[發(fā)明專利]檢測(cè)SLC26A4基因c.232T>C突變的試劑盒無(wú)效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201010180608.9 | 申請(qǐng)日: | 2010-05-21 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN101838698A | 公開(kāi)(公告)日: | 2010-09-22 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 郭玉芬;王艷莉 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 蘭州大學(xué) |
| 主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 蘭州中科華西專利代理有限公司 62002 | 代理人: | 李艷華 |
| 地址: | 730000 *** | 國(guó)省代碼: | 甘肅;62 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 檢測(cè) slc26a4 基因 232 突變 試劑盒 | ||
1.一種檢測(cè)SLC26A4基因c.232T>C突變的試劑盒,包括
——針對(duì)SLC26A4基因或SLC26A4基因編碼區(qū)第232位堿基附近設(shè)計(jì)的PCR引物;
——PCR反應(yīng)試劑;
——檢測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的試劑。
2.如權(quán)利要求1所述的檢測(cè)SLC26A4基因c.232T>C突變的試劑盒,其特征在于:所述PCR引物為15~30個(gè)堿基,GC含量為45~50%。
3.如權(quán)利要求2所述的檢測(cè)SLC26A4基因c.232T>C突變的試劑盒,其特征在于:所述PCR引物中
上游引物為SLC26A4-3F:5’-GGCAAAAGCATGGTAAGCAC-3’;
下游引物為SLC26A4-3R:5’-AGGGTAAGCAACCATCTGTCA-3’。
4.如權(quán)利要求1所述的檢測(cè)SLC26A4基因c.232T>C突變的試劑盒,其特征在于:所述PCR反應(yīng)試劑為2.5μl、含15ml?MgCl2的10×PCR緩沖液,2.0μl、2.5mM的dNTP,0.3μl、5U/μl的耐熱聚合酶,0.25μl熒光染料。
5.如權(quán)利要求1所述的檢測(cè)SLC26A4基因c.232T>C突變的試劑盒,其特征在于:所述檢測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的試劑為測(cè)序檢測(cè)試劑、限制性內(nèi)切酶酶切檢測(cè)試劑、限制性長(zhǎng)度多態(tài)性檢測(cè)試劑、序列特異性引物檢測(cè)試劑或雜交探針檢測(cè)試劑中的任意一種。
6.如權(quán)利要求1所述的檢測(cè)SLC26A4基因c.232T>C突變的試劑盒在檢測(cè)前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大相關(guān)的位于SLC26A4基因的232位突變中的應(yīng)用,包括以下步驟:
(1)采集待測(cè)個(gè)體的血液、體液或組織樣本,提取基因組DNA;
(2)以所述DNA為模板,采用所述PCR引物進(jìn)行PCR反應(yīng),得到PCR擴(kuò)增產(chǎn)物:
SLC26A4-3F:5’-GGCAAAAGCATGGTAAGCAC-3’
SLC26A4-3R:5’-AGGGTAAGCAACCATCTGTCA-3’;
(3)將所述PCR擴(kuò)增產(chǎn)物純化后進(jìn)行直接測(cè)序,并將測(cè)序結(jié)果與SLC26A4基因標(biāo)準(zhǔn)序列進(jìn)行比較,確定是否存在SLC26A4基因的c.232T>C突變位點(diǎn);
(4)判斷待測(cè)個(gè)體是否為SLC26A4基因突變c.232T>C導(dǎo)致的前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大。
7.如權(quán)利要求6所述的檢測(cè)SLC26A4基因c.232T>C突變的試劑盒在檢測(cè)前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大相關(guān)的位于SLC26A4基因的232位突變中的應(yīng)用,其特征在于:該應(yīng)用還包括按照正常閱讀框架進(jìn)行翻譯以確定c.232T>C突變,使得位于Pendrin氨基端的第78位極性中性酪氨酸變?yōu)閴A性組氨酸。
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