[發明專利]一種檢測RNA病毒hMPV的方法、試劑盒及應用無效
| 申請號: | 201110115340.5 | 申請日: | 2011-06-16 |
| 公開(公告)號: | CN102827946A | 公開(公告)日: | 2012-12-19 |
| 發明(設計)人: | 鄭麗舒;王翔;侯云德 | 申請(專利權)人: | 中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所;北京金迪克生物技術研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京元中知識產權代理有限責任公司 11223 | 代理人: | 王明霞 |
| 地址: | 100052 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 rna 病毒 hmpv 方法 試劑盒 應用 | ||
1.一種利用逆轉錄等溫擴增技術檢測RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,所述的檢測方法包括以下步驟:根據人偏肺病毒的N基因的相對保守區,分別設計了六條引物,包括兩條外引物F3、B3和兩條內引物FIP、BIP,兩條環結合引物LF、LB;處理待測標本,提取樣本的RNA后,進行RT-LAMP反應;然后通過電泳檢測或肉眼觀察,最終得到檢測結果;
其中,所述的引物的核苷酸序列為:
外引物F3的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1所示,或由SEQ?ID?NO:1所示的核苷酸序列經取代、缺失、添加形成的核苷酸序列;,
外引物B3的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:2所示,或由SEQ?ID?NO:2所示的核苷酸序列經取代、缺失、添加形成的核苷酸序列:
內引物FIP(F1c+F2)的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:3所示,或由SEQ?ID?NO:3所示的核苷酸序列經取代、缺失、添加形成的核苷酸序列:
內引物BIP(B1c+B2)的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:4所示,或由SEQ?ID?NO:4所示的核苷酸序列經取代、缺失、添加形成的核苷酸序列:
環引物LF的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:5所示,或由SEQ?ID?NO:5所示的核苷酸序列經取代、缺失、添加形成的核苷酸序列:
環引物LB的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:6所示,或由SEQ?ID?NO:6所示的核苷酸序列經取代、缺失、添加形成的核苷酸序列。
2.根據權利要求1所述的利用逆轉錄等溫擴增技術檢測RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,所述RT-LAMP的反應體系為:
Bst?DNA聚合酶緩沖液(10×),2.5μl;
BstDNA聚合酶(8u/μl),1μl;
AMV反轉錄酶(10u/μl),1μl;
dNTP(10mM),2.5μl;
Betaine(25mM),1μl;
MgCl2(150mM),1μl;
外引物F3、B3(5μM),各1μl;
內引物FIP、BIP(10μM),各1μl;
環引物LF、LB(20μM),各1μl;
DNA,1μl;
ddH2O,9μl;
總體積25μl。
3.根據權利要求1所述的利用逆轉錄等溫擴增技術檢測RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,所述RT-LAMP的反應條件為60~68℃恒溫反應1~2h,優選65℃恒溫1.5h;然后75~85℃滅活3~10min,優選80℃滅活5min。
4.根據權利要求1所述的利用逆轉錄等溫擴增技術檢測RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,所述提取樣本RNA的方法為:以hMPV陽性RNA核酸為模板,使用兩步法反轉錄試劑盒先進行第一步反轉錄以獲取cDNA;以cDNA為模板并RT-PCR引物進行PCR反應,擴增條件為:95℃預變性5min,95℃變性30s,52℃退火30s,72℃延伸35s,35個循環,72℃延伸10min,4℃保存;
其中,RT-PCR引物F的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:7所示,或由SEQ?ID?NO:7所示的核苷酸序列經取代、缺失、添加形成的核苷酸序列;
RT-PCR引物R的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:8所示,或由SEQ?ID?NO:8所示的核苷酸序列經取代、缺失、添加形成的核苷酸序列。
5.根據權利要求1所述的利用逆轉錄等溫擴增技術檢測RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,所述的電泳采用1%瓊脂糖凝膠電泳,陽性結果在416bp處產生條帶。
6.根據權利要求1所述的利用逆轉錄等溫擴增技術檢測RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,采用肉眼檢測,渾濁有白色沉淀的為陽性,清亮透明的為陰性。
7.根據權利要求1所述的利用逆轉錄等溫擴增技術檢測RNA病毒hMPV的方法,其特征在于,采用肉眼檢測,在RT-LAMP的反應體系加入羥基萘酚蘭,陽性反應呈藍色,陰性反應呈紫色。
8.一種檢測檢測RNA病毒hMPV的試劑盒,其特征在于,所述的試劑盒中包括病毒RNA提取試劑盒、RT-LAMP的反應體系、定量參考品、陰性質控品、陽性質控品。
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