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[發明專利]用于檢測豬瘟病毒野毒株的引物對、探針、以及試劑盒有效

專利信息
申請號: 201110124916.4 申請日: 2011-05-16
公開(公告)號: CN102212617A 公開(公告)日: 2011-10-12
發明(設計)人: 孫明;陳西釗;陳南華;喬明明;陳曦;田克恭 申請(專利權)人: 北京世紀元亨動物防疫技術有限公司
主分類號: C12Q1/68 分類號: C12Q1/68;C12Q1/70;C12R1/93
代理公司: 中國國際貿易促進委員會專利商標事務所 11038 代理人: 程泳
地址: 100085 北京海淀區上*** 國省代碼: 北京;11
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摘要:
搜索關鍵詞: 用于 檢測 豬瘟 病毒 野毒株 引物 探針 以及 試劑盒
【說明書】:

技術領域

本發明屬于病毒檢測領域,涉及一種用于檢測豬瘟病毒野毒株的引物對、探針、以及試劑盒。本發明還涉及一種檢測豬瘟病毒野毒株的方法以及所述的引物對、探針、或試劑盒在檢測豬瘟病毒野毒株中的用途。

背景技術

豬瘟(Classical?Swine?Fever,CSF)是由豬瘟病毒(Classical?Swine?Fever?Virus,CSFV)引起的豬的高度致死性、接觸性傳染病,在世界上許多國家和地區均有發生,國際獸疫局將其定為A類傳染病,我國《動物防疫法》將其列為一類傳染病,給各國養豬業造成巨大的經濟損失。我國政府一直都很重視豬瘟的防制工作,并對豬進行豬瘟兔化弱毒疫苗免疫,但隨著豬瘟HCLV疫苗的廣泛使用,又由于近年來我國豬瘟的流行特點以散發、慢性豬瘟、持續感染和亞臨床癥狀為主,同時存在著與其它病混合感染的狀況,因此對其診斷非常困難。目前尚沒有簡單快速試劑盒能夠檢測豬瘟病毒野毒株(除豬瘟疫苗株之外的豬瘟病毒株)感染。

實時熒光定量PCR(FQ-PCR,又稱為實時熒光RT-PCR)技術包括探針法、染料法和引物法。探針法是利用與靶序列特異雜交的探針來指示擴增產物的增加,以Taqman探針為代表,常用的熒光報告基團是FAM、VIC、JOE、HEX等;染料法是采用一種能夠與雙鏈DNA小溝結合的熒光染料,熒光信號強弱與雙鏈DNA的數量相關,可以根據熒光信號換算出PCR反應中的雙鏈DNA數量,常用的染料是SYBR?green;引物法是利用熒光標記的引物實現定量,目標特異的引物對中的一個引?物3’端用熒光報告基團標記,在沒有單鏈模板的情況下,該引物自身配對,形成發夾結構,使熒光淬滅,在模板存在的情況下,引物與模板配對,發夾結構打開,產生特異的熒光信號。

在熒光定量檢測中較常用的是Taqman探針法,根據其3’端標記的熒光淬滅基團的不同又可分為常規Taqman探針和Taqman-MGB探針兩種。常規的Taqman探針5’端標以熒光發射基團,3’端標以熒光淬滅基團,該探針在PCR過程中不能被延伸。當探針保持完整時,3’端淬滅基團抑制5’發射基團的熒光發射。在PCR的退火期,探針與引物所含序列內的DNA模板發生特異性雜交。延伸期引物在Taq酶作用下延伸,當到探針處,Taq酶發揮5’-3’外切核酸酶活性,繼而發生置換。切斷探針后,發光基團遠離淬滅基團,熒光信號得到釋放。這時熒光探測系統便會檢測到光密度有所增加。模板每復制一次,就有一個探針被切斷,并伴有一個熒光信號的釋放。由于理論上被釋放的熒光基團數目和PCR產物數量是一對一的關系,且光密度同釋放的熒光基團數目和PCR產物數量是一對一的關系,且光密度同釋放的熒光基團的數目也成正比關系,因此該技術可對模板進行準確定量。由于擴增產物較短時效率較高,故擴增長度一般為50-150bp。

Taqman-MGB探針與普通Taqman水解探針不同之處在于Taqman-MGB探針的3’端連接一個不發光的淬滅基團,同時另增加一個小溝結合物(minor?groove?binder,MGB)分子,比Taqman探針有三大優勢:一是顯著提高Tm值,可以減少探針設計長度,對AT富含區的探針設計更為有利;二是可以降低背景熒光信號,提高信噪比,使實驗結果更精確,分辨率更高;三是提高探針和互補模板的結合特異性,即使一個堿基的不匹配都能精確分辨。

目前檢測豬瘟病毒的病原學診斷技術有病毒分離法、免疫熒光技術、兔體交互免疫試驗、ELISA抗原捕獲、RT-PCR技術和實驗動物法等。以上幾種方法及其不太成熟的試劑盒通常存在靈敏度低、特異性差、耗時、無法區分免疫群與感染群等諸多問題,不能為我國快速、有效地監控豬瘟疫情提供強有力的技術支持。

公開號為CN101328506A和CN101812539A的專利申請公開了檢測豬瘟病毒的試劑盒。但是檢測的敏感性有待于進一步提高。此外,CN101328506A中公開的試劑盒生產成本高并且操作繁瑣。

因此,亟需一種敏感性高、特異性強、并且快速簡便的檢測“豬瘟病毒野毒株”的產品和方法。

發明內容

本發明人經過創造性的勞動和大量的試驗,得到了能夠用于檢測豬瘟病毒野毒株的引物對和探針,并且驚奇地發現,所述引物對和探針檢測豬瘟病毒野毒株的特異性強、靈敏度高。由此提供了下述發明:

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