[發(fā)明專利]一種PCR微陣列檢測多種流感病毒的試劑盒有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201010229512.7 | 申請日: | 2010-07-16 |
| 公開(公告)號: | CN102337352A | 公開(公告)日: | 2012-02-01 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 李明;陳華云;高秀潔 | 申請(專利權(quán))人: | 中山大學(xué)達(dá)安基因股份有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64;C12N15/11 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 510665 廣東省廣*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 pcr 陣列 檢測 多種 流感病毒 試劑盒 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及一種PCR微陣列檢測多種流感病毒的試劑盒,該試劑盒利用實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)結(jié)合微陣列方法,能在同一個(gè)反應(yīng)板上同時(shí)進(jìn)行多種流感病毒核酸檢測.。
背景技術(shù)
流行性感冒病毒,簡稱流感病毒,是一種造成人類及動(dòng)物患流行性感冒的RNA病毒,屬于正黏液病毒科。流感病毒侵襲的目標(biāo)是呼吸道粘膜上皮細(xì)胞,感染后會造成急性上呼吸道感染,是高度接觸傳染性的群發(fā)性呼吸道疾病,嚴(yán)重時(shí)可累及心肺等人體重要器官。由于流感病毒可經(jīng)由空氣傳播,且會引起大范圍的流行,尤其是在免疫力低下的人群中會引起嚴(yán)重癥狀,如肺炎,心力衰竭等。臨床以突發(fā),高熱,咳嗽,呼吸困難,衰竭,高發(fā)病率,低死亡率為主要特征。
根據(jù)流感病毒感染的對象,將病毒分為人類流感病毒,豬流感病毒,禽流感病毒等類群。其中人類流感病毒根據(jù)其病毒核蛋白的抗原性分為甲型流感病毒、乙型流感病毒和丙型流感病毒,又稱A型、B型、C型流感病毒。甲型流感病毒根據(jù)其核蛋白抗原的不同分為H1~H15共15個(gè)亞型,人類對15個(gè)亞型中的H1和H3亞型易感。禽流感病毒屬于甲型流感病毒,世界各地爆發(fā)的禽流感主要由高致病性的H5、H7、H9三種亞型引起的。2009年爆發(fā)的甲型H1N1流感是由甲型H1N1流感病毒引起的。流感的爆發(fā)已有百年的歷史,每次流感疫情均給經(jīng)濟(jì)發(fā)展和公共衛(wèi)生帶來巨大的損失,因此建立快速檢測流感病毒的診斷技術(shù)是預(yù)防和控制該疾病流行的一個(gè)重要保障。
目前,作為檢測流感病毒的方法主要有以下幾種:(1)病毒分離鑒定。采用雞胚和/或MDCK細(xì)胞進(jìn)行流感病毒分離。樣本制成懸液接種于10~11日齡雞胚尿囊腔,48h后收集尿囊液,可再以MDCK細(xì)胞培養(yǎng)以收獲病毒培養(yǎng)液或進(jìn)行滴度鑒定。該方法檢測時(shí)間長且對操作者要求比較高;(2)血清學(xué)方法,也是病毒鑒定的常規(guī)手段,通過血清學(xué)鑒定來判斷病毒的種屬和亞型。但實(shí)驗(yàn)過程中常受到非特異性凝集因素、抗體特異性等方面干擾,對抗原的標(biāo)準(zhǔn)化、單克隆抗體制備技術(shù)等方面提出更嚴(yán)格的要求。(3)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)檢測方法,具有簡便、快速、靈敏度高、特異性好等優(yōu)點(diǎn),可廣泛應(yīng)用于流感病毒的核酸檢測。針對特異性序列位點(diǎn)設(shè)計(jì)引物和探針,可同時(shí)檢測多種病毒核酸,滿足高通量快速檢測的需求。
PCR微陣列反應(yīng)是利用實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)結(jié)合微陣列的方法來檢測多種病毒,可以滿足高通量,快速檢測的要求。具體的來說,在96或384孔板的各孔中分別加入不同病毒核酸特異性引物和熒光探針制成PCR微陣列反應(yīng)板,使用時(shí)每孔加入等量的PCR反應(yīng)液,再將病毒核酸樣本加入反應(yīng)體系中,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。在同一反應(yīng)條件下同時(shí)進(jìn)行多管PCR反應(yīng),可同時(shí)實(shí)現(xiàn)多種病毒核酸的高通量檢測。除此之外,每一種待檢的病毒分別設(shè)置陽性和陰性質(zhì)控品,進(jìn)行質(zhì)量控制和環(huán)境監(jiān)控。按照合理有序,96或384孔板上的排列方式依照不易污染且易于操作的原則。PCR微陣列一次性可檢測多種病毒,尤其當(dāng)需要對臨床癥狀相近病原體進(jìn)行鑒別或?qū)νN屬病原體分型時(shí),PCR微陣列方法可迅速確定病原體,從而節(jié)省了在數(shù)據(jù)分析方面所花費(fèi)的時(shí)間,在更短的時(shí)間內(nèi)得到多種病毒核酸檢測的數(shù)據(jù)信息。在流感病毒的鑒別診斷和監(jiān)控方面,尤其針對流感疫情病原體快速排查,該技術(shù)將發(fā)揮巨大優(yōu)勢。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的在于提供一種PCR微陣列方法檢測多種流感病毒的試劑盒,該試劑盒可以同時(shí)檢測包括甲型流感病毒、乙型流感病毒、季節(jié)性流感病毒H1亞型、H3亞型、甲型H1N1流感病毒、高致病性禽流感病毒H5亞型、H7亞型、H9亞型8種流感病毒。
本發(fā)明在對GENBANK上所有已知的流感病毒核酸序列進(jìn)行比對的基礎(chǔ)上,尋找待檢流感病毒核酸序列的特異性保守區(qū),并針對保守區(qū)設(shè)計(jì)各病毒靶多核苷酸引物和探針。這些引物探針在含有逆轉(zhuǎn)錄酶、高質(zhì)量的脫氧核糖核苷三磷酸(dNTPs)以及Mg2+等的PCR反應(yīng)液中,通過熒光PCR儀實(shí)現(xiàn)體外核酸的循環(huán)擴(kuò)增,從而達(dá)到一次性快速檢測多種流感病毒核酸的目的。
本發(fā)明所涉及的試劑盒中主要包括:1)PCR微陣列反應(yīng)板、PCR反應(yīng)液,2)分隔并集中包裝這些試劑瓶或管的包裝盒。
本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案是PCR微陣列反應(yīng)板由PCR反應(yīng)板以及加在各反應(yīng)孔中的引物探針混合液所組成,其中PCR反應(yīng)板可選擇市售的96孔PCR反應(yīng)板或384孔板PCR反應(yīng)板,如Bioplastic公司產(chǎn)品。
本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案,引物探針混合液包括引物和探針,其中引物終濃度均為0.2mmol/L,探針終濃度均為0.1mmol/L。
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