[發明專利]一種同時檢測32個單核苷酸多態性位點基因型的方法無效
| 申請號: | 201010100715.6 | 申請日: | 2010-01-26 |
| 公開(公告)號: | CN101851672A | 公開(公告)日: | 2010-10-06 |
| 發明(設計)人: | 田亞平;張陽東 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍總醫院 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京君智知識產權代理事務所 11305 | 代理人: | 鄭明 |
| 地址: | 100853*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 同時 檢測 32 核苷酸 多態性 基因型 方法 | ||
1.一種同時檢測32個單核苷酸多態性位點的方法,這些基因及32個標簽單核苷酸多態性位點是內收蛋白1基因:rs3775067、rs1263359,血小板內皮細胞黏附分子-1基因:rs503550,C-反應蛋白基因:rs1205,內皮固有型一氧化氮合酶基因:rs7830、rs3918188,漿細胞膜糖蛋白1基因:rs12528076、rs858341、rs021966、rs858345、rs9308995,L-選擇素基因:rs964555、rs2205848、rs4987318、rs2298900,G蛋白β3亞單位基因:rs5445,血管緊張素I轉換酶基因:rs4333、rs4305、rs4353,血管緊張素II?1型受體基因:rs6801836、rs2675511、rs5182,血管緊張素原基因:rs1926722、rs7539020、rs3889728、rs493132、rs478523,亞甲基四氫葉酸還原酶基因:rs1801133、rs9651118、rs6541003和肝脂肪酶基因:rs12462668、rs10426971,其特征在于檢測方法包括下述步驟:
(1)設計并合成用于擴增32個單核苷酸多態性位點的序列1至序列96引物,每個單核苷酸多態性設計3個引物,其中2個為PCR擴增引物,用于擴增出含有目的單核苷酸多態性位點的片斷;1個為延伸引物,用于單核苷酸多態性位點的測序及與玻璃芯片上的寡核苷酸鏈雜交;
(2)稀釋并混合PCR引物,對目標DNA進行PCR擴增;
(3)對擴增產物進行純化;
(4)稀釋并混合延伸引物,進行延伸反應;
(5)雜交;
(6)對雜交板進行熒光掃描,根據熒光信號判斷單核苷酸多態性位點的基因型。
2.根據權利要求1所述的一種同時檢測32個單核苷酸多態性位點的方法,其特征在于所述的步驟(2)中將PCR引物稀釋并混合使其終濃度為2.5μM,構建PCR引物池,每96人份PCR反應體系為:
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試劑成分?????????????體積(μL)
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引物池(2.5μL)???????11.2
脫氧核苷酸(2.5mM)????20
10倍PCR緩沖液II??????56.2
氯化鎂(25mM)?????????112.6
金牌擴增酶(5U/μL)???11.2
雙蒸水???????????????126????
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3.根據權利要求1所述的一種同時檢測32個單核苷酸多態性位點的方法,其特征在于所述的步驟(2)中PCR循環條件為:
4.根據權利要求1所述的一種同時檢測32個單核苷酸多態性位點的方法,其特征在于所述的步驟(4)中將延伸引物稀釋并混合使其終濃度為5μM,構建延伸引物池。每96人份PCR反應體系為:
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