[發明專利]環介導等溫擴增超級細菌NDM-1基因的引物及檢測超級細菌NDM-1基因的試劑盒及檢測方法有效
| 申請號: | 201110190462.0 | 申請日: | 2011-07-08 |
| 公開(公告)號: | CN102242210A | 公開(公告)日: | 2011-11-16 |
| 發明(設計)人: | 齊靜;劉玉慶;杜以軍;白華;駱延波;朱曉玲;胡明;胡新新;張秀美 | 申請(專利權)人: | 山東省農業科學院畜牧獸醫研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 濟南泉城專利商標事務所 37218 | 代理人: | 李桂存 |
| 地址: | 250100 山*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 環介導 等溫 擴增 超級 細菌 ndm 基因 引物 檢測 試劑盒 方法 | ||
1.一種環介導等溫擴增超級細菌NDM-1基因的引物,其特征是由一對外引物,一對內引物和一對環引物組成,其核苷酸序列分別如下:
外引物F3:5’-GGCCACACCAGTGACAAT-3’,
外引物B3:5’-GCGGAATGGTCATCACGAT-3’,
內引物FIP:5’-ACTTGGCCTTGCTGTCCTTGATGTTGGGATCGACGGCAC-3’,
內引物BIP:5’-CGCTCGGCAATCTCGGTGATGCTGGCCTTGGGGAACGC-3’,
環引物LF:5’-GCTGTAGCGAAAACCACCG-3’,
環引物LB:5’-ACACTGAGCACTACGCCG-3’,
其中,外引物與內引物的摩爾比為1:8,外引物與環引物的摩爾比為1:4。
2.一種檢測超級細菌NDM-1基因的試劑盒,其特征是包括若干個裝有反應液的LAMP反應管,?
其中,每25?μL反應液中含有:12.5?μL?2×等溫反應緩沖液、1.0?μL?Bst?DNA聚合酶、40?pmol內引物FIP、40?pmol內引物BIP、5?pmol外引物F3、5?pmol外引物B3、20?pmol環引物LF、20?pmol環引物LB,余量為滅菌雙蒸水;
其中,Bst?DNA聚合酶的活性單位為8U/μL;
2×等溫反應緩沖液中含有40?mM??pH為8.8的Tris-HCl、20?mM?KCl、16?mM?MgSO4、20?mM?(NH4)2SO4、0.2wt%?Tween20、1.6?M?甜菜堿、2.8?mM?dNTP。
3.根據權利要求2所述的試劑盒,其特征在于還包括1?μL鈣黃綠素。
4.一種檢測超級細菌NDM-1基因的檢測方法,其特征是包括以下步驟:
(1)提取待檢細菌基因組總DNA;?
(2)使用權利要求2或3所述的試劑盒進行檢測,具體操作為:將待檢細菌基因組DNA加入LAMP反應管的反應液內,混勻,同時設陰性對照和陽性對照,陽性對照中加入反應液內的為含有NDM-1基因的基因組DNA,陰性對照中加入反應液內的為滅菌雙蒸水,將LAMP反應管置水浴鍋中進行擴增,擴增條件為:65℃水浴恒溫反應35?min。
5.根據權利要求4所述的檢測方法,其特征是步驟(2)中待檢細菌基因組DNA為含DNA的濃度為0.003-300?ng/μL的DNA溶液。
6.根據權利要求4所述的檢測方法,其特征是LAMP反應管中出現白色沉淀為陽性結果,不出現白色沉淀為陰性結果。
7.根據權利要求4所述的檢測方法,其特征是在擴增反應前的反應管中加入1?μL鈣黃綠素,反應結束后擴增產物變為綠色的為陽性結果,橙色的是陰性結果。
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