[發明專利]熒光定量RT-PCR檢測鴨源性冠狀病毒的引物、探針及試劑盒有效
| 申請號: | 201110103579.0 | 申請日: | 2011-04-25 |
| 公開(公告)號: | CN102181583A | 公開(公告)日: | 2011-09-14 |
| 發明(設計)人: | 劉興友;劉明成;王麗榮;胡建和 | 申請(專利權)人: | 河南科技學院 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64;C12R1/93 |
| 代理公司: | 鄭州大通專利商標代理有限公司 41111 | 代理人: | 樊羿 |
| 地址: | 453003 河南省新鄉*** | 國省代碼: | 河南;41 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 熒光 定量 rt pcr 檢測 鴨源性 冠狀病毒 引物 探針 試劑盒 | ||
1.一種熒光定量RT-PCR檢測鴨源性冠狀病毒的引物及探針,其核苷酸序列如下:
上游引物:5'-AGGTAGTGGTGTTCCTGATAATGAG-3’,
下游引物:5'-ACGCATCTGGGACTGGTTTTC-3',
探針引物:5'-CCTGGCTTATACCTGGCTTGGCGTCT-3'。
2.根據權利要求1所述的熒光定量RT-PCR檢測鴨源性冠狀病毒的引物及探針,其特征在于,與所述上、下游引物相對應的鴨源性冠狀病毒ZZ2004的DNA特征片段的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1所示;與所述探針引物相對應的鴨源性冠狀病毒ZZ2004的DNA特征片段的核苷酸序列如SEQ?ID?NO:2所示。
3.根據權利要求1所述的熒光定量RT-PCR檢測鴨源性冠狀病毒的引物及探針,其特征在于,所述上游引物和下游引物對鴨源性冠狀病毒ZZ2004株RT-PCR擴增出約117bp的產物。
4.權利要求1所述的熒光定量RT-PCR檢測引物及探針在對鴨源性冠狀病毒ZZ2004的鑒別和定量檢測中的應用。
5.一種熒光定量RT-PCR檢測鴨源性冠狀病毒的試劑盒,其特征在于,含有權利要求1所述的所有引物及探針。
6.根據權利要求5所述的熒光定量RT-PCR檢測鴨源性冠狀病毒的試劑盒,其特征在于,含有熒光定量RT-PCR反應體系,以單樣份計量,該熒光定量RT-PCR反應體系包括:
RNase?Free?ddH2O?17.75μL、25μmol/L的dNTP?Mixture?1μL、10×PCR?Buffer?Mg2+?2.5μL、10μmol/L的上游引物F3?0.25μL、10μmol/L的下游引物F40.25μL、10μmol/L的探針引物0.5μL、5U/μL的?rTaq?0.25μL,且檢測時使加入待測樣液后的RT-PCR反應體系總體積為25μL。
7.根據權利要求6所述的熒光定量RT-PCR檢測鴨源性冠狀病毒的試劑盒,其特征在于,所述待測樣液的制備方法如下:
(1)取相應的待檢組織器官,剪碎放入無菌離心管中,按1g:5mL的比例加入經高壓滅菌PBS緩沖液,?-20℃下反復凍融2~3次,1000rpm離心5~8min;棄沉淀,取上清于另一無菌離心管中,8000rpm離心8~12min;棄沉淀,取上清于另一無菌離心管中,12000rpm離心8~12min;棄沉淀,取上清于另一無菌離心管中,用0.22μm的濾器過濾,得濾液;
(2)用RNA提取試劑提取RNA,再進行一步法反轉錄反應,反應體系為:5×Buffer?2μL、?Enzzyme?Mix?0.5μL、Random?6?mers??0.5μL、Oligo?dT?primer?0.5μL、Totall?RNA?5μL、RNase?Free?ddH20?1.5μL,總體積為10μL,反應條件為:37℃、15min,85℃、5s。
8.根據權利要求6所述的熒光定量RT-PCR檢測鴨源性冠狀病毒的試劑盒,其特征在于,以所述試劑盒對待測樣液進行TaqMan熒光定量RT-PCR擴增時的反應條件為:
94℃??30s,
94℃??10s????????????????????????????????????????????????????60℃??1min???????????40?cycle。
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