[發明專利]染色體9p21區段和KIF6基因SNP檢測液相芯片以及特異性引物有效
| 申請號: | 201010196841.6 | 申請日: | 2010-06-08 |
| 公開(公告)號: | CN102031286A | 公開(公告)日: | 2011-04-27 |
| 發明(設計)人: | 許嘉森;秦會娟;余剛;曾濤 | 申請(專利權)人: | 廣州益善生物技術有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224 | 代理人: | 萬志香;曾旻輝 |
| 地址: | 510663 廣東省廣州市廣州科*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 染色體 p21 區段 kif6 基因 snp 檢測 芯片 以及 特異性 引物 | ||
1.一種染色體9p21區段SNP檢測液相芯片,其特征是,主要包括有:
(A)針對染色體9p21區段的SNP位點設計的野生型和突變型的ASPE引物對,每條ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對SNP位點的特異性引物組成,所述特異性引物是:針對染色體9p21區段G22115503C?SNP的SEQ?ID?NO.17和SEQ?ID?NO.18、A22086055G?SNP的SEQ?ID?NO.19和SEQ?ID?NO.20、A22114477G?SNP的SEQ?ID?NO.21和SEQ?ID?NO.22、A22105026G?SNP的SEQ?ID?NO.23和SEQ?ID?NO.24、A22105959G?SNP的SEQ?ID?NO.25和SEQ?ID?NO.26、和/或A22088619G?SNP的SEQ?ID?NO.27和SEQ?ID?NO.28;所述tag序列選自SEQ?ID?NO.1~SEQ?ID?NO.14;
(B)分別包被有特異的anti-tag序列的、具有不同顏色編碼的微球,所述anti-tag序列選自SEQID?NO.29~SEQ?ID?NO.42中的序列,且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對,且所述anti-tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列;
(C)用于擴增具有G22115503C、A22086055G、A22114477G、A22105026G、A22105959G和/或A22088619G?SNP位點的染色體9p21區段目標序列的擴增引物。
2.根據權利要求1所述的染色體9p21區段SNP檢測液相芯片,其特征是,所述擴增引物為:針對G22115503C?SNP位點的SEQ?ID?NO.45和SEQ?ID?NO.46、針對A22086055G?SNP位點的SEQ?ID?NO.47和SEQ?ID?NO.48、針對A22114477G?SNP位點的SEQ?ID?NO.49和SEQ?ID?NO.50、針對A22105026G?SNP位點的SEQ?ID?NO.51和SEQ?ID?NO.52、針對A22105959G?SNP位點的SEQ?ID?NO.53和SEQ?ID?NO.54、和/或針對A22088619G?SNP位點的SEQ?ID?NO.55和SEQ?IDNO.56。
3.根據權利要求1所述的染色體9p21區段SNP檢測液相芯片,其特征是,所述ASPE引物對為:由SEQ?ID?NO.3和SEQ?ID?NO.17組成的序列以及由SEQ?IDNO.4和SEQID?NO.18組成的序列、由SEQ?ID?NO.5和SEQ?ID?NO.19組成的序列以及由SEQ?ID?NO.6和SEQID?NO.20組成的序列、由SEQ?ID?NO.7和SEQ?ID?NO.21組成的序列以及由SEQ?ID?NO.8和SEQID?NO.22組成的序列、由SEQ?ID?NO.9和SEQ?ID?NO.23組成的序列以及由SEQ?ID?NO.10和SEQ?ID?NO.24組成的序列、由SEQ?1D?NO.11和SEQ?ID?NO.25組成的序列以及由SEQ?ID?NO.12和SEQ?ID?NO.26組成的序列、和/或由SEQ?ID?NO.13和SEQ?ID?NO.27組成的序列以及由SEQID?NO.14和SEQ?ID?NO.28組成的序列。
4.根據權利要求1-3任一項所述的染色體9p21區段SNP檢測液相芯片,其特征是,所述間隔臂為5-10個T。
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