[發明專利]豬PSMA1基因中一個可用于溯源的SNP分子標記及其檢測方法無效
| 申請號: | 201010282912.4 | 申請日: | 2010-09-16 |
| 公開(公告)號: | CN102399775A | 公開(公告)日: | 2012-04-04 |
| 發明(設計)人: | 吳瀟;唐雪明;張小波;趙凱;朱宏;譚芙蓉;蔣玲曦;王金斌;陶世如 | 申請(專利權)人: | 上海市農業科學院 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海開祺知識產權代理有限公司 31114 | 代理人: | 費開逵 |
| 地址: | 201106 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | psma1 基因 一個 用于 溯源 snp 分子 標記 及其 檢測 方法 | ||
1.豬PSMA1基因的DNA片段,其序列如SEQ?ID?NO?1所示,其第30位堿基處有一個堿基突變30A→30G。
2.根據權利要求1所述的豬PSMA1基因的DNA片段,其編碼的氨基酸序列如SEQ?ID?NO?2所示。
3.根據權利要求1所述的豬PSMA1基因的DNA片段,其特征在于,所DNA片段共1487bp,其包含部分第六外顯子、第八外顯子的序列,完整的第七外顯子,第六內含子和第七內含子序列。
4.分離權利要求1至3任一項所述的PSMA1基因的DNA片段的正、反向引物,其堿基序列如SEQ?ID?NO?5和SEQ?ID?NO?6所示。
5.一種SNP分子標記,位于權利要求1至3任一項所述的豬PSMA1基因的DNA片段中,其序列如SEQ?ID?NO?3所示。
6.根據權利要求5所述的SNP分子標記,其編碼的氨基酸序列如SEQ?IDNO?4所示。
7.根據權利要求5所述的SNP分子標記,其特征在于,所述SNP分子標記的第30位堿基處有一個堿基突變30A→30G。
8.根據權利要求5所述的SNP分子標記,其特征在于,所述SNP分子標記的第263位有一等位基因A或G。
9.根據權利要求5所述的SNP分子標記,其特征在于,所述SNP分子標記的第27位有一等位基因G。
10.權利要求5所述的SNP分子標記的檢測方法,其特征在于,采用PCR-BfaI-RFLP方法進行,具體包括以下步驟:
(1)構建豬的DNA池;
(2)設計正、反引物分離豬PSMA1基因的DNA片段,測序并分析;
(3)突變位點檢測的正、反引物的重新設計及檢測方法的建立;
(4)采集豬的9個品種或品系的耳組織樣,共計204個個體;
(5)檢測SNP標記在試驗群體的分布,篩選適用于豬肉產品溯源的SNP標記。
11.根據權利要求10所述的檢測方法,其特征在于,突變位點檢測的正、反向引物的序列分別如SEQ?ID?NO?5和SEQ?ID?NO?7所示。
12.權利要求5所述的SNP分子標記用于豬肉產品的DNA溯源。
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