[發明專利]一種良種奶山羊多基因聚合的選育方法

無效

• 申請號: 201010199486.8
• 申請日: 2010-06-12
• 公開（公告）號: CN101845506A
• 公開（公告）日: 2010-09-29
• 發明（設計）人: 曹斌云;安小鵬;李廣;侯金星;王建剛;宋宇軒;楊明明;朱廣琴;王韻斐;崔易虹;陳秋菊
• 申請（專利權）人: 西北農林科技大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 西安恒泰知識產權代理事務所 61216
• 代理人: 李鄭建

技術領域

本發明屬于分子遺傳學領域，具體涉及一種良種奶山羊多基因聚合的選育方法，該方法應用PCR-SSCP和DNA測序技術檢測被檢個體催乳素受體(PRLR)基因和促黃體素beta亞基(LHβ)基因的單鏈DNA堿基突變多態性，通過分析高產奶山羊個體(F1代)多態性與產羔數的關系確定適宜的分子標記，分析高產奶山羊個體(F1)的不同基因型組合與產羔數之間的關系，并上溯親代(F0代)，跟蹤子代(F2代)，檢測母羊個體的基因型組合與產羔數的關系，研究不同基因型在多胎性狀形成中的貢獻率，然后挑選高產個體的基因型組合，分析高產個體基因型組合形成的選配方式，再應用這些選配方式形成奶山羊多羔的多基因聚合良種核心群。

背景技術

多胎性狀的選育是奶山羊育種的重要目標之一，多胎性狀是由微效多基因決定的數量性狀，遺傳力很低(約為0.23左右)，常規育種手段在較短時期內難以取得明顯進展，這在很大程度上限制了我國奶山羊養殖業的發展。隨著動物基因組學的發展，大量的DNA分子標記已被開發和應用，動物基因組圖譜繪制逐步完善，越來越多的具有重要經濟意義的功能基因相繼被挖掘出來，與山羊繁殖性狀緊密相關的研究也取得很大進展。基因聚合(Genepyramiding)是通過基因工程手段，將分散在不同品種或品系中的優良基因通過雜交、回交、復合雜交等手段聚合到同一個品種中。畜禽的大部分經濟性狀具有加性效應，基因表達呈累加作用，即集中到一個品種中的同效基因越多表達越充分。目前，國內外關于羊分子育種的研究主要集中在羊的分子標記檢測及其與性狀的相關性方面，對于基因聚合育種技術大多數仍然僅停留于概念上，對其理論的研究相對滯后。

單核苷酸多態性(Single?Nucleotide?Polymorphisms，SNP)就是指基因組DNA序列中由于單個核苷酸(A/T/C/G)的替換而引起的多態性。SNPs可以是兩個或多個等位基因的多態，因此，通常所說的SNPs包括堿基的插入、缺失、插入/缺失以及重復序列拷貝數的變化。一個SNP表示在基因組某個位點上有一個核苷酸的變化，主要由單個堿基的轉換(以一種嘧啶置換另一種嘧啶或一種嘌呤置換另一種嘌呤)以及顛換(嘌呤與嘧啶互換)所引起。具有顛換型變異的SNPs約占2/3，其他幾種SNP在相似的水平上，因為CpG(核苷酸對，其中G在DNA鏈中緊隨C后)二核苷酸的胞嘧啶是基因組中最易發生突變的位點，其中大多數是甲基化的，可自發地脫去氨基而形成胸腺嘧啶。在任何已知或未知的基因內或附近都可能找到數量不等的SNPs，根據它們在基因組中分布的位置可分為基因編碼區SNPs(cSNPs)、基因周邊SNPs(pSNPs)和基因間SNPs(iSNPs)等三類?？偟恼f來，cSNP比較少，因為在編碼區內的變異率僅占有周圍序列的1/5，但它在遺傳病和育種的研究中卻具重要意義，因此倍受關注。根據對遺傳性狀的影響，cSNPs又可分為兩種：一種是同義cSNPs，即SNP所致編碼序列的改變并不影響其所翻譯的氨基酸序列，突變堿基與未突變堿基的“含義”相同；另一種是非同義cSNPs，即堿基序列的改變將導致編碼氨基酸的改變從而產生蛋白質序列的改變，可能最終影響到蛋白質的功能。因此，對編碼區SNPs的非同義突變來說，它們可能對基因功能有直接的重要影響，尤其對于編碼區突變來說，更可能會導致所編碼的蛋白發生重大變化，從而影響它的功能的發揮?；蛐蛄猩蠅A基的插入/缺失突變，同樣將導致所編碼氨基酸的改變從而產生蛋白質序列改變，以致影響到蛋白的生物學功能，從而造成對個體的表現型具有重要影響。不僅如此，在群體遺傳研究中，這些SNPs作為遺傳標記在群體遺傳和生物進化的研究中也具有重要意義。