[發明專利]一種STK39基因SNP檢測特異性引物和液相芯片

有效

• 申請號: 201010590874.9
• 申請日: 2010-12-16
• 公開（公告）號: CN102559851A
• 公開（公告）日: 2012-07-11
• 發明（設計）人: 許嘉森;秦會娟;郭婧;朱澤堯
• 申請（專利權）人: 廣州益善生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224
• 代理人: 萬志香;胡杰

1.一種STK39基因SNP檢測液相芯片，其特征是，主要包括有：

(A).針對每種SNP位點分別設計的野生型和突變型的ASPE引物：每種ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對目的基因突變的特異性引物組成，所述野生型和突變型的特異性引物分別為：針對T107C?SNP位點的SEQ?ID?NO.7及SEQ?ID?NO.8、針對G232A?SNP位點的SEQ?IDNO.9及SEQ?ID?NO.10、和/或針對A190C?SNP位點的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12；所述tag序列選自SEQ?ID?NO.1-6；

(B).有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti-tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.13～SEQ?ID?NO.18中的序列，且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對；

(C).用于擴增出需要檢測的、具有相應SNP位點的目標序列的引物。

2.根據權利要求1所述的STK39基因SNP檢測液相芯片，其特征是，所述擴增引物為：針對T107C?SNP位點的SEQ?ID?NO.19及SEQ?ID?NO.20、針對G232A?SNP位點的SEQ?ID?NO.21及SEQ?ID?NO.22、和/或針對A190C?SNP位點的SEQ?ID?NO.23及SEQ?ID?NO.24。

3.根據權利要求1所述的STK39基因SNP檢測液相芯片，其特征是，所述ASPE引物為：由SEQID?NO.1和SEQ?ID?NO.7組成的序列及由SEQ?ID?NO.2和SEQ?ID?NO.8組成的序列、由SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.9組成的序列及由SEQ?ID?NO.4和SEQ?ID?NO.10組成的序列、和/或由SEQ?ID?NO.5和SEQ?ID?NO.11組成的序列及由SEQ?ID?NO.6和SEQ?ID?NO.12組成的序列。

4.根據權利要求1所述的STK39基因SNP檢測液相芯片，其特征是，主要包括以下成份：

(A).所述ASPE引物為：由SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.7組成的序列及由SEQ?ID?NO.2和SEQID?NO.8組成的序列、由SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.9組成的序列及由SEQ?ID?NO.4和SEQ?ID?NO.10組成的序列、和由SEQ?ID?NO.5和SEQ?ID?NO.11組成的序列及由SEQ?ID?NO.6和SEQ?ID?NO.12組成的序列；

(B).有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti-tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.13～SEQ?ID?NO.18中的序列，且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對；

(C).所述擴增引物為：針對T107C?SNP位點的SEQ?ID?NO.19及SEQ?ID?NO.20、針對G232A?SNP位點的SEQ?ID?NO.21及SEQ?ID?NO.22、和針對A190C?SNP位點的SEQ?ID?NO.23及SEQ?IDNO.24。

5.根據權利要求1-4任一項所述的STK39基因SNP檢測液相芯片，其特征是，所述間隔臂為5-10個T。

6.一種用于STK39基因SNP檢測的特異性引物，其特征是，包括有：針對T107C?SNP位點的SEQ?ID?NO.7及SEQ?ID?NO.8、針對G232A?SNP位點的SEQ?ID?NO.9及SEQ?ID?NO.10、和/或針對A190C?SNP位點的SEQ?ID?NO.11及SEQ?ID?NO.12。