[發明專利]檢測重度抑郁關聯基因的試劑盒及其制備方法無效
| 申請號: | 201110109934.5 | 申請日: | 2011-04-29 |
| 公開(公告)號: | CN102191329A | 公開(公告)日: | 2011-09-21 |
| 發明(設計)人: | 師詠勇;王倜;賀林;陳培華 | 申請(專利權)人: | 上海交通大學;上海佰真生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海交達專利事務所 31201 | 代理人: | 王錫麟;王桂忠 |
| 地址: | 200240 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 檢測 重度 抑郁 關聯 基因 試劑盒 及其 制備 方法 | ||
1.一種檢測重度抑郁關聯基因的試劑盒,其特征在于,包括:PCR試劑組和LDR試劑組,兩個試劑組包裝在同一個盒子中,PCR試劑組,包括:緩沖液、dNTP混合液、Taq?DNA聚合酶、純水和四對PCR專用擴增引物;LDR試劑組,包括:緩沖液、dNTP混合液、Taq?DNA連接酶、純水和四組LDR專用探針。
2.根據權利要求1所述的檢測重度抑郁關聯基因的試劑盒,其特征是,所述的PCR試劑組,dNTP混合液的濃度為10mM,Taq?DNA聚合酶的濃度為2unit/ul,四對PCR擴增引物為2OD的干粉,使用時,先8000rpm離心十分鐘,然后加入純水溶解,震蕩均勻后使用。
3.根據權利要求書1中所述的檢測重度抑郁關聯基因的試劑盒,其特征是,所述的LDR試劑組,Taq?DNA聚合酶的濃度為40unit/ul,四對PCR擴增引物為2OD的干粉,使用時,先8000rpm離心十分鐘,然后加入純水溶解,混合均勻后使用。
4.一種根據權利要求1所述的檢測重度抑郁關聯基因的試劑盒的制備方法,其特征在于,包括以下步驟:
①PCR引物的設計及合成:PCR引物采用引物設計軟件PRIMER3進行引物設計,TM值選擇60度左右;
②LDR探針的設計及合成:LDR探針每個位點包括三條,兩條5’端探針和一條3’端探針;
③Taq?DNA聚合酶和Taq?DNA連接酶采用TAKARA的產品或New?England?Biolabs的產品。
5.根據權利要求4所述的檢測重度抑郁關聯基因的試劑盒的制備方法,其特征是,所述的LDR探針:兩條5’端探針長度相差2個堿基,反映在該探針的5’端。
6.根據權利要求4所述的檢測重度抑郁關聯基因的試劑盒的制備方法,其特征是,所述的LDR探針:兩條5’端探針的3’端的最后一個堿基根據SNP位點的基因型確定。
7.根據權利要求4所述的檢測重度抑郁關聯基因的試劑盒的制備方法,其特征是,所述的LDR探針:兩條5’端探針在距3’端6個堿基的位置認為引入與目標序列不互補的一個堿基。
8.根據權利要求4所述的檢測重度抑郁關聯基因的試劑盒的制備方法,其特征是,所述的LDR探針:5’端探針的5’末端及3’端探針的3’末端均采用polyT的序列。
9.根據權利要求4所述的檢測重度抑郁關聯基因的試劑盒的制備方法,其特征是,所述的LDR探針:除上述三點描述外,5’端探針的其他位置與目標序列完全互補。
10.根據權利要求4所述的檢測重度抑郁關聯基因的試劑盒的制備方法,其特征是,所述的LDR探針:3’端探針與目標序列完全互補,且在其5’端加磷酸修飾,其3’端加FAM熒光修飾。
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