[發明專利]BRAF基因突變檢測特異性引物和液相芯片有效
| 申請號: | 201010160760.0 | 申請日: | 2010-04-23 |
| 公開(公告)號: | CN102234684A | 公開(公告)日: | 2011-11-09 |
| 發明(設計)人: | 許嘉森;李國強;余剛;秦會娟 | 申請(專利權)人: | 廣州益善生物技術有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224 | 代理人: | 萬志香;曾旻輝 |
| 地址: | 510663 廣東省廣州市廣州科*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | braf 基因突變 檢測 特異性 引物 芯片 | ||
1.一種BRAF基因突變檢測液相芯片,其特征是,主要包括有,
(A)針對BRAF的V600E突變位點,分別設計的野生型和突變型ASPE引物對:每種ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對目的基因突變位點的特異性引物組成,所述tag序列選自SEQ?IDNO.25~SEQ?ID?NO.30中的任2條序列;所述特異性引物是來源于SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.2或其反向互補序列中的堿基序列,且特異性引物的3’端的最后3位堿基中的一個堿基為突變位點,所述特異性引物的Tm值在52~58℃之間;
(B)分別包被有特異的anti-tag序列的、具有不同顏色編碼的2種微球,所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.31~SEQ?ID?NO.36中的序列,且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對;
(C)用于擴增具有V600E突變位點的BRAF基因目標序列的擴增引物。
2.根據權利要求1所述的BRAF基因突變檢測液相芯片,其特征是,所述擴增引物為SEQ?IDNO.37和SEQ?ID?NO.38。
3.根據權利要求1所述的BRAF基因突變檢測液相芯片,其特征是,所述野生型的特異性引物為SEQ?ID?NO.3~SEQ?ID?NO.7中的一條,所述突變型的特異性引物為SEQ?ID?NO.8~SEQID?NO.12中的一條;或所述野生型的特異性引物為SEQ?ID?NO.15~SEQ?ID?NO.19中的一條,所述突變型的特異性引物為SEQ?ID?NO.20~SEQ?ID?NO.24中的一條。
4.根據權利要求1-3任一所述的BRAF基因突變檢測液相芯片,其特征是,所述tag序列為SEQID?NO.25和SEQ?ID?NO.26。
5.根據權利要求1-3任一所述的BRAF基因突變檢測液相芯片,其特征是,所述anti-tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列。
6.根據權利要求5任一所述的BRAF基因突變檢測液相芯片,其特征是,所述間隔臂序列為5-10個T。
7.用于BRAF基因V600E突變檢測的特異性引物,其特征是,所述特異性引物是來源于SEQID?NO.1和SEQ?ID?NO.2或其反向互補序列中的堿基序列,且特異性引物的3’端的最后3位堿基中的一個堿基為突變位點,所述特異性引物的Tm值在52~58℃之間。
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