[發明專利]一種檢測黃牛MGAT2基因單核苷酸多態性的方法

無效

• 申請號: 201010236902.7
• 申請日: 2010-07-26
• 公開（公告）號: CN101921848A
• 公開（公告）日: 2010-12-22
• 發明（設計）人: 陳宏;屈煉;楊明娟;劉俊霞;藍賢勇;雷初朝
• 申請（專利權）人: 西北農林科技大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 西安通大專利代理有限責任公司 61200
• 代理人: 陸萬壽

技術領域

本發明屬于分子遺傳學領域，涉及基因單核苷酸多態性(SNP)的檢測，特別涉及一種檢測黃牛MGAT2基因單核苷酸多態性的方法。

背景技術

基因多態性是指不同物種或者同一物種內的不同個體間基因組序列的差異，這些差異是由于染色體中DNA等位基因中核苷酸改變引起，主要是包括堿基的替換、插入、缺失以及重復序列拷貝數的變化。

單核苷酸多態性(Single?Nucleotide?Polymorphism，SNP)是由美國麻省理工學院的人類基因組研究中心的學者Lander(1996)提出的一類遺傳標記系統，就是指基因組DNA序列中由于單個核苷酸(A/T/C/G)的替換而引起的多態性。它的變異形式有：顛換、轉換、插入和缺失等，主要由單個堿基的轉換或者顛換所引起。具有轉換型的堿基變異的SNPs約占2/3。

根據基因組中單核苷酸多態性產生的位置，可分為以下3類：基因編碼區單核苷酸多態性(Coding-region?SNPs，cSNPs)、基因周邊單核苷酸多態性(Perigenic?SNPs，pSNPs)以及基因間單核苷酸多態性(Intergenic?SNPs，iSNPs)。

研究表明，位于編碼區內的cSNP比較少，由于它在遺傳性疾病研究中卻具有重要意義，因此，編碼區內的cSNP的研究更受關注。基因編碼區內的cSNP又可分為2種：一種是編碼區內的同義cSNP(Synonymous?cSNP)，即SNP所致編碼序列的改變并不會影響其所翻譯的蛋白質中氨基酸序列的改變；另一種是編碼區內的非同義cSNP(Non-Synonymous?cSNP)，即堿基序列的改變將導致編碼氨基酸的改變，從而導致蛋白質中氨基酸序列的改變，可能最終影響到蛋白質的功能。

分子育種，即分子標記輔助選擇育種(Molecular?Mark-Assist?Selection，?MAS)，該技術是借助DNA分子標記對遺傳資源或育種材料進行選擇，對畜禽的綜合性狀進行品種改良，它是利用現代分子生物學和傳統遺傳育種相結合的方法，進行新品種選育。在肉牛育種中，人們期望，通過對生長性狀密切相關，并且與數量性狀緊密連鎖的DNA標記的選擇，達到早期選種和提高育種值準確性的目的，從而在畜禽育種中獲得更大的遺傳進展。

分子遺傳標記輔助選擇就是將現代生物技術與常規選擇方法相結合，通過對遺傳標記的選擇來間接選擇控制某性狀的數量性狀位點(QTL)，使之能夠同時利用標記位點信息和數量性狀的表型信息，更準確估計動物個體的育種值，提高選擇效率，加快育種進展。標記輔助選擇主要經歷了三個階段：第一階段是家畜各性狀間的遺傳分析；第二階段是蛋白質(酶)標記對數量性狀的標記階段；第三個階段是分子遺傳標記階段。隨著分子標記技術日漸成熟與豐富，使覆蓋整個基因組的標記成為可能，通過與QTL間的連鎖分析，實現分子標記輔助選擇的目標。單核苷酸多態性(single?nucleotidepolymorphism，SNP)作為新的遺傳標記已廣泛應用于基因定位、克隆、遺傳育種及多樣性的研究。

MGAT2基因是脂肪沉積過程中合成二酰甘油(DAG)的重要基因。食物中的脂肪要進入體內，必須在胰脂肪酶的作用下發生水解，水解的代謝產物脂肪酸、2-單酰甘油在單酰甘油轉移酶(MGAT)的催化作用下再合成DAG，進而被二酰甘油轉移酶(DGAT)催化合成三酰甘油(TAG)而儲存在體內。MGAT催化合成DAG，是合成TAG的第一步，因而在一定程度上MGAT決定了食物中的脂肪能否被機體所吸收，此外，MGAT催化合成的DAG是合成磷脂的前體，同時，DAG還是細胞內重要的信號分子。總之，MGAT2基因與脂肪代謝、脂類在組織中的沉積以及細胞內的信號轉導密切相關，因此，研究中國地方黃牛MGAT2基因的遺傳變異和分子遺傳特征具有重要的理論和實踐意義。

目前，對于MGAT2基因的研究多在小鼠和人類上，并主要對其功能進行了大量研究。中國地方黃牛MGAT2基因遺傳變異領域的研究匱乏，該基因位點的功能研究及其遺傳變異與經濟性狀(如：體重、日增重等性狀)關聯的研究仍是空白。

發明內容

本發明解決的問題在于提供一種檢測的黃牛MGAT2基因單核苷酸多態性的方法，尋找與經濟性狀關聯的SNP作為分子標記，加快具有優質經濟性狀黃牛種群的建立。

本發明是通過以下技術方案來實現：