[發(fā)明專利]高特異性檢測(cè)NDM-1基因的引物組合物及其應(yīng)用

無(wú)效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201110108513.0
• 申請(qǐng)日: 2011-04-28
• 公開（公告）號(hào): CN102181558A
• 公開（公告）日: 2011-09-14
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 朱寶利;武娜;張?jiān)封?/a>;王志云
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 中國(guó)科學(xué)院微生物研究所
• 主分類號(hào): C12Q1/68
• 分類號(hào): C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/55;C12N9/80
• 代理公司: 北京紀(jì)凱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11245
• 代理人: 關(guān)暢

1.輔助檢測(cè)NDM-1蛋白的編碼基因的專用引物，由序列表的序列1所示DNA、序列表的序列2所示DNA、序列表的序列3所示DNA、序列表的序列4所示DNA、序列表的序列5所示DNA和序列表的序列6所示DNA組成；

所述NDM-1蛋白是如下(a)或(b)的蛋白質(zhì)：

(a)由序列表中序列7所示的氨基酸序列組成的蛋白質(zhì)；

(b)將序列7的氨基酸序列經(jīng)過(guò)一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列7衍生的蛋白質(zhì)。

2.一種輔助檢測(cè)NDM-1蛋白的編碼基因的試劑盒，包括權(quán)利要求1所述的專用引物；

所述NDM-1蛋白是如下(a)或(b)的蛋白質(zhì)：

(a)由序列表中序列7所示的氨基酸序列組成的蛋白質(zhì)；

(b)將序列7的氨基酸序列經(jīng)過(guò)一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列7衍生的蛋白質(zhì)。

3.權(quán)利要求1所述專用引物在制備輔助檢測(cè)NDM-1蛋白的編碼基因的試劑盒中的應(yīng)用；

所述NDM-1蛋白是如下(a)或(b)的蛋白質(zhì)：

(a)由序列表中序列7所示的氨基酸序列組成的蛋白質(zhì)；

(b)將序列7的氨基酸序列經(jīng)過(guò)一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列7衍生的蛋白質(zhì)。

4.權(quán)利要求1所述專用引物或權(quán)利要求2所述試劑盒在輔助檢測(cè)NDM-1蛋白的編碼基因中的應(yīng)用；

所述NDM-1蛋白是如下(a)或(b)的蛋白質(zhì)：

(a)由序列表中序列7所示的氨基酸序列組成的蛋白質(zhì)；

(b)將序列7的氨基酸序列經(jīng)過(guò)一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列7衍生的蛋白質(zhì)。

5.權(quán)利要求1所述專用引物或權(quán)利要求2所述試劑盒在輔助鑒定含有NDM-1蛋白的編碼基因的生物樣本中的應(yīng)用；

所述NDM-1蛋白是如下(a)或(b)的蛋白質(zhì)：

(a)由序列表中序列7所示的氨基酸序列組成的蛋白質(zhì)；

(b)將序列7的氨基酸序列經(jīng)過(guò)一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列7衍生的蛋白質(zhì)。

6.如權(quán)利要求1所述的專用引物，如權(quán)利要求2所述的試劑盒，或如權(quán)利要求3至5中任一所述的應(yīng)用，其特征在于：所述NDM-1蛋白的編碼基因?yàn)槿缦?1)或(2)或(3)或(4)所述的DNA分子：

(1)序列表中序列8所示的DNA分子；

(2)序列表的序列8自5’末端第14至826位核苷酸所示的DNA分子；

(3)在嚴(yán)格條件下與(1)或(2)限定的DNA序列雜交且編碼相同功能蛋白的DNA分子；

(4)與(1)或(2)限定的DNA序列至少具有90％以上同源性且編碼相同功能蛋白的DNA分子。

7.一種輔助鑒定待測(cè)生物樣本是否含有NDM-1蛋白的編碼基因的方法，包括如下步驟：

(1)提取所述待測(cè)生物樣本的基因組DNA；

(2)以步驟(1)的基因組DNA為模板，用權(quán)利要求1所述的專用引物進(jìn)行環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增；

(3)根據(jù)步驟(2)的擴(kuò)增產(chǎn)物鑒定所述待測(cè)生物樣本是否含有NDM-1蛋白的編碼基因；

所述NDM-1蛋白是如下(a)或(b)的蛋白質(zhì)：

(a)由序列表中序列7所示的氨基酸序列組成的蛋白質(zhì)；

(b)將序列7的氨基酸序列經(jīng)過(guò)一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列7衍生的蛋白質(zhì)。

8.如權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于：所述NDM-1蛋白的編碼基因?yàn)槿缦?1)或(2)或(3)或(4)所述的DNA分子：

(1)序列表中序列8所示的DNA分子；

(2)序列表的序列8自5’末端第14至826位核苷酸所示的DNA分子；

(3)在嚴(yán)格條件下與(1)或(2)限定的DNA序列雜交且編碼相同功能蛋白的DNA分子；

(4)與(1)或(2)限定的DNA序列至少具有90％以上同源性且編碼相同功能蛋白的DNA分子。

9.如權(quán)利要求7或8所述的方法，其特征在于：所述環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增的反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃1小時(shí)，80℃5分鐘。

10.如權(quán)利要求7或8或9所述的方法，其特征在于：所述環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增的反應(yīng)體系中，序列表的序列1所示DNA和序列表的序列2所示DNA的濃度均為0.2μmol/L，序列表的序列3所示DNA和序列表的序列4所示DNA的濃度均為1.6μmol/L，序列表的序列5所示DNA和序列表的序列6所示DNA的濃度均為0.8μmol/L。