTCC?NO：M?2011255。