[發(fā)明專(zhuān)利]一種基于核酸橫向流試紙條檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性的方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201010608280.6 | 申請(qǐng)日: | 2010-12-28 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN102134596A | 公開(kāi)(公告)日: | 2011-07-27 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 毛紅菊;鄒能利;金慶輝;趙建龍 | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人: | 中國(guó)科學(xué)院上海微系統(tǒng)與信息技術(shù)研究所 |
| 主分類(lèi)號(hào): | C12Q1/68 | 分類(lèi)號(hào): | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海泰能知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所 31233 | 代理人: | 黃志達(dá);謝文凱 |
| 地址: | 200050 *** | 國(guó)省代碼: | 上海;31 |
| 權(quán)利要求書(shū): | 查看更多 | 說(shuō)明書(shū): | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 核酸 橫向 試紙 檢測(cè) 核苷酸 多態(tài)性 方法 | ||
1.一種基于核酸橫向流試紙條檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性的方法,包括:
(1)將含有毛細(xì)管的膜粘貼在襯墊紙板上,再把吸收區(qū)放置在含有毛細(xì)管的膜之上,重疊1-2mm;再把結(jié)合區(qū)放置在含有毛細(xì)管的膜之上,重疊1-2mm;最后把浸入?yún)^(qū)放置在結(jié)合區(qū)之上,重疊1-2mm,得核酸橫向流試紙條;所述含有毛細(xì)管的膜上有以捕獲DNA探針包被的兩條檢測(cè)線和一條質(zhì)控線;
(2)取1μL待測(cè)樣本,在PCR儀中95℃變性4min,再放入-20℃冰盒退火3min;
取水4μL、納米金探針溶液2μL、連接探針Z-KIF-1和Z-KIF-2各1μL、Taq?DNA連接酶緩沖液1μL和濃度為1個(gè)單位的Taq?DNA連接酶1μL,用移液槍打勻,得混合液;向混合液中加入1μL的KIF-1、KIF-2或它們的混合液,用移液槍打勻;然后加入上述處理后的待測(cè)樣本,用移液槍打勻,之后再PCR儀中45℃雜交連接30分鐘,再95℃變性4min,再放到-20℃冰盒中退火3min,最后將所得溶液滴加在上述核酸橫向流試紙條的結(jié)合區(qū),迅速將試紙條浸入?yún)^(qū)浸入運(yùn)行緩沖液中,在液體到達(dá)吸收區(qū)時(shí)平放試紙條,10min后觀察現(xiàn)象。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于核酸橫向流試紙條檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征在于:所述步驟(1)中含有毛細(xì)管的膜的成分為硝酸纖維素膜;結(jié)合區(qū)的成分為聚脂纖維;浸入?yún)^(qū)的成分為玻璃纖維;吸收區(qū)的成分為吸水紙。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于核酸橫向流試紙條檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征在于:所述步驟(1)中含有毛細(xì)管的膜上包被的是捕獲DNA探針,其序列為一個(gè)或幾個(gè)通用序列,利用DNA的雜交捕獲檢測(cè)探針上與其互補(bǔ)的通用序列;質(zhì)控線上包被的是質(zhì)控探針Control?Probe,而兩條檢測(cè)線上分別包被了不同的捕獲探針:ZW-T和ZM-T;其中捕獲DNA探針濃度為20μM/L,包被捕獲DNA探針用量為1μL/mm,捕獲探針被溶解在含2%蔗糖和5%甲醇的溶液中。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種基于核酸橫向流試紙條檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征在于:所述捕獲探針ZW-T的序列為5’-TGCGGGTAATCG-TTTTTTTTTTTTTTTT-3’,捕獲探針ZM-T的序列為5’-CAGCATCGTGCG-TTTTTTTTTTTTTTTT-3’,質(zhì)控探針Control?Probe的序列為5‘-AGAGGAGTTGGGACC-AAAAAAAAAAAAAAA-3’。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于核酸橫向流試紙條檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征在于:所述步驟(2)中待測(cè)樣本的制備:采用裂解法抽提血清樣品中KIF6基因組DNA,然后對(duì)KIF6?DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,即得;其中PCR擴(kuò)增體系為:10×緩沖液1.5μl,Taq酶,25mmol/L?MgCl2?0.8μl、25mmol/L?dNTP?1μl,上下游引物各0.5μl,引物終濃度為0.5pmol/L;擴(kuò)增條件:94℃變性4分鐘;94℃30秒,55℃30秒,72℃30秒,35個(gè)循環(huán),72℃延伸4分鐘。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于核酸橫向流試紙條檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征在于:所述步驟(2)中的納米金探針的序列為5’-PO4-GGTCCCAACTCCTCT-TTTTTTTTTTTTTTT-(CH2)3-SH-3’;連接探針Z-KIF-1序列為5’-CGATTACCCGCA?ACTCCCAGCATGAAC-3’,連接探針Z-KIF-2的序列為5’-CGCACGATGCTG?ACTCCCAGCATGAAT-3’;Target?DNA?KIF-1的序列為5′-AGAGGAGTTGGGACCGTTCATGCTGGGAGT-3′,TargetDNA?KIF-2的序列為5′-AGAGGAGTTGGGACCATTCATGCTGGGAGT-3′。
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于核酸橫向流試紙條檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征在于:所述步驟(2)中的運(yùn)行緩沖液的成分為50mM/L的Tris-HCl,50mM/L的NaCl,2ml/L的Tween-20和0.5g/L的十二烷基硫酸鈉。
8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于核酸橫向流試紙條檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征在于:所述步驟(2)中的Taq?DNA連接酶緩沖液成分為200mmol/L的Tris-HCl,250mmol/L的KAcO,100mmol/L的MgAcO,10mmol/L的NAD,1%的Triton?X-100,pH7.6@25℃。
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